More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_1671 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  100 
 
 
251 aa  494  1e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  51.98 
 
 
268 aa  246  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  43.78 
 
 
260 aa  221  9.999999999999999e-57  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  45.63 
 
 
254 aa  219  1.9999999999999999e-56  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  47.37 
 
 
252 aa  218  5e-56  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  48.57 
 
 
258 aa  218  6e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  43.37 
 
 
259 aa  218  8.999999999999998e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
252 aa  202  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  36.33 
 
 
253 aa  202  6e-51  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  47.15 
 
 
258 aa  200  1.9999999999999998e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  45.93 
 
 
337 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  42.28 
 
 
260 aa  197  1.0000000000000001e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  39.92 
 
 
263 aa  195  5.000000000000001e-49  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  45.67 
 
 
262 aa  194  1e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  42.86 
 
 
251 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 
247 aa  173  2.9999999999999996e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  41.04 
 
 
250 aa  171  1e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  44.24 
 
 
257 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  33.49 
 
 
263 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  34.38 
 
 
279 aa  107  3e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  34.84 
 
 
268 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 
258 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
263 aa  94.4  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  35.75 
 
 
262 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  38.18 
 
 
246 aa  92  9e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
263 aa  90.1  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.33 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.95 
 
 
236 aa  88.6  9e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
244 aa  87  3e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.8 
 
 
264 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  46.73 
 
 
225 aa  81.6  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  23.77 
 
 
273 aa  80.5  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 
276 aa  78.2  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  36.21 
 
 
255 aa  76.6  0.0000000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.15 
 
 
267 aa  75.5  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43.43 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.02 
 
 
237 aa  74.7  0.000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  45.54 
 
 
269 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4427  methyltransferase type 11  37.33 
 
 
273 aa  73.9  0.000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.799504 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1886  Methyltransferase type 11  39.85 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.187674  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.84 
 
 
291 aa  73.2  0.000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.65 
 
 
262 aa  73.2  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  35.37 
 
 
268 aa  72.4  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 
249 aa  72.4  0.000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2478  Methyltransferase type 11  44.76 
 
 
269 aa  72.4  0.000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  35.81 
 
 
268 aa  72  0.000000000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1981  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.020374  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  40.44 
 
 
236 aa  71.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.79 
 
 
253 aa  71.2  0.00000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3232  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  45.71 
 
 
240 aa  71.2  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.0251873 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  35.78 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  33.33 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2066  Methyltransferase type 11  48.94 
 
 
201 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.240565  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0537  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42.86 
 
 
235 aa  70.9  0.00000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.383652 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  35.05 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.63 
 
 
255 aa  70.1  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  35.52 
 
 
244 aa  69.7  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2989  Methyltransferase type 11  30 
 
 
270 aa  69.3  0.00000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000120063  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.74 
 
 
262 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2935  Methyltransferase type 11  36.55 
 
 
320 aa  69.3  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.47 
 
 
254 aa  69.3  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.79 
 
 
244 aa  68.9  0.00000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07360  2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase /demethylmenaquinone methyltransferase  39.68 
 
 
231 aa  68.9  0.00000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.065272 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.87 
 
 
225 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1898  methyltransferase type 11  47.87 
 
 
201 aa  68.6  0.00000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0160246  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3576  Methyltransferase type 11  42.64 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  42 
 
 
235 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.17 
 
 
258 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
225 aa  68.2  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3502  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
225 aa  68.6  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.0622401 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.97 
 
 
258 aa  67.4  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  43 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  45.26 
 
 
232 aa  67.4  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
262 aa  67  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.13 
 
 
224 aa  67.4  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  42.06 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  37.09 
 
 
215 aa  66.6  0.0000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  36.63 
 
 
238 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3270  Methyltransferase type 11  35.25 
 
 
324 aa  66.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.455173  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  43.93 
 
 
260 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  44.04 
 
 
276 aa  66.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.72 
 
 
231 aa  66.6  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.71 
 
 
266 aa  66.6  0.0000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  35.56 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  38.98 
 
 
244 aa  66.6  0.0000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
269 aa  66.6  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  36.11 
 
 
224 aa  66.2  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.78 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.03 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2188  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0336811  normal  0.321372 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  40.16 
 
 
267 aa  65.9  0.0000000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  37.39 
 
 
263 aa  65.5  0.0000000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.64 
 
 
236 aa  65.5  0.0000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.64 
 
 
238 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.47 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  32.38 
 
 
206 aa  65.5  0.0000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  28.27 
 
 
274 aa  65.5  0.0000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  34.86 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>