More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2002 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 		 258 aa  523  1e-148  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  91.47 
 
 		 258 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  75 
 
 		 261 aa  393  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  72.8 
 
 		 262 aa  384  1e-106  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  72.41 
 
 		 262 aa  382  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  71.15 
 
 		 261 aa  373  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  69.29 
 
 		 256 aa  370  1e-101  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  66.93 
 
 		 256 aa  351  7e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  65.35 
 
 		 256 aa  349  2e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  64.31 
 
 		 257 aa  332  5e-90  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  65.62 
 
 		 258 aa  331  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  63.67 
 
 		 272 aa  330  2e-89  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  63.67 
 
 		 258 aa  328  4e-89  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  63.28 
 
 		 258 aa  326  3e-88  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  71.56 
 
 		 221 aa  322  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  71.63 
 
 		 253 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  60.47 
 
 		 253 aa  298  4e-80  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.29 
 
 		 258 aa  272  4.0000000000000004e-72  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.53 
 
 		 256 aa  260  2e-68  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.92 
 
 		 256 aa  259  2e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.51 
 
 		 259 aa  259  3e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.9 
 
 		 257 aa  258  1e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.57 
 
 		 258 aa  254  1.0000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.57 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.57 
 
 		 258 aa  253  2.0000000000000002e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.94 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.73 
 
 		 256 aa  252  4.0000000000000004e-66  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.53 
 
 		 260 aa  251  7e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.92 
 
 		 256 aa  249  3e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.33 
 
 		 260 aa  248  5e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.39 
 
 		 256 aa  247  1e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  53.33 
 
 		 258 aa  247  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.82 
 
 		 255 aa  244  8e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.61 
 
 		 256 aa  244  8e-64  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.82 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.82 
 
 		 255 aa  243  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.2 
 
 		 256 aa  242  3.9999999999999997e-63  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.48 
 
 		 257 aa  241  1e-62  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  50 
 
 		 257 aa  238  5e-62  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  77.24 
 
 		 201 aa  228  7e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  227  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  46.06 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  226  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.06 
 
 		 252 aa  226  4e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.67 
 
 		 252 aa  224  2e-57  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.67 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.92 
 
 		 268 aa  223  2e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  47.46 
 
 		 333 aa  220  1.9999999999999999e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.72 
 
 		 243 aa  219  3e-56  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.27 
 
 		 258 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.88 
 
 		 258 aa  211  1e-53  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.08 
 
 		 252 aa  203  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  45.6 
 
 		 269 aa  192  4e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  43.25 
 
 		 255 aa  188  5.999999999999999e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.53 
 
 		 258 aa  186  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.62 
 
 		 249 aa  184  9e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  39.45 
 
 		 258 aa  178  7e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.57 
 
 		 294 aa  177  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.34 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.69 
 
 		 268 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.62 
 
 		 255 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 		 255 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  41.9 
 
 		 250 aa  165  5e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.08 
 
 		 252 aa  165  5e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.94 
 
 		 264 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 		 254 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.16 
 
 		 265 aa  162  5.0000000000000005e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.38 
 
 		 262 aa  160  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.15 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.8 
 
 		 255 aa  159  3e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.92 
 
 		 287 aa  159  4e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  38.49 
 
 		 275 aa  158  8e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.86 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  37.16 
 
 		 280 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  38.22 
 
 		 275 aa  156  4e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  37.93 
 
 		 344 aa  155  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.39 
 
 		 253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.54 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  40.61 
 
 		 252 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.09 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.62 
 
 		 293 aa  149  3e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 		 255 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  35.97 
 
 		 307 aa  141  9.999999999999999e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.07 
 
 		 254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.65 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.35 
 
 		 255 aa  125  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.16 
 
 		 277 aa  112  6e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  28.29 
 
 		 247 aa  90.9  2e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 		 252 aa  89.7  4e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 268 aa  87.8  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 268 aa  86.7  4e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.57 
 
 		 263 aa  82.8  0.000000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  27.57 
 
 		 252 aa  77.8  0.0000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>