More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_02230 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  100 
 
 
224 aa  446  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 
209 aa  153  2e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  41.06 
 
 
210 aa  125  6e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  38.71 
 
 
228 aa  118  9e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  37.98 
 
 
215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  43.15 
 
 
219 aa  115  6.9999999999999995e-25  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
212 aa  114  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  38.32 
 
 
217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  38.78 
 
 
400 aa  112  4.0000000000000004e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  38.21 
 
 
217 aa  110  1.0000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
208 aa  107  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.41 
 
 
217 aa  105  7e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.13 
 
 
203 aa  101  9e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  38.56 
 
 
200 aa  99.4  4e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  39.05 
 
 
220 aa  98.6  6e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.49 
 
 
200 aa  97.8  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  41.38 
 
 
209 aa  96.7  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  34.41 
 
 
222 aa  95.9  4e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  34.74 
 
 
232 aa  95.5  6e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  32.02 
 
 
218 aa  88.2  1e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5571  methyltransferase  47.37 
 
 
121 aa  85.5  5e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.766224  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  36.42 
 
 
197 aa  85.5  6e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
210 aa  79.7  0.00000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.27 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  36.17 
 
 
224 aa  77.8  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4405  Methyltransferase type 11  38.65 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.432448  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  30.37 
 
 
222 aa  73.2  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  31.74 
 
 
235 aa  72.4  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  28.65 
 
 
238 aa  69.3  0.00000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.18 
 
 
252 aa  67.8  0.0000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  26.83 
 
 
196 aa  67.8  0.0000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  34.03 
 
 
236 aa  67.8  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 
208 aa  67.8  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  34.13 
 
 
251 aa  67.4  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  34.84 
 
 
214 aa  67  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
199 aa  67.4  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
236 aa  67  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
222 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0991  methyltransferase type 11  47.79 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  32.17 
 
 
235 aa  65.5  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.64 
 
 
222 aa  64.7  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
215 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  36.61 
 
 
253 aa  63.9  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  29.08 
 
 
312 aa  63.9  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  38.97 
 
 
291 aa  64.3  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4275  Methyltransferase type 11  34.93 
 
 
203 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.18004 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0946  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000915647  normal  0.885447 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4338  methyltransferase type 11  32.74 
 
 
208 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  42.42 
 
 
305 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  38.84 
 
 
200 aa  63.5  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  33.33 
 
 
268 aa  63.2  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.71 
 
 
237 aa  62.8  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1989  methyltransferase type 11  37.61 
 
 
218 aa  62.8  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0512707  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
260 aa  62.8  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 
251 aa  62.8  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2117  Methyltransferase type 11  34.82 
 
 
221 aa  62.8  0.000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  45.1 
 
 
257 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1330  Methyltransferase type 11  45.19 
 
 
252 aa  62.4  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  35.86 
 
 
265 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1028  Methyltransferase type 11  38.24 
 
 
273 aa  62.4  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 
236 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.47 
 
 
238 aa  62  0.000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0064  Methyltransferase type 11  42.72 
 
 
247 aa  62  0.000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 
262 aa  62  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  35.4 
 
 
202 aa  61.6  0.000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1987  UbiE/COQ5 family methlytransferase  41.18 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.199411  hitchhiker  0.00854034 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1550  methyltransferase type 11  41.9 
 
 
254 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.326399 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  32.17 
 
 
235 aa  61.6  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  34.23 
 
 
253 aa  61.2  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30.15 
 
 
251 aa  61.2  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0860  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00894914  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1891  UbiE/COQ5 methyltransferase  42.16 
 
 
255 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.249773  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1518  methyltransferase type 11  41.18 
 
 
254 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.349113  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3207  Methyltransferase type 11  39.67 
 
 
284 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52078 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0744  methyltransferase type 11  33.89 
 
 
256 aa  61.2  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3772  methyltransferase type 11  40.2 
 
 
254 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  34.46 
 
 
197 aa  60.8  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.77 
 
 
258 aa  60.5  0.00000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0686  methyltransferase type 11  35.19 
 
 
201 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.896648  normal  0.0113897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4152  Methyltransferase type 11  37.17 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.101054 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1254  methyltransferase type 11  33.81 
 
 
244 aa  60.5  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  39.05 
 
 
306 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  32.17 
 
 
238 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003869  biotin synthesis protein BioC  31.91 
 
 
268 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  39.58 
 
 
225 aa  60.1  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
252 aa  60.1  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  34.93 
 
 
259 aa  60.1  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  28.37 
 
 
201 aa  59.7  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
251 aa  59.7  0.00000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  37.29 
 
 
202 aa  59.7  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  31.36 
 
 
247 aa  58.9  0.00000005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2177  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.86 
 
 
345 aa  58.9  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.225032  hitchhiker  0.000137631 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2014  hypothetical protein  39.6 
 
 
253 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00388646  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1512  methyltransferase type 11  28.4 
 
 
190 aa  59.3  0.00000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.358179  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
227 aa  58.9  0.00000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  39.85 
 
 
195 aa  59.3  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0925  biotin biosynthesis protein BioC  29.41 
 
 
251 aa  58.9  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000310618  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>