More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0998 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  100 
 
 
258 aa  521  1e-147  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  45.95 
 
 
263 aa  256  3e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  43.3 
 
 
263 aa  248  1e-64  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  44.23 
 
 
263 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  47.29 
 
 
268 aa  231  9e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
262 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  30.62 
 
 
258 aa  124  1e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.6 
 
 
254 aa  120  3e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  30.53 
 
 
250 aa  114  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  34.6 
 
 
264 aa  113  3e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.47 
 
 
264 aa  112  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
247 aa  110  2.0000000000000002e-23  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  27.95 
 
 
253 aa  108  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.9 
 
 
268 aa  105  6e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 
252 aa  104  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
257 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  33.59 
 
 
246 aa  101  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 
252 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  40.28 
 
 
259 aa  99.8  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  46.22 
 
 
262 aa  98.2  1e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  38.99 
 
 
251 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  28.74 
 
 
267 aa  97.1  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.77 
 
 
258 aa  96.3  5e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  33.52 
 
 
254 aa  95.9  6e-19  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  42.45 
 
 
337 aa  94.7  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.56 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  31.6 
 
 
255 aa  94  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 
258 aa  92.8  5e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.81 
 
 
253 aa  92  9e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  40.16 
 
 
260 aa  91.3  1e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  37.21 
 
 
258 aa  90.5  3e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  37.21 
 
 
258 aa  90.1  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.33 
 
 
251 aa  89.7  4e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  29.08 
 
 
279 aa  87.8  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  29.75 
 
 
260 aa  88.6  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  30.91 
 
 
273 aa  88.6  1e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  30.32 
 
 
263 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  38.24 
 
 
258 aa  83.2  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.51 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.88 
 
 
205 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  33.6 
 
 
244 aa  79.7  0.00000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.92 
 
 
257 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.63 
 
 
255 aa  79  0.00000000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.38 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  37.31 
 
 
258 aa  78.2  0.0000000000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  32.8 
 
 
266 aa  78.2  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  32.8 
 
 
266 aa  77.8  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.63 
 
 
254 aa  77.4  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  27.44 
 
 
258 aa  77.4  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  43.33 
 
 
247 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  34.88 
 
 
280 aa  76.3  0.0000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.97 
 
 
258 aa  76.3  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
255 aa  75.9  0.0000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.73 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.99 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.81 
 
 
259 aa  75.5  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.17 
 
 
257 aa  75.5  0.0000000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  32.84 
 
 
256 aa  75.5  0.0000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.12 
 
 
287 aa  75.1  0.0000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0109  methyltransferase type 11  44.04 
 
 
236 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  27 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  27 
 
 
252 aa  75.1  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.44 
 
 
250 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.12 
 
 
256 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 
252 aa  74.3  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  28.98 
 
 
255 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  25.27 
 
 
269 aa  73.6  0.000000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  25.27 
 
 
269 aa  73.2  0.000000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6463  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
283 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.38 
 
 
256 aa  73.6  0.000000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.9 
 
 
264 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.28 
 
 
293 aa  73.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.12 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.59 
 
 
258 aa  73.2  0.000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.46 
 
 
256 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1080  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.89 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0245435  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.82 
 
 
255 aa  73.2  0.000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  28.38 
 
 
285 aa  72.8  0.000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 
252 aa  72.4  0.000000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  34.33 
 
 
270 aa  72.4  0.000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  37.72 
 
 
275 aa  72.4  0.000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.85 
 
 
260 aa  72  0.000000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.62 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.05 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.58 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5386  transcriptional regulator, ArsR family  34.36 
 
 
355 aa  70.9  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  30.34 
 
 
202 aa  70.9  0.00000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  35.34 
 
 
225 aa  70.5  0.00000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5332  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.04 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0094  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0103  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0892786 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0084  methyltransferase type 11  41.07 
 
 
235 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.315622 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>