More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2609 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  100 
 
 		 259 aa  530  1e-150  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  52.8 
 
 		 252 aa  268  7e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  50.8 
 
 		 260 aa  266  2.9999999999999995e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  52.8 
 
 		 254 aa  260  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  50.19 
 
 		 268 aa  256  4e-67  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  47.98 
 
 		 252 aa  235  4e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 253 aa  231  7.000000000000001e-60  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  45.16 
 
 		 258 aa  226  2e-58  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  47.58 
 
 		 258 aa  224  8e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  43.37 
 
 		 337 aa  221  8e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  45.6 
 
 		 260 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  43.37 
 
 		 251 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  47.58 
 
 		 251 aa  215  5e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  41.11 
 
 		 263 aa  210  2e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  48.24 
 
 		 262 aa  209  5e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  36.61 
 
 		 250 aa  165  8e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  40.98 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  35.61 
 
 		 279 aa  132  7.999999999999999e-30  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  36.97 
 
 		 263 aa  119  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  32.47 
 
 		 268 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  31.63 
 
 		 263 aa  105  6e-22  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC00200  conserved hypothetical protein  30.74 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  40.28 
 
 		 258 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 263 aa  94  2e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  30.56 
 
 		 258 aa  89.4  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  44.95 
 
 		 296 aa  87.4  2e-16  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.78 
 
 		 264 aa  86.7  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 		 274 aa  83.6  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  30.8 
 
 		 246 aa  81.6  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 214 aa  79.3  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0730  hypothetical protein  39.09 
 
 		 273 aa  79  0.00000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  31.69 
 
 		 267 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.48 
 
 		 253 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.78 
 
 		 258 aa  76.3  0.0000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 252 aa  76.6  0.0000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.08 
 
 		 254 aa  75.9  0.0000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.15 
 
 		 254 aa  75.1  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2962  biotin biosynthesis protein BioC  32.64 
 
 		 253 aa  74.7  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0381627  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.06 
 
 		 255 aa  75.1  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0519  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  38.02 
 
 		 229 aa  73.9  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8055  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.21 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 262 aa  73.6  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  32.09 
 
 		 251 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.77 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1507  biotin biosynthesis protein BioC  35.85 
 
 		 253 aa  73.2  0.000000000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000063017  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4465  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.82 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.101456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.31 
 
 		 259 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 		 225 aa  72  0.000000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  30.16 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  30.95 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  24.53 
 
 		 256 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.56 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 207 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4067  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.13 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.423276 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  28.74 
 
 		 264 aa  70.5  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 269 aa  69.7  0.00000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.68 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 		 252 aa  69.3  0.00000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  35.51 
 
 		 215 aa  69.7  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.78 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.78 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  31.78 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.78 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  46.67 
 
 		 205 aa  68.6  0.00000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  32.81 
 
 		 258 aa  68.6  0.00000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.28 
 
 		 237 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 212 aa  68.6  0.0000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  37.11 
 
 		 222 aa  68.6  0.0000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  35.64 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  27.04 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 269 aa  68.2  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3281  methyltransferase type 11  36.3 
 
 		 285 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.295556  normal  0.615609 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.28 
 
 		 260 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.79 
 
 		 258 aa  68.2  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.08 
 
 		 271 aa  67.8  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.24 
 
 		 243 aa  67.4  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.48 
 
 		 237 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.06 
 
 		 258 aa  67.4  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  29.6 
 
 		 333 aa  67  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  33.1 
 
 		 236 aa  67  0.0000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.78 
 
 		 250 aa  67  0.0000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  27.88 
 
 		 237 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.35 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  34.91 
 
 		 262 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.17 
 
 		 262 aa  66.6  0.0000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  31.06 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  32.52 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  39.83 
 
 		 230 aa  66.2  0.0000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  33.61 
 
 		 237 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>