More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_7304 on replicon NC_011981
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  100 
 
 		 296 aa  617  1e-176  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  41.03 
 
 		 237 aa  120  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  35.38 
 
 		 237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  33.85 
 
 		 237 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  35.48 
 
 		 239 aa  116  5e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  35.2 
 
 		 237 aa  115  8.999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  34.87 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  34.87 
 
 		 237 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  37.95 
 
 		 237 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  46.02 
 
 		 231 aa  106  6e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  32.45 
 
 		 272 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.83 
 
 		 251 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 244 aa  88.6  1e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  44.95 
 
 		 259 aa  87.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 		 248 aa  84  0.000000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  35.86 
 
 		 269 aa  83.6  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  44.14 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  36.36 
 
 		 254 aa  82.4  0.000000000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  38.68 
 
 		 266 aa  81.6  0.00000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 		 276 aa  81.6  0.00000000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  33.56 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  36.08 
 
 		 337 aa  80.5  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  36.19 
 
 		 239 aa  79.7  0.00000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  34.56 
 
 		 276 aa  80.1  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 248 aa  79.7  0.00000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.45 
 
 		 232 aa  79.7  0.00000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  36.36 
 
 		 258 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.12 
 
 		 262 aa  78.6  0.0000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  37.01 
 
 		 258 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  35.25 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  35.25 
 
 		 238 aa  77.4  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  43.16 
 
 		 268 aa  75.9  0.0000000000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  34.78 
 
 		 263 aa  75.9  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.33 
 
 		 319 aa  75.9  0.0000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  30.94 
 
 		 249 aa  75.5  0.0000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  41.18 
 
 		 252 aa  75.1  0.000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  32.9 
 
 		 663 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 247 aa  74.3  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  31.17 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.68 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  32.86 
 
 		 256 aa  74.3  0.000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  44.12 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 258 aa  72.8  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  27.62 
 
 		 255 aa  72.8  0.000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  39.8 
 
 		 260 aa  72.4  0.000000000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 260 aa  71.2  0.00000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  30.77 
 
 		 239 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  24 
 
 		 247 aa  71.2  0.00000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  32 
 
 		 251 aa  71.2  0.00000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 237 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 269 aa  70.1  0.00000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  35.17 
 
 		 207 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.82 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  33.95 
 
 		 271 aa  69.3  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  33.07 
 
 		 251 aa  69.3  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  45 
 
 		 305 aa  68.9  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  32.85 
 
 		 251 aa  68.9  0.00000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  35.29 
 
 		 254 aa  68.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  33.57 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  38.54 
 
 		 250 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2806  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.82 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000560342 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2527  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.67 
 
 		 238 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.142022  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.68 
 
 		 220 aa  67.8  0.0000000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0714  methyltransferase  35.21 
 
 		 231 aa  68.2  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4314  methyltransferase type 11  37.27 
 
 		 212 aa  67.8  0.0000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.24068 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 246 aa  68.2  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 286 aa  67.8  0.0000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  32.73 
 
 		 262 aa  67.8  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 291 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3665  Methyltransferase type 11  37.61 
 
 		 223 aa  67  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  35.88 
 
 		 260 aa  67  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2850  methylase  30.67 
 
 		 235 aa  67  0.0000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00782865  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  33.61 
 
 		 247 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  29.38 
 
 		 270 aa  66.6  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  34.65 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  35.95 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.19 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 242 aa  66.2  0.0000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  34.17 
 
 		 247 aa  66.2  0.0000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  35.56 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  37.14 
 
 		 294 aa  65.9  0.0000000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.27 
 
 		 258 aa  65.1  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  28.21 
 
 		 247 aa  65.5  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 246 aa  65.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  38.38 
 
 		 268 aa  65.1  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  40 
 
 		 637 aa  64.7  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  31.48 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3425  ubiquinone biosynthesis O-methyltransferase  32.84 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000129288 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  31.37 
 
 		 152 aa  64.7  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  33.52 
 
 		 273 aa  64.3  0.000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2830  methylase  29.33 
 
 		 238 aa  63.9  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.036188  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.98 
 
 		 201 aa  63.9  0.000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1176  UbiE/COQ5 methyltransferase  36.62 
 
 		 230 aa  63.9  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0192927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  29.73 
 
 		 247 aa  64.3  0.000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 238 aa  64.3  0.000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  37.75 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>