More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_7775 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  496  1e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  67.7 
 
 		 258 aa  322  3e-87  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4615  Methyltransferase type 11  61.66 
 
 		 253 aa  292  3e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0369451  hitchhiker  0.00577635 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39660  hypothetical protein  39.11 
 
 		 269 aa  162  3e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2655  Methyltransferase type 12  36.61 
 
 		 270 aa  149  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0191778  normal  0.203757 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  39.74 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3913  Methyltransferase type 12  39.46 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00040245  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0096  methyltransferase type 12  27.31 
 
 		 225 aa  77.8  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.3 
 
 		 258 aa  72.4  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  24.89 
 
 		 242 aa  68.9  0.00000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 		 247 aa  67.4  0.0000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3301  hypothetical protein  25 
 
 		 242 aa  66.6  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.163975 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  24.55 
 
 		 267 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2979  methyltransferase type 12  32.91 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  31.46 
 
 		 268 aa  64.7  0.000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  34.65 
 
 		 263 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  36.79 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1199  hypothetical protein  32.82 
 
 		 223 aa  62.8  0.000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.105724  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  35.85 
 
 		 337 aa  62.4  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  35 
 
 		 255 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.56 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.09 
 
 		 262 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 263 aa  60.8  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  30.54 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  36 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 257 aa  60.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 268 aa  60.1  0.00000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 243 aa  60.5  0.00000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  29.63 
 
 		 258 aa  60.1  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0717  Methyltransferase type 12  28.95 
 
 		 238 aa  59.7  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.52 
 
 		 269 aa  59.7  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.04 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.95 
 
 		 268 aa  59.3  0.00000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  39.81 
 
 		 246 aa  59.3  0.00000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.81 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.37 
 
 		 256 aa  58.5  0.00000009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 		 261 aa  58.5  0.00000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 		 254 aa  58.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.78 
 
 		 268 aa  57.8  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2563  Methyltransferase type 12  21.79 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.415136 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3550  Methyltransferase type 12  21.79 
 
 		 250 aa  57.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  32 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 252 aa  57.8  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.78 
 
 		 255 aa  57  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  36.69 
 
 		 217 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0285  hypothetical protein  27.27 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.218355  normal  0.197708 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  27.27 
 
 		 254 aa  57  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  29.37 
 
 		 211 aa  57  0.0000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 260 aa  57  0.0000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.83 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3069  Methyltransferase type 12  34.18 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.29 
 
 		 259 aa  55.8  0.0000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.58 
 
 		 262 aa  55.8  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.68 
 
 		 262 aa  55.5  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  31.37 
 
 		 263 aa  55.5  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1278  hypothetical protein  37.93 
 
 		 226 aa  55.5  0.0000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3177  Methyltransferase type 12  32.91 
 
 		 229 aa  55.5  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.616832  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.32 
 
 		 258 aa  54.7  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 252 aa  55.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  30.1 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  39 
 
 		 255 aa  54.7  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  37.61 
 
 		 307 aa  55.1  0.000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.69 
 
 		 258 aa  55.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1197  methyltransferase type 12  24.18 
 
 		 223 aa  53.9  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.500309 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.1 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.4 
 
 		 260 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 253 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.2 
 
 		 221 aa  54.3  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.7 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  25.4 
 
 		 253 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1418  Methyltransferase type 11  36.54 
 
 		 245 aa  53.5  0.000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.291463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.7 
 
 		 258 aa  53.9  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.1 
 
 		 258 aa  53.5  0.000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 		 305 aa  53.1  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.04 
 
 		 264 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  37.93 
 
 		 217 aa  52.8  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03630  biotin biosynthesis protein BioC  31.97 
 
 		 294 aa  53.1  0.000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.1 
 
 		 253 aa  52.8  0.000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 258 aa  52.8  0.000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  30.94 
 
 		 258 aa  52.8  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2686  methyltransferase type 12  30.13 
 
 		 246 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0980634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.73 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.1 
 
 		 252 aa  52  0.000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 258 aa  52  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0429  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2050  aspartate-semialdehyde dehydrogenase  23.98 
 
 		 231 aa  51.2  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.510471 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  39 
 
 		 287 aa  51.6  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  33 
 
 		 255 aa  51.6  0.00001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>