More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_2049 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  100 
 
 		 246 aa  476  1e-133  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3432  Methyltransferase type 11  43.58 
 
 		 255 aa  168  7e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.914032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  37.45 
 
 		 264 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0277  methyltransferase type 11  45.19 
 
 		 244 aa  145  7.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  37.35 
 
 		 268 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  30.93 
 
 		 263 aa  112  5e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  33.59 
 
 		 258 aa  101  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.02 
 
 		 268 aa  99.4  5e-20  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 258 aa  97.4  2e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 		 263 aa  95.1  9e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  38.18 
 
 		 251 aa  92  8e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  35.9 
 
 		 251 aa  91.7  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  27.44 
 
 		 263 aa  89.7  4e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  34.8 
 
 		 337 aa  87  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  29.6 
 
 		 262 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  26.97 
 
 		 253 aa  84.7  0.000000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 262 aa  84.3  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  29.57 
 
 		 254 aa  84  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  28.91 
 
 		 263 aa  83.6  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.98 
 
 		 258 aa  82.8  0.000000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.8 
 
 		 259 aa  81.6  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 247 aa  80.9  0.00000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  28.45 
 
 		 260 aa  80.1  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 258 aa  78.6  0.00000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 264 aa  78.2  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.51 
 
 		 258 aa  77.4  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1128  biotin synthesis protein BioC  33.53 
 
 		 275 aa  74.7  0.000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.91 
 
 		 258 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2433  biotin biosynthesis protein BioC  34.07 
 
 		 291 aa  74.7  0.000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0734686 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  26.51 
 
 		 254 aa  74.3  0.000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.8 
 
 		 258 aa  73.9  0.000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.78 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.78 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.78 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  35.78 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.45 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 252 aa  73.6  0.000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3569  Methyltransferase type 11  36.14 
 
 		 259 aa  72.8  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.131533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 257 aa  72.8  0.000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2620  hypothetical protein  31.01 
 
 		 266 aa  71.6  0.000000000009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2747  hypothetical protein  31.01 
 
 		 266 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  29.64 
 
 		 280 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 252 aa  70.5  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3333  Methyltransferase type 11  35.57 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.15 
 
 		 260 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 252 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2149  Methyltransferase type 11  27.2 
 
 		 260 aa  69.3  0.00000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  26.97 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 256 aa  68.9  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.23 
 
 		 260 aa  68.6  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 		 259 aa  68.6  0.00000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.8 
 
 		 256 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  29.02 
 
 		 250 aa  68.2  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  35.29 
 
 		 256 aa  68.2  0.0000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.72 
 
 		 257 aa  67.8  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1845  methyltransferase type 11  32.56 
 
 		 234 aa  67.8  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  34.55 
 
 		 213 aa  67.8  0.0000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.86 
 
 		 252 aa  67  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 		 255 aa  67.8  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.7 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3831  biotin biosynthesis protein BioC  33.33 
 
 		 294 aa  66.6  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1261  hypothetical protein  32.22 
 
 		 250 aa  66.2  0.0000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.64 
 
 		 261 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  39.81 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000004  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0673  methyltransferase type 11  33.9 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0759  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 267 aa  65.9  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.333457  normal  0.305002 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.85 
 
 		 256 aa  65.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.31 
 
 		 256 aa  65.5  0.0000000008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  40.37 
 
 		 344 aa  65.1  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.38 
 
 		 257 aa  65.5  0.0000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.38 
 
 		 262 aa  65.1  0.0000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.54 
 
 		 256 aa  65.1  0.0000000009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.46 
 
 		 255 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.31 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  25.52 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.7 
 
 		 258 aa  64.7  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0085  Methyltransferase type 11  38.52 
 
 		 236 aa  64.7  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.31 
 
 		 255 aa  64.7  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.77 
 
 		 256 aa  64.3  0.000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26450  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.66 
 
 		 244 aa  64.7  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.765571 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01566  conserved hypothetical protein  27.11 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.145995  normal  0.121317 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0358  hypothetical protein  29.55 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0334  hypothetical protein  30.23 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.23 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.68 
 
 		 255 aa  63.9  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  34.59 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.17 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2883  hypothetical protein  39.62 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.369338  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.23 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.23 
 
 		 258 aa  63.5  0.000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0421  biotin biosynthesis protein BioC  31.37 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000894072 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0822  biotin biosynthesis protein BioC  32.14 
 
 		 295 aa  63.2  0.000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0245  biotin synthesis protein BioC  31.37 
 
 		 292 aa  62.8  0.000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.35 
 
 		 269 aa  62.8  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>