More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3605 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  100 
 
 
262 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  81.42 
 
 
253 aa  399  9.999999999999999e-111  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  52.17 
 
 
253 aa  258  5.0000000000000005e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  48.58 
 
 
252 aa  240  2e-62  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  32 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.38 
 
 
262 aa  134  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  35.18 
 
 
575 aa  125  9e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  30.56 
 
 
258 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  32.8 
 
 
248 aa  106  4e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  34.4 
 
 
315 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  28.69 
 
 
237 aa  102  7e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  28.78 
 
 
254 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  27.04 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  28.29 
 
 
254 aa  91.7  1e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  90.5  2e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  26.18 
 
 
254 aa  89.7  4e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  27.8 
 
 
253 aa  89.7  5e-17  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  27.8 
 
 
254 aa  89.4  6e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  27.32 
 
 
254 aa  88.6  8e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  29.33 
 
 
416 aa  87  3e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  27.18 
 
 
252 aa  86.3  5e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  23.94 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  23.94 
 
 
261 aa  84.7  0.000000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.95 
 
 
246 aa  85.1  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  28.52 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  23.94 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  23.94 
 
 
262 aa  82  0.000000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  23.94 
 
 
261 aa  80.5  0.00000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  23.37 
 
 
256 aa  79.7  0.00000000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 
261 aa  78.2  0.0000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  29.68 
 
 
236 aa  78.2  0.0000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  29.68 
 
 
236 aa  77.8  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  30.13 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.55 
 
 
256 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  30.13 
 
 
226 aa  76.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  27.4 
 
 
246 aa  75.9  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  29.03 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  29.03 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  29.03 
 
 
236 aa  75.9  0.0000000000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  26.14 
 
 
249 aa  75.9  0.0000000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  28.04 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  31.47 
 
 
244 aa  75.1  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
262 aa  73.9  0.000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
246 aa  73.6  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  28.99 
 
 
251 aa  73.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
252 aa  72.8  0.000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  28.31 
 
 
262 aa  72.4  0.000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  26.29 
 
 
262 aa  72  0.00000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  28.73 
 
 
251 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  34.53 
 
 
254 aa  70.5  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
251 aa  70.9  0.00000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
226 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  69.7  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  31.18 
 
 
239 aa  69.3  0.00000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
225 aa  69.3  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.3 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  29.18 
 
 
249 aa  68.6  0.00000000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  24.64 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.18 
 
 
232 aa  68.2  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  32.26 
 
 
199 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  29.22 
 
 
247 aa  67.4  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  26.91 
 
 
254 aa  67.4  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.73 
 
 
296 aa  67.8  0.0000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.91 
 
 
259 aa  67  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  31.45 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
242 aa  67  0.0000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  24.02 
 
 
252 aa  66.6  0.0000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  26.56 
 
 
237 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.27 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  24.47 
 
 
237 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
256 aa  64.7  0.000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  24.52 
 
 
307 aa  64.3  0.000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25.45 
 
 
280 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  27.44 
 
 
261 aa  64.3  0.000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  23.87 
 
 
251 aa  63.9  0.000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  25.91 
 
 
256 aa  63.9  0.000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.6 
 
 
246 aa  63.5  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  30.28 
 
 
233 aa  63.5  0.000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  25.96 
 
 
259 aa  63.2  0.000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.33 
 
 
276 aa  62.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  25.61 
 
 
239 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  24.31 
 
 
263 aa  62.8  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  26.51 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  40.94 
 
 
304 aa  62.8  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 
250 aa  62.4  0.000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4083  methyltransferase type 11  35.9 
 
 
257 aa  62  0.000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.189475  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  33.06 
 
 
637 aa  62  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25.68 
 
 
266 aa  61.2  0.00000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  29.44 
 
 
237 aa  61.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  37.14 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  21.67 
 
 
257 aa  60.8  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  33.57 
 
 
265 aa  60.8  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  30.77 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0039  ArsR family transcriptional regulator  37.84 
 
 
309 aa  60.5  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  36.67 
 
 
268 aa  60.8  0.00000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  28.51 
 
 
286 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  28.57 
 
 
247 aa  60.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
184 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.62 
 
 
276 aa  60.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>