More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1130 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1130  Methyltransferase type 11  100 
 
 
269 aa  546  1e-154  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.052187  normal  0.562201 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1129  Methyltransferase type 11  46.04 
 
 
274 aa  253  3e-66  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0978373  normal  0.945525 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1125  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 
270 aa  198  7e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.321869  normal  0.566486 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3885  methyltransferase type 11  38.87 
 
 
274 aa  189  5.999999999999999e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7237  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
269 aa  143  4e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0859301  normal  0.799948 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1136  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 
273 aa  137  2e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.224282  normal  0.55506 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2874  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  30.77 
 
 
273 aa  133  3.9999999999999996e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.522962 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4839  putative methyltransferase  30.98 
 
 
271 aa  129  7.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  26.89 
 
 
263 aa  85.9  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5135  Methyltransferase type 11  25.61 
 
 
275 aa  80.5  0.00000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1443  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.53 
 
 
201 aa  75.5  0.0000000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000720373  normal  0.0497361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0265  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
257 aa  73.2  0.000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.767056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1121  methyltransferase type 11  36.29 
 
 
293 aa  72.8  0.000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.536452  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0808  methyltransferase type 11  29.12 
 
 
182 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0203629 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  38.66 
 
 
215 aa  72.8  0.000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.59 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0785  methyltransferase type 11  34.19 
 
 
267 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2330  hypothetical protein  32.14 
 
 
249 aa  70.9  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.291215  normal  0.0289436 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.24 
 
 
252 aa  71.2  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0006  hypothetical protein  29.71 
 
 
271 aa  70.5  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.868865  normal  0.0557095 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1156  methyltransferase  32.89 
 
 
355 aa  70.1  0.00000000004  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0112  Methyltransferase type 11  24.05 
 
 
258 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  27.86 
 
 
206 aa  68.9  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 
259 aa  68.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0780  glycosyl transferase, group 1  28.11 
 
 
711 aa  68.2  0.0000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1528  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.828667  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1558  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.04 
 
 
241 aa  68.6  0.0000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.23 
 
 
274 aa  68.2  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0028  glycosyl transferase group 1  28.34 
 
 
710 aa  67.4  0.0000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.310155 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.23 
 
 
291 aa  67.8  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2758  demethylmenaquinone methyltransferase  31.58 
 
 
256 aa  67.8  0.0000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.338753  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2291  hypothetical protein  27.01 
 
 
263 aa  67.4  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4324  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
286 aa  66.6  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  28.43 
 
 
213 aa  66.6  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.87 
 
 
229 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2627  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
286 aa  66.2  0.0000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.8455  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0586  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.28 
 
 
346 aa  66.2  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  33.86 
 
 
263 aa  65.9  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0749  methyltransferase type 11  36.07 
 
 
295 aa  65.9  0.0000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.102381  decreased coverage  0.00014415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2022  hypothetical protein  27.84 
 
 
261 aa  65.9  0.0000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.891913  normal  0.0390381 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  25 
 
 
284 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3569  methyltransferase type 11  32.26 
 
 
208 aa  65.5  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.865632 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0051  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  25.59 
 
 
237 aa  65.5  0.0000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.181609  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1039  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  32.43 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4310  hypothetical protein  23.43 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2367  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 
270 aa  65.1  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  36.52 
 
 
363 aa  65.1  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1190  methyltransferase type 11  35.65 
 
 
209 aa  65.5  0.000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0776895  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0772  Methyltransferase type 11  33.11 
 
 
240 aa  65.1  0.000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1056  methyltransferase type 11  40.22 
 
 
221 aa  64.7  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.270016  normal  0.802402 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2262  Methyltransferase type 11  28.44 
 
 
272 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0068662  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4431  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
295 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1198  Methyltransferase type 11  26.73 
 
 
272 aa  64.3  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  35.92 
 
 
211 aa  64.3  0.000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  24.33 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  24.79 
 
 
252 aa  63.5  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4657  Methyltransferase type 11  28.24 
 
 
624 aa  63.2  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.109696 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  23.28 
 
 
258 aa  63.2  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5480  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.690261  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5101  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  24.82 
 
 
259 aa  62.8  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5189  methyltransferase type 11  30.52 
 
 
243 aa  63.2  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167139  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1001  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
282 aa  63.2  0.000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1280  demethylmenaquinone methyltransferase / 2-octaprenyl-6-methoxy-1,4-benzoquinone methylase  29.49 
 
 
233 aa  62.8  0.000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00372704  hitchhiker  0.0000170173 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1234  hypothetical protein  27.89 
 
 
524 aa  62.8  0.000000006  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0873345 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  24.15 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  26.69 
 
 
260 aa  62.8  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3937  Methyltransferase type 11  29.22 
 
 
298 aa  62.4  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.472331  normal  0.52551 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0549  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
201 aa  62.4  0.000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0994  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  33.93 
 
 
282 aa  62.4  0.000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000209916  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1638  Methyltransferase type 11  30 
 
 
269 aa  62.4  0.000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.357155  normal  0.179609 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  31.97 
 
 
276 aa  62  0.000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  29.94 
 
 
240 aa  61.6  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  30.87 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2102  hypothetical protein  29.67 
 
 
269 aa  61.6  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
252 aa  61.6  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0469  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  34.51 
 
 
234 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  31.78 
 
 
306 aa  60.8  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1722  methyltransferase type 11  30.43 
 
 
280 aa  60.8  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0295021 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2810  Methyltransferase type 11  30.82 
 
 
246 aa  60.8  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.54366  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1274  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
206 aa  61.2  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.572437 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3931  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
271 aa  60.8  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.37046  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1430  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 
205 aa  61.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.406205  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0484  putative methyltransferase  33.79 
 
 
240 aa  61.2  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8173  Methyltransferase type 11  27.33 
 
 
254 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.781909  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_74165  predicted protein  34.78 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.426608 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5232  methyltransferase type 11  24.69 
 
 
352 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  26.03 
 
 
232 aa  60.8  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1944  methyltransferase type 11  31.01 
 
 
202 aa  60.8  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
226 aa  60.8  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2298  Methyltransferase type 11  30.89 
 
 
306 aa  61.2  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.490021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  32.17 
 
 
283 aa  60.5  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 
244 aa  60.5  0.00000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  30.77 
 
 
251 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3876  Methyltransferase type 11  26.16 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1475  methyltransferase, UbiE/COQ5 family  29.34 
 
 
221 aa  60.5  0.00000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000576982  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  32.5 
 
 
271 aa  60.5  0.00000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>