240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0581 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009636  Smed_0581  trans-aconitate 2-methyltransferase  100 
 
 
257 aa  522  1e-147  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.423521  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0827  trans-aconitate 2-methyltransferase  58.59 
 
 
256 aa  311  9e-84  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.934205 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0941  trans-aconitate 2-methyltransferase  58.59 
 
 
256 aa  309  2.9999999999999997e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.842807  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.15 
 
 
256 aa  278  9e-74  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1922  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.15 
 
 
256 aa  275  5e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.146762  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3451  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.36 
 
 
256 aa  269  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  54.15 
 
 
256 aa  267  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 
256 aa  266  2e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.57 
 
 
256 aa  266  2.9999999999999995e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  52.34 
 
 
256 aa  265  4e-70  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.78 
 
 
256 aa  264  1e-69  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.16 
 
 
258 aa  263  3e-69  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.59 
 
 
255 aa  262  4e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  51.95 
 
 
256 aa  260  2e-68  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.79 
 
 
255 aa  256  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.17 
 
 
259 aa  256  2e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.79 
 
 
255 aa  256  2e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  55.34 
 
 
257 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  54.12 
 
 
258 aa  250  1e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.95 
 
 
260 aa  250  1e-65  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2790  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  249  3e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.513297  normal  0.178369 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2280  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.2 
 
 
258 aa  248  5e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.16 
 
 
260 aa  248  6e-65  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  49.81 
 
 
257 aa  244  9e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.55 
 
 
261 aa  243  3e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  52.73 
 
 
261 aa  240  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 
262 aa  236  2e-61  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.24 
 
 
258 aa  236  3e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  50.78 
 
 
262 aa  236  3e-61  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.24 
 
 
258 aa  235  7e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.24 
 
 
258 aa  235  7e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.68 
 
 
268 aa  233  2.0000000000000002e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3371  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.69 
 
 
258 aa  233  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362106 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2216  trans-aconitate 2-methyltransferase  48.29 
 
 
258 aa  232  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.414358  normal  0.438361 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2545  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.77 
 
 
272 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00229105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3170  trans-aconitate 2-methyltransferase  46.77 
 
 
258 aa  230  2e-59  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.781198  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  50 
 
 
258 aa  228  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  50 
 
 
258 aa  227  1e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2425  trans-aconitate 2-methyltransferase  47.84 
 
 
253 aa  223  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.576064 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  42.91 
 
 
257 aa  216  2.9999999999999998e-55  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.09 
 
 
252 aa  214  8e-55  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  45.8 
 
 
333 aa  213  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.87 
 
 
252 aa  211  9e-54  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.87 
 
 
252 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  43.87 
 
 
252 aa  211  1e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.87 
 
 
252 aa  211  1e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  43.87 
 
 
252 aa  211  1e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.48 
 
 
252 aa  208  7e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.91 
 
 
252 aa  208  7e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.24 
 
 
221 aa  208  7e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2018  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.69 
 
 
252 aa  207  9e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00947857  normal  0.156367 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  44.31 
 
 
243 aa  206  3e-52  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  53.11 
 
 
253 aa  204  1e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.18 
 
 
269 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17170  trans-aconitate methyltransferase  38.74 
 
 
255 aa  169  3e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  hitchhiker  0.00821566  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4083  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.11 
 
 
257 aa  165  5.9999999999999996e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.30188 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.43 
 
 
259 aa  162  7e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0608  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.76 
 
 
262 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0288273  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  37.16 
 
 
258 aa  161  1e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8614  Trans-aconitate 2-methyltransferase  37.55 
 
 
250 aa  159  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0644  Trans-aconitate 2-methyltransferase  39.3 
 
 
253 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.069805 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4574  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.38 
 
 
255 aa  159  5e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0425  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.11 
 
 
254 aa  156  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.500195  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2673  trans-aconitate methyltransferase  35.02 
 
 
280 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2075  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.62 
 
 
287 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.864232  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1621  trans-aconitate methyltransferase  35.02 
 
 
344 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.898496  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3158  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.76 
 
 
252 aa  152  4e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.92 
 
 
254 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.92 
 
 
254 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.92 
 
 
254 aa  152  5e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3156  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.86 
 
 
258 aa  151  8e-36  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.397868 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.86 
 
 
249 aa  150  2e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 
264 aa  144  1e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.83 
 
 
268 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0992  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.83 
 
 
294 aa  142  5e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0316  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
255 aa  142  7e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.224637  normal  0.898974 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.73 
 
 
265 aa  141  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1276  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.03 
 
 
271 aa  140  3e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.281343  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31370  hypothetical protein  34.48 
 
 
275 aa  140  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.14144  hitchhiker  0.000000000000010613 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11260  trans-aconitate methyltransferase  34.77 
 
 
307 aa  139  3.9999999999999997e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.22553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3059  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.08 
 
 
255 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000652441 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0567  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.11 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445388  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2668  hypothetical protein  33.33 
 
 
275 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0640  Trans-aconitate 2-methyltransferase  35.52 
 
 
252 aa  135  9e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13820  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.95 
 
 
255 aa  135  9e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.328183  normal  0.535788 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.35 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1351  Trans-aconitate 2-methyltransferase  32.68 
 
 
254 aa  130  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0825265 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3620  Trans-aconitate 2-methyltransferase  50 
 
 
201 aa  125  8.000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4335  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.89 
 
 
254 aa  124  1e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6020  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.12 
 
 
252 aa  115  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3939  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.13 
 
 
255 aa  113  3e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0474  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 
277 aa  100  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.901578 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  27.92 
 
 
258 aa  79  0.00000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 
252 aa  78.6  0.00000000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1955  methyltransferase type 11  25 
 
 
268 aa  78.6  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
268 aa  70.9  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2012  Methyltransferase type 11  23.17 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000802206  normal  0.20097 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1516  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0145455  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1523  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.409061  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1530  methyltransferase type 11  24.54 
 
 
263 aa  69.3  0.00000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>