More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_2940 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  100 
 
 		 224 aa  453  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  43.81 
 
 		 214 aa  147  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  39.01 
 
 		 210 aa  122  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  35.41 
 
 		 211 aa  120  1.9999999999999998e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  36.52 
 
 		 222 aa  103  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  33 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 		 208 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.16 
 
 		 201 aa  94.7  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  44.07 
 
 		 234 aa  92.4  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  34.15 
 
 		 208 aa  90.9  1e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.27 
 
 		 390 aa  90.1  2e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 		 197 aa  88.6  8e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  28.66 
 
 		 201 aa  87  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  36.84 
 
 		 218 aa  87  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  30.32 
 
 		 211 aa  86.7  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  33.53 
 
 		 207 aa  86.3  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 215 aa  85.9  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  31.41 
 
 		 201 aa  84.7  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 241 aa  83.6  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  33.16 
 
 		 199 aa  79  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.17 
 
 		 224 aa  77.8  0.0000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  31.34 
 
 		 221 aa  77.4  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  33.84 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  27.39 
 
 		 201 aa  73.2  0.000000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  34.51 
 
 		 194 aa  72.8  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  33.54 
 
 		 200 aa  72.4  0.000000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  30.06 
 
 		 202 aa  72  0.000000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 203 aa  72  0.000000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  32.95 
 
 		 199 aa  70.9  0.00000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  32.59 
 
 		 238 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.11 
 
 		 222 aa  69.7  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  30.16 
 
 		 217 aa  68.9  0.00000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4832  methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 287 aa  68.9  0.00000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0563647  normal  0.0172807 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 199 aa  68.6  0.00000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  41.03 
 
 		 268 aa  68.2  0.00000000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 		 225 aa  67.8  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  37.1 
 
 		 337 aa  67.4  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  30.95 
 
 		 217 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 199 aa  67.4  0.0000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.27 
 
 		 257 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  34.19 
 
 		 201 aa  67  0.0000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  31.21 
 
 		 219 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 212 aa  66.6  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  30.27 
 
 		 200 aa  66.6  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  34.19 
 
 		 263 aa  66.6  0.0000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  34.75 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  36.11 
 
 		 251 aa  66.2  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 217 aa  65.5  0.0000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 252 aa  65.5  0.0000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  30.61 
 
 		 235 aa  65.1  0.0000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  42.16 
 
 		 252 aa  65.1  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.75 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 261 aa  64.3  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 210 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  39.02 
 
 		 271 aa  64.7  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0574  Methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 291 aa  64.3  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.374047 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  34.75 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 209 aa  63.5  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6189  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  38.69 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.53 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 279 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1528  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 209 aa  62.8  0.000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.309563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  29.87 
 
 		 237 aa  62.8  0.000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  30.43 
 
 		 231 aa  62.8  0.000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  28.17 
 
 		 192 aa  62.4  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  27.65 
 
 		 196 aa  62.8  0.000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2539  methyltransferase type 11  37.66 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0779638  normal  0.34629 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  25.64 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  36.7 
 
 		 282 aa  62.4  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 250 aa  62  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  39.26 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1956  methyltransferase type 12  33.52 
 
 		 201 aa  62  0.000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.177509  normal  0.0792402 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5190  hypothetical protein  28.98 
 
 		 207 aa  62  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3266  hypothetical protein  35.24 
 
 		 400 aa  61.6  0.000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  23.35 
 
 		 206 aa  61.6  0.000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.82 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0183  methyltransferase type 11  30.41 
 
 		 199 aa  61.6  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0947468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  36.11 
 
 		 328 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  27.45 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  28.29 
 
 		 263 aa  60.5  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  41.67 
 
 		 291 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  33.91 
 
 		 278 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1309  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 		 231 aa  60.1  0.00000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.236304  normal  0.0297047 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.66 
 
 		 207 aa  60.1  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5021  Methyltransferase type 11  30.51 
 
 		 214 aa  59.7  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0503  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 197 aa  60.1  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1271  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 274 aa  60.1  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.459603  hitchhiker  0.00156427 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1400  methyltransferase type 11  36.99 
 
 		 218 aa  59.3  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  29.25 
 
 		 235 aa  59.3  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  31.16 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 261 aa  59.3  0.00000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  26.28 
 
 		 237 aa  59.7  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 200 aa  59.3  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_3898  predicted protein  32.69 
 
 		 306 aa  59.3  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  27.09 
 
 		 232 aa  59.7  0.00000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  34.05 
 
 		 259 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  37.2 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>