170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3873 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  56.57 
 
 		 202 aa  205  3e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  49.24 
 
 		 201 aa  201  7e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  52.02 
 
 		 200 aa  171  5.999999999999999e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  42.53 
 
 		 201 aa  161  6e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  38.19 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  44 
 
 		 207 aa  149  2e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  35.35 
 
 		 390 aa  138  7e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 224 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  35.64 
 
 		 198 aa  72  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  36.89 
 
 		 192 aa  65.1  0.0000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  27.06 
 
 		 200 aa  65.1  0.0000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  31.87 
 
 		 214 aa  62.8  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  32.03 
 
 		 219 aa  62.4  0.000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  36.62 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.87 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  40.4 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  28.49 
 
 		 211 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.13 
 
 		 224 aa  58.5  0.00000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  33.99 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  25.21 
 
 		 201 aa  57  0.0000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 210 aa  56.6  0.0000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 194 aa  55.8  0.0000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 272 aa  55.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.87 
 
 		 243 aa  55.1  0.0000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  31.76 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  35 
 
 		 423 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 		 252 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.52 
 
 		 218 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 201 aa  52.8  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  37.04 
 
 		 208 aa  52.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  47.14 
 
 		 244 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  33.66 
 
 		 270 aa  52.4  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.35 
 
 		 203 aa  52.4  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  27.47 
 
 		 225 aa  51.6  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.62 
 
 		 217 aa  51.2  0.000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30.4 
 
 		 266 aa  51.2  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.67 
 
 		 254 aa  50.8  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.89 
 
 		 244 aa  50.1  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  44.44 
 
 		 262 aa  49.7  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 		 247 aa  49.7  0.00003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 218 aa  49.3  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  33.91 
 
 		 220 aa  49.3  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 252 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  31.33 
 
 		 254 aa  48.9  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  29.93 
 
 		 197 aa  48.9  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 		 234 aa  48.9  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  47.17 
 
 		 259 aa  48.9  0.00005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 200 aa  48.5  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  36.59 
 
 		 248 aa  48.5  0.00007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 221 aa  48.1  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00200  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  28.26 
 
 		 200 aa  48.1  0.00008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0119  Trans-aconitate 2-methyltransferase  33.91 
 
 		 268 aa  48.1  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.464742  normal  0.645262 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  37.18 
 
 		 400 aa  48.1  0.00009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  31.22 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  38.1 
 
 		 256 aa  47.8  0.0001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 		 337 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  55.81 
 
 		 236 aa  47.4  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  28.21 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  28.21 
 
 		 236 aa  47  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  35.87 
 
 		 209 aa  47  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3033  methyltransferase type 11  28.24 
 
 		 504 aa  47  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  34.13 
 
 		 262 aa  47  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.33 
 
 		 258 aa  46.6  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  25.23 
 
 		 247 aa  47  0.0002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  28.12 
 
 		 222 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  45.28 
 
 		 266 aa  46.2  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  30.77 
 
 		 246 aa  46.2  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0212  hypothetical protein  26.19 
 
 		 231 aa  46.2  0.0004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0486  hypothetical protein  27.93 
 
 		 208 aa  45.8  0.0004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  46.97 
 
 		 258 aa  46.2  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.89 
 
 		 268 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 241 aa  46.2  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  45.8  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3538  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.64 
 
 		 227 aa  46.2  0.0004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  45.4  0.0005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 201 aa  45.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  44.29 
 
 		 260 aa  45.4  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.21 
 
 		 236 aa  45.8  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  28.21 
 
 		 226 aa  45.1  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  33.77 
 
 		 258 aa  45.1  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  28.21 
 
 		 209 aa  45.1  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  23.44 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1844  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  31.39 
 
 		 251 aa  44.7  0.0008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0710612 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 		 208 aa  44.7  0.0009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  36.9 
 
 		 294 aa  44.7  0.0009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1409  hypothetical protein  28.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2673  cyclopropane fatty acyl phospholipid synthase  28 
 
 		 384 aa  44.3  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.826358  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2116  methyltransferase  27.74 
 
 		 226 aa  43.9  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2460  methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 260 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.930517  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1734  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  29.46 
 
 		 233 aa  44.3  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>