153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1092 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1092  hypothetical protein  100 
 
 
219 aa  457  9.999999999999999e-129  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0188869  hitchhiker  0.0000127157 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2983  Methyltransferase type 12  67.82 
 
 
199 aa  284  7e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.643888  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  44.78 
 
 
200 aa  193  1e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  42.65 
 
 
201 aa  181  6e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  41.29 
 
 
199 aa  175  4e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  27.46 
 
 
390 aa  85.5  6e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  29.31 
 
 
201 aa  83.6  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  28.17 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2535  Methyltransferase type 11  27.04 
 
 
225 aa  66.2  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  31.08 
 
 
209 aa  66.2  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  24.71 
 
 
201 aa  65.1  0.0000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  34.11 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  32.03 
 
 
203 aa  62.4  0.000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  25 
 
 
207 aa  58.9  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
197 aa  56.6  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  26.92 
 
 
222 aa  55.8  0.0000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  25.38 
 
 
224 aa  55.5  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 
214 aa  55.5  0.0000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  28.3 
 
 
219 aa  55.1  0.0000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
251 aa  55.1  0.0000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4265  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00699595  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  33.54 
 
 
192 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
262 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.38 
 
 
257 aa  52.8  0.000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 
305 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
337 aa  52.4  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  28.49 
 
 
200 aa  52.4  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  27.74 
 
 
227 aa  52  0.000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  28.28 
 
 
196 aa  51.2  0.00001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  34.65 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0551  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 
255 aa  51.6  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0245261  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.79 
 
 
296 aa  50.4  0.00002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1966  methyltransferase type 11  27.86 
 
 
215 aa  50.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000755977  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  28.44 
 
 
184 aa  50.1  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  24.36 
 
 
252 aa  48.9  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1778  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.72 
 
 
265 aa  48.9  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.525506  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4348  hypothetical protein  26.67 
 
 
220 aa  49.3  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.457106  normal  0.449633 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2562  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
201 aa  48.9  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.290266  normal  0.0304213 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1926  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.541309  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2538  methyltransferase type 11  35.06 
 
 
201 aa  48.9  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0718588  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  36.45 
 
 
197 aa  48.9  0.00006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5869  hypothetical protein  36.23 
 
 
200 aa  48.5  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0641287  normal  0.24364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.64 
 
 
253 aa  48.5  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  36.99 
 
 
256 aa  48.5  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0750  hypothetical protein  27.61 
 
 
201 aa  48.5  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.85 
 
 
217 aa  48.5  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.08 
 
 
256 aa  48.5  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 
208 aa  48.5  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  28.16 
 
 
247 aa  48.5  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5548  Methyltransferase type 11  31.96 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  36.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5330  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.62 
 
 
260 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.270812  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3430  Methyltransferase type 12  27.12 
 
 
329 aa  47.8  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.723258  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  26.39 
 
 
237 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0933  methyltransferase type 12  27.73 
 
 
208 aa  47  0.0002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.275777  hitchhiker  0.00155248 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1749  UbiE/COQ5 methyltransferase  32.24 
 
 
264 aa  47  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  26.92 
 
 
210 aa  47.4  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3206  Methyltransferase type 11  28.1 
 
 
234 aa  47  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.457665  normal  0.153588 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  31.33 
 
 
364 aa  47.4  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
201 aa  47  0.0002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1770  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.03 
 
 
258 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000480921  hitchhiker  0.00972565 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1603  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.03 
 
 
258 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.463552  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1068  Methyltransferase type 12  29.46 
 
 
222 aa  47  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4249  putative biotin synthesis protein BioC  34.21 
 
 
269 aa  47  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  28 
 
 
222 aa  46.2  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.68 
 
 
237 aa  46.6  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1498  trans-aconitate 2-methyltransferase  42.03 
 
 
258 aa  46.6  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  6.87545e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 
264 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1792  methyltransferase type 11  28.43 
 
 
202 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.980769  normal  0.955485 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  35.63 
 
 
248 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.37 
 
 
256 aa  46.2  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  29.63 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 
268 aa  45.8  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0915  Methyltransferase type 12  32.08 
 
 
222 aa  45.8  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1539  Methyltransferase type 12  29.6 
 
 
312 aa  45.8  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0248  biotin biosynthesis protein BioC  38.46 
 
 
253 aa  45.8  0.0006  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.996866  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.68 
 
 
268 aa  45.4  0.0006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 
252 aa  45.4  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12360  methyltransferase family protein  31 
 
 
203 aa  45.4  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.661079  normal  0.539281 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  29.81 
 
 
247 aa  45.4  0.0007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
234 aa  45.1  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.12 
 
 
256 aa  45.1  0.0008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  23.18 
 
 
269 aa  45.1  0.0008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  29.31 
 
 
255 aa  45.1  0.0008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.42 
 
 
224 aa  45.1  0.0009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.83 
 
 
277 aa  44.7  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3612  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
256 aa  45.1  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0938  SAM-dependent methyltransferases  28.43 
 
 
201 aa  44.7  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
241 aa  44.7  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  28.97 
 
 
210 aa  45.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  26.14 
 
 
254 aa  44.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.14 
 
 
246 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  32.67 
 
 
259 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  26.71 
 
 
211 aa  44.7  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  27.62 
 
 
266 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>