More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_6054 on replicon NC_009621
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  100 
 
 		 241 aa  488  1e-137  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  54.21 
 
 		 222 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  55.61 
 
 		 227 aa  206  3e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  50 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  47.29 
 
 		 218 aa  177  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  45.15 
 
 		 215 aa  159  5e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  39.9 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  33.69 
 
 		 224 aa  83.6  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  32.8 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  35.03 
 
 		 214 aa  79.7  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2572  methyltransferase type 11  34.86 
 
 		 199 aa  78.2  0.0000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00406147  unclonable  0.0000000336172 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 221 aa  75.9  0.0000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  31.03 
 
 		 390 aa  71.6  0.00000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  27.33 
 
 		 201 aa  70.1  0.00000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  26.84 
 
 		 217 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0899  methyltransferase type 11  30.15 
 
 		 201 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  31.43 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  32.61 
 
 		 225 aa  65.1  0.000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01823  Methyltransferase type 11  27.67 
 
 		 200 aa  63.9  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.380178  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  31.85 
 
 		 208 aa  64.3  0.000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 		 259 aa  63.9  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  32.87 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  30.81 
 
 		 210 aa  63.5  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.11 
 
 		 210 aa  62.8  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  27.98 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  42.52 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1592  methyltransferase type 11  32.05 
 
 		 225 aa  62  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.367784  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.33 
 
 		 250 aa  61.6  0.00000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  27.36 
 
 		 238 aa  61.6  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  32.72 
 
 		 291 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  40.87 
 
 		 252 aa  60.5  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2771  Methyltransferase type 12  32.75 
 
 		 199 aa  60.5  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4343  Methyltransferase type 11  33.77 
 
 		 415 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.414925  normal  0.473204 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2489  methyltransferase type 11  37.07 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.910654  normal  0.230216 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  28.72 
 
 		 200 aa  60.1  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1663  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 243 aa  59.7  0.00000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.639645  normal  0.0934074 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1325  methyltransferase type 12  39.09 
 
 		 240 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000858625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  33.55 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  37.17 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  27.98 
 
 		 203 aa  58.5  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2822  hypothetical protein  33.33 
 
 		 200 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.201237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  27.84 
 
 		 211 aa  57.8  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1686  Methyltransferase type 11  29.25 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.776814  normal  0.112952 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  32.5 
 
 		 196 aa  57.4  0.0000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  36.89 
 
 		 258 aa  56.6  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  34.25 
 
 		 219 aa  57  0.0000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  34.33 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  35.71 
 
 		 541 aa  56.2  0.0000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  29.63 
 
 		 263 aa  56.2  0.0000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  30.77 
 
 		 783 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 217 aa  55.8  0.0000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2971  Generic methyltransferase  34.9 
 
 		 200 aa  55.8  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.294264  normal  0.814895 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  31.72 
 
 		 222 aa  55.8  0.0000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  31.29 
 
 		 196 aa  55.8  0.0000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  33.56 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  41.1 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  37.08 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  41.1 
 
 		 541 aa  55.5  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2337  methyltransferase type 12  30.81 
 
 		 440 aa  55.8  0.0000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  31.63 
 
 		 236 aa  55.5  0.0000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  30.07 
 
 		 242 aa  55.1  0.0000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  31.35 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  28.8 
 
 		 202 aa  54.7  0.000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  34.81 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3089  putative methyltransferase  41.51 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  29.66 
 
 		 296 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  41.1 
 
 		 541 aa  54.7  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  36.36 
 
 		 209 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  34.35 
 
 		 271 aa  55.1  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0348  hypothetical protein  28.42 
 
 		 208 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.11153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  31.25 
 
 		 218 aa  53.9  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 		 228 aa  54.3  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2499  methyltransferase type 12  31.58 
 
 		 203 aa  53.9  0.000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.301518 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  32.14 
 
 		 248 aa  54.3  0.000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  25.17 
 
 		 281 aa  54.3  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  36.07 
 
 		 196 aa  53.5  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  30.67 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.67 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0944  2-polyprenyl-3-methyl-5-hydroxy-6-metoxy-1 4-benzoquinol methylase  29.65 
 
 		 263 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  41.51 
 
 		 251 aa  53.5  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0727  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  35.58 
 
 		 406 aa  53.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.560156  normal  0.551186 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2139  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 		 240 aa  53.5  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0101077 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04350  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  41.82 
 
 		 155 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  26.71 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  31.33 
 
 		 236 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.85 
 
 		 224 aa  53.5  0.000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  28.49 
 
 		 217 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  39.62 
 
 		 258 aa  53.1  0.000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.92 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  31.91 
 
 		 275 aa  53.1  0.000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1466  Methyltransferase type 12  27.22 
 
 		 199 aa  53.1  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 261 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  31.33 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5201  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.8 
 
 		 283 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  29.41 
 
 		 264 aa  52.4  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0632  biotin synthesis protein BioC  33.56 
 
 		 312 aa  52.4  0.000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000104697  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_16961  SAM-binding motif-containing protein  43.75 
 
 		 310 aa  52.4  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>