More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3312 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  432  1e-120  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  37.86 
 
 		 217 aa  136  2e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  36.87 
 
 		 219 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  34.44 
 
 		 214 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  30.05 
 
 		 215 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  32.67 
 
 		 210 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 221 aa  100  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  41.38 
 
 		 120 aa  84.7  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  29.65 
 
 		 226 aa  82.8  0.000000000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0144  dethiobiotin synthase  31.48 
 
 		 474 aa  66.6  0.0000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211479  normal  0.0379424 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  28.05 
 
 		 227 aa  65.1  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 215 aa  63.2  0.000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  36.79 
 
 		 220 aa  62.4  0.000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  26.9 
 
 		 219 aa  62  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  34.65 
 
 		 258 aa  61.6  0.000000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  31.51 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5075  Methyltransferase type 11  39.42 
 
 		 390 aa  61.2  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.305771 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  29.71 
 
 		 222 aa  60.1  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1231  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  37.4 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.5 
 
 		 269 aa  58.9  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  27.54 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 241 aa  58.2  0.00000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  28.19 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3331  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 395 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3023  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 263 aa  57  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408274  normal  0.782878 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.24 
 
 		 220 aa  57  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  29.37 
 
 		 251 aa  57  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2618  hypothetical protein  34.11 
 
 		 399 aa  56.2  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.308953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  32.62 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 		 218 aa  55.1  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  33.72 
 
 		 247 aa  55.1  0.0000008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2631  Methyltransferase type 12  33.64 
 
 		 399 aa  54.7  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1299  methyltransferase type 12  44.07 
 
 		 251 aa  55.1  0.0000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02230  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.79 
 
 		 224 aa  54.3  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.11 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 259 aa  54.3  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  27.17 
 
 		 299 aa  54.3  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2206  methyltransferase type 12  32.77 
 
 		 403 aa  54.7  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.404913  normal  0.13279 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  41.27 
 
 		 255 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.41 
 
 		 258 aa  53.5  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  33.65 
 
 		 242 aa  53.9  0.000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.88 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  34.88 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.88 
 
 		 243 aa  53.5  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  34.88 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  28.89 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  28.89 
 
 		 260 aa  52.8  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.88 
 
 		 252 aa  53.1  0.000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  43.75 
 
 		 257 aa  52.8  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.21 
 
 		 217 aa  52.8  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  28.09 
 
 		 243 aa  52.4  0.000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  23.18 
 
 		 264 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1395  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  30.83 
 
 		 430 aa  52.4  0.000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.196126  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1653  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 252 aa  52  0.000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.217982  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 283 aa  52.4  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  27.91 
 
 		 267 aa  52  0.000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  33.96 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3635  hypothetical protein  30.09 
 
 		 263 aa  51.6  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2067  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 		 262 aa  51.6  0.000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 252 aa  51.6  0.000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  39.39 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  42.37 
 
 		 333 aa  50.8  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1765  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.41 
 
 		 264 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.736943  hitchhiker  0.00277995 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1011  putative biotin synthesis protein BioC  28.71 
 
 		 269 aa  50.8  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4226  putative biotin synthesis protein BioC  28.71 
 
 		 269 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1881  biotin biosynthesis protein BioC  23.65 
 
 		 266 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0598822  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  40.62 
 
 		 258 aa  50.4  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 237 aa  50.1  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0563  methyltransferase type 11  45.45 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.149497  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.72 
 
 		 252 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0024  biotin biosynthesis protein BioC  31.73 
 
 		 283 aa  50.1  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00323673  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  32.26 
 
 		 264 aa  49.7  0.00003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  31.96 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  30.83 
 
 		 246 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0058  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferases  39.74 
 
 		 239 aa  49.7  0.00003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  29.21 
 
 		 203 aa  49.7  0.00003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 276 aa  49.7  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.26 
 
 		 258 aa  49.3  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2054  hypothetical protein  28.95 
 
 		 313 aa  49.3  0.00004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.638121  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1816  Trans-aconitate 2-methyltransferase  28.47 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000117275 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_51145  predicted protein  28.21 
 
 		 363 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4668  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.79 
 
 		 205 aa  48.9  0.00005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  29.77 
 
 		 248 aa  48.9  0.00005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 286 aa  48.9  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0720  Methyltransferase type 12  31.82 
 
 		 400 aa  48.9  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0561538  normal  0.0810858 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0386  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0397352  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  30 
 
 		 252 aa  48.9  0.00006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0395  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  37.88 
 
 		 237 aa  48.9  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0374  trans-aconitate 2-methyltransferase  38.46 
 
 		 254 aa  48.9  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.603842  normal  0.758289 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  32.31 
 
 		 210 aa  48.1  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1418  Methyltransferase type 11  27.56 
 
 		 248 aa  48.1  0.00008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 		 214 aa  48.5  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 251 aa  48.5  0.00008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0329  hypothetical protein  33.64 
 
 		 414 aa  48.1  0.00009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0364813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.38 
 
 		 255 aa  48.1  0.00009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>