More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewana3_2249 on replicon NC_008577
Organism: Shewanella sp. ANA-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  40.65 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  44.34 
 
 		 210 aa  185  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  43 
 
 		 219 aa  185  6e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  83.51 
 
 		 120 aa  178  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  36.32 
 
 		 226 aa  158  7e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  35.71 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  37.86 
 
 		 211 aa  136  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  33.18 
 
 		 221 aa  127  1.0000000000000001e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  26.98 
 
 		 241 aa  68.6  0.00000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  26.17 
 
 		 211 aa  63.9  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  29.03 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  31.29 
 
 		 266 aa  61.6  0.000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  25.79 
 
 		 222 aa  59.3  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  27.74 
 
 		 237 aa  58.9  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  25.17 
 
 		 207 aa  58.5  0.00000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  27.91 
 
 		 227 aa  58.5  0.00000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 215 aa  58.2  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  27.69 
 
 		 243 aa  57.8  0.0000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  25.56 
 
 		 201 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  27.38 
 
 		 217 aa  57.8  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 247 aa  57  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 262 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  27.33 
 
 		 219 aa  56.2  0.0000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  33.03 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  24.2 
 
 		 400 aa  54.7  0.0000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.1 
 
 		 239 aa  54.3  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2481  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.63 
 
 		 235 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.817194 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  30.16 
 
 		 258 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  27.06 
 
 		 217 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 224 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.1 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  24.86 
 
 		 225 aa  53.9  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  26.75 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  26.63 
 
 		 364 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  30.1 
 
 		 237 aa  53.5  0.000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  53.1  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.58 
 
 		 272 aa  52.8  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2809  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase ubie  27.63 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 		 209 aa  52.8  0.000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.47 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1652  Methyltransferase type 11  32.06 
 
 		 262 aa  52.8  0.000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.500065  normal  0.075168 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01476  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2127  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01487  hypothetical protein  31.96 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2139  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 252 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.15 
 
 		 221 aa  52.4  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1690  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.96 
 
 		 243 aa  52  0.000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00892197  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.15 
 
 		 261 aa  52.4  0.000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2132  trans-aconitate 2-methyltransferase  34 
 
 		 252 aa  52  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.523623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.57 
 
 		 253 aa  52  0.000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  34.04 
 
 		 201 aa  52  0.000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  34 
 
 		 252 aa  51.6  0.000009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.335531  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3506  methyltransferase type 11  26.85 
 
 		 299 aa  50.8  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.03 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.93 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.03 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  31.3 
 
 		 285 aa  51.2  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  26.42 
 
 		 217 aa  50.8  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  31.58 
 
 		 258 aa  51.2  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2699  methyltransferase type 12  22.67 
 
 		 231 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7775  hypothetical protein  25 
 
 		 251 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2840  MCP methyltransferase, CheR-type  24.49 
 
 		 207 aa  50.4  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.698056  normal  0.8759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  29.87 
 
 		 244 aa  50.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  29.91 
 
 		 231 aa  49.7  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 		 226 aa  50.1  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  33.33 
 
 		 256 aa  49.7  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.58 
 
 		 210 aa  50.1  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0832  biotin biosynthesis protein BioC  29.77 
 
 		 251 aa  50.1  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000189171  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.14 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.04 
 
 		 258 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  24.29 
 
 		 284 aa  49.7  0.00004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1601  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.93 
 
 		 252 aa  49.7  0.00004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.767111  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  27.83 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.25 
 
 		 261 aa  49.3  0.00005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0923  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 		 251 aa  49.3  0.00005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00600636  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1580  type 11 methyltransferase  25.17 
 
 		 258 aa  49.3  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.487753 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1742  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 247 aa  48.9  0.00005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.455146  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  29.37 
 
 		 257 aa  48.9  0.00005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.94 
 
 		 269 aa  48.9  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00744  predicted methltransferase, enzyme of biotin synthesis  28.93 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00000740427  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2865  biotin biosynthesis protein BioC  28.93 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134794  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  23.23 
 
 		 218 aa  48.9  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00761  hypothetical protein  28.93 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000873779  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1234  Methyltransferase type 12  33.68 
 
 		 269 aa  48.9  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.186171 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0891  biotin biosynthesis protein BioC  30 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0441055  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2866  biotin biosynthesis protein BioC  28.93 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000576262  normal  0.0541364 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0831  biotin biosynthesis protein BioC  28.93 
 
 		 251 aa  48.9  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000107707  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4717  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  26.11 
 
 		 240 aa  48.5  0.00007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970873 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 		 222 aa  48.5  0.00007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  23.96 
 
 		 284 aa  48.5  0.00008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  25.85 
 
 		 227 aa  48.1  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3467  Trans-aconitate 2-methyltransferase  30 
 
 		 257 aa  48.1  0.00009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>