196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1771 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1771  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  250  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.852905  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  83.51 
 
 		 217 aa  178  2e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  49.06 
 
 		 219 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1969  methyltransferase type 11  43.01 
 
 		 214 aa  93.6  8e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00620087  normal  0.0463791 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1373  methyltransferase type 12  46.07 
 
 		 226 aa  92.4  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2664  methyltransferase type 11  47.31 
 
 		 210 aa  90.5  7e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000744585  normal  0.0352829 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  41.38 
 
 		 211 aa  84.7  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  41.3 
 
 		 215 aa  84  6e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0981  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 		 221 aa  70.5  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5169  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.59 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3331  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.75 
 
 		 262 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.911002 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5272  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 257 aa  53.9  0.0000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.167219  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2002  Trans-aconitate 2-methyltransferase  36.52 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.681077 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5925  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 		 258 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  30.11 
 
 		 224 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4775  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 253 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3392  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 221 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.603365  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4124  trans-aconitate 2-methyltransferase  35 
 
 		 261 aa  53.1  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.104917 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_10909  conserved hypothetical protein  36.56 
 
 		 333 aa  52.4  0.000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00364748  normal  0.0877124 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 237 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2805  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.9 
 
 		 261 aa  52  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.85 
 
 		 222 aa  51.6  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2250  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Pas/Pac sensor  100 
 
 		 435 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.32107 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 217 aa  52  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  31.18 
 
 		 210 aa  51.2  0.000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  29.82 
 
 		 217 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0807  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2203  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.47 
 
 		 258 aa  49.7  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.968625  hitchhiker  0.00608144 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0780  Methyltransferase type 11  36 
 
 		 200 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  40.43 
 
 		 247 aa  49.7  0.00001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0252  Methyltransferase type 12  31.71 
 
 		 227 aa  48.9  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.965523  hitchhiker  0.00106675 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  30.43 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0237  methyltransferase type 11  34.94 
 
 		 259 aa  49.3  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.635147  decreased coverage  0.000545483 
 
 
-
 
NC_004310  BR1455  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1327  trans-aconitate methyltransferase, putative  39.47 
 
 		 256 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1410  trans-aconitate 2-methyltransferase  36.36 
 
 		 255 aa  48.9  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 249 aa  48.9  0.00003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  31.11 
 
 		 239 aa  48.1  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  31.11 
 
 		 237 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  38.89 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.87 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3407  type 11 methyltransferase  33.33 
 
 		 202 aa  48.1  0.00004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3852  trans-aconitate 2-methyltransferase  37.66 
 
 		 269 aa  48.1  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.223127  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0211  methyltransferase type 11  36.05 
 
 		 266 aa  48.1  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  38.89 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2481  trans-aconitate 2-methyltransferase  35.14 
 
 		 256 aa  47.8  0.00005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0101749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  38.89 
 
 		 249 aa  47.8  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1408  Methyltransferase type 11  32.99 
 
 		 222 aa  47.4  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.464916  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3459  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.33 
 
 		 256 aa  47.4  0.00007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.064868  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1142  trans-aconitate 2-methyltransferase  33.78 
 
 		 258 aa  47.4  0.00007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3424  Methyltransferase type 11  30.68 
 
 		 203 aa  47.4  0.00008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  47  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0077  trans-aconitate methyltransferase  34.85 
 
 		 258 aa  47  0.00009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.11 
 
 		 237 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  39.66 
 
 		 231 aa  47  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  46.6  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  37.5 
 
 		 249 aa  46.2  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2136  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.57 
 
 		 256 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.000208135  decreased coverage  0.00294275 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29120  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  29.29 
 
 		 203 aa  46.6  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2838  Methyltransferase type 11  37.7 
 
 		 264 aa  46.2  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000986934  normal  0.0303756 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1719  trans-aconitate 2-methyltransferase  40 
 
 		 255 aa  47  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4126  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.11 
 
 		 256 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.613741  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  29.35 
 
 		 400 aa  46.2  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  29.17 
 
 		 214 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  38.46 
 
 		 243 aa  45.1  0.0003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  37.5 
 
 		 249 aa  45.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  28.57 
 
 		 207 aa  45.1  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  45.1  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1576  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  30.95 
 
 		 229 aa  45.1  0.0003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0819441  unclonable  0.000000165496 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07351  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  43.48 
 
 		 231 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.138217  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.12 
 
 		 225 aa  45.1  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1297  trans-aconitate 2-methyltransferase  31.63 
 
 		 249 aa  45.4  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.44 
 
 		 220 aa  44.7  0.0004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  43.48 
 
 		 247 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2909  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.43 
 
 		 256 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0465109  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0364  methyltransferase type 11  24.66 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.617778  normal  0.54237 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0176  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  26.44 
 
 		 220 aa  45.1  0.0004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2516  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.97 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.158942  normal  0.172126 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0662  hypothetical protein  45.45 
 
 		 231 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2412  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.97 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.114708  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0757  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.137769  normal  0.156895 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2461  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.97 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.88889  normal  0.0528077 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2503  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.97 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2430  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.67 
 
 		 268 aa  44.7  0.0005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_07171  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  45.65 
 
 		 231 aa  44.3  0.0005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2620  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  32.97 
 
 		 242 aa  44.7  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0890164  normal  0.121795 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_07151  methylase  45.65 
 
 		 235 aa  44.7  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.353179  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10301  trans-aconitate 2-methyltransferase  34.78 
 
 		 261 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 215 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0388  Methyltransferase type 11  32 
 
 		 226 aa  44.3  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0410842 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48751  predicted protein  36.54 
 
 		 263 aa  44.3  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.229786  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2186  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  31.25 
 
 		 239 aa  43.9  0.0007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0852291  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  43.18 
 
 		 284 aa  43.9  0.0007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0005  methyltransferase  38.46 
 
 		 267 aa  43.9  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.168517  normal  0.967482 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0320  hypothetical protein  32.39 
 
 		 290 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3491  methyltransferase type 11  30.77 
 
 		 364 aa  43.9  0.0008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>