284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_2368 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 237 aa  486  1e-136  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  50.42 
 
 		 237 aa  256  2e-67  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  47.48 
 
 		 264 aa  246  2e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  39.83 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  30.17 
 
 		 241 aa  112  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 244 aa  101  8e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.86 
 
 		 244 aa  94.4  1e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 		 245 aa  87.4  2e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  26.53 
 
 		 251 aa  82.8  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  26.12 
 
 		 239 aa  77.8  0.0000000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.42 
 
 		 253 aa  64.7  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  27.35 
 
 		 237 aa  62.4  0.000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.35 
 
 		 237 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  28 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  31.5 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.35 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  29.93 
 
 		 237 aa  60.1  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 		 233 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  32 
 
 		 201 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.91 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.91 
 
 		 237 aa  59.3  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.84 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2959  Methyltransferase type 12  30.77 
 
 		 196 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0135677 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.78 
 
 		 217 aa  58.9  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  31 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  31 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  31 
 
 		 201 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 250 aa  57  0.0000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  22.38 
 
 		 276 aa  57  0.0000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3306  Methyltransferase type 12  30 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0246311 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3026  hypothetical protein  31.36 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000455995  normal  0.015635 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  27.22 
 
 		 248 aa  56.2  0.0000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  30.71 
 
 		 247 aa  56.2  0.0000005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  29.91 
 
 		 275 aa  55.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 		 252 aa  55.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  29 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  24.8 
 
 		 262 aa  54.7  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0462  methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 215 aa  53.9  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.84 
 
 		 246 aa  54.3  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  23.67 
 
 		 280 aa  53.9  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  26.59 
 
 		 247 aa  54.3  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  32.77 
 
 		 268 aa  54.3  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  28 
 
 		 201 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_004310  BR0114  hypothetical protein  30.16 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1958  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  53.1  0.000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  28.12 
 
 		 201 aa  53.1  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0111  hypothetical protein  30.16 
 
 		 262 aa  53.5  0.000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0314967  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  35.63 
 
 		 199 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  33.06 
 
 		 400 aa  53.1  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  31.17 
 
 		 207 aa  53.1  0.000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  28.18 
 
 		 227 aa  53.1  0.000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  28.57 
 
 		 236 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0154  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 		 218 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.733212 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2106  hypothetical protein  28.57 
 
 		 209 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.808335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  26.19 
 
 		 269 aa  52.8  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  25.59 
 
 		 259 aa  52.8  0.000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  27.68 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  27.68 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3138  Methyltransferase type 11  26.4 
 
 		 255 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.893116  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  30.23 
 
 		 259 aa  52  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  30.69 
 
 		 205 aa  52.4  0.000007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00760  methyltransferase family protein  33.01 
 
 		 200 aa  52  0.000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.226135 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  27.68 
 
 		 236 aa  52  0.000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  25 
 
 		 262 aa  52  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2281  Methyltransferase type 11  32.08 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.316994  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  28.57 
 
 		 199 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  25.11 
 
 		 246 aa  51.6  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  36.23 
 
 		 254 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 254 aa  50.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  27.32 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 247 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  28.37 
 
 		 241 aa  50.4  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25.9 
 
 		 272 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2249  methyltransferase type 12  32.56 
 
 		 217 aa  51.2  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.200806 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3370  methyltransferase type 12  28 
 
 		 200 aa  50.4  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.211091  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  30.09 
 
 		 253 aa  50.1  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  29.51 
 
 		 281 aa  50.1  0.00003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3198  methyltransferase  27.68 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  27.61 
 
 		 232 aa  50.1  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 		 262 aa  49.7  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0502  putative methyltransferase  32.11 
 
 		 217 aa  49.7  0.00004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.925229  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  26.04 
 
 		 201 aa  49.3  0.00005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  24.06 
 
 		 390 aa  49.3  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  31.31 
 
 		 206 aa  49.3  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  28.79 
 
 		 219 aa  48.9  0.00006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.579245 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0321  methyltransferase type 12  26.5 
 
 		 210 aa  48.9  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.034044  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0498  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 		 229 aa  49.3  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00216878  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1459  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 250 aa  48.9  0.00007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3312  hypothetical protein  37.88 
 
 		 211 aa  48.9  0.00007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0640  methyltransferase type 11  31 
 
 		 197 aa  48.5  0.00008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2788  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  28.57 
 
 		 238 aa  48.5  0.00008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00000608227  hitchhiker  0.00134688 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14310  methyltransferase family protein  28.81 
 
 		 203 aa  48.5  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000424047  normal  0.17609 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  25.93 
 
 		 442 aa  48.5  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  34 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3087  hypothetical protein  27.09 
 
 		 252 aa  47.8  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.124312  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>