221 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_3161 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  100 
 
 		 247 aa  517  1e-146  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  80.57 
 
 		 261 aa  430  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  74.09 
 
 		 247 aa  386  1e-106  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  72.84 
 
 		 250 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  71.66 
 
 		 260 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  72.06 
 
 		 247 aa  367  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  67.21 
 
 		 247 aa  358  4e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  65.71 
 
 		 250 aa  355  1.9999999999999998e-97  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  64.37 
 
 		 249 aa  351  7e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  62.86 
 
 		 255 aa  345  3e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  62.21 
 
 		 263 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  62.75 
 
 		 247 aa  345  5e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  61.92 
 
 		 261 aa  342  4e-93  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  61.45 
 
 		 263 aa  341  5e-93  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  61.54 
 
 		 261 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  62.86 
 
 		 281 aa  339  2.9999999999999998e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  61.54 
 
 		 247 aa  336  1.9999999999999998e-91  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  57.75 
 
 		 285 aa  333  2e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  57.39 
 
 		 285 aa  332  5e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  57.39 
 
 		 285 aa  331  7.000000000000001e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  57.39 
 
 		 285 aa  329  2e-89  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  43.95 
 
 		 248 aa  211  7.999999999999999e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 		 257 aa  79  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 		 247 aa  76.6  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  37.07 
 
 		 152 aa  77  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.61 
 
 		 222 aa  69.3  0.00000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 249 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  34.04 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  23.53 
 
 		 233 aa  66.2  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 244 aa  66.2  0.0000000004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.21 
 
 		 296 aa  65.5  0.0000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  30.5 
 
 		 243 aa  65.5  0.0000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  36.46 
 
 		 237 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  30.36 
 
 		 248 aa  64.3  0.000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  32.69 
 
 		 266 aa  63.2  0.000000004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  30.66 
 
 		 258 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 254 aa  62.4  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 232 aa  61.2  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26.62 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  31.31 
 
 		 242 aa  60.8  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  27.01 
 
 		 242 aa  60.1  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  29.45 
 
 		 286 aa  60.1  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  21.46 
 
 		 241 aa  59.7  0.00000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.17 
 
 		 275 aa  57.4  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0996  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 246 aa  56.6  0.0000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.14 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 252 aa  56.2  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.96 
 
 		 189 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  35.58 
 
 		 291 aa  55.8  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  24.64 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  24.64 
 
 		 245 aa  55.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.01 
 
 		 276 aa  55.8  0.0000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  27.81 
 
 		 237 aa  55.1  0.0000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 260 aa  55.5  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  28.97 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  34.29 
 
 		 234 aa  54.7  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  33.96 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  30.61 
 
 		 237 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  32 
 
 		 264 aa  55.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  29.91 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  31.19 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.6 
 
 		 247 aa  54.7  0.000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  27.14 
 
 		 238 aa  55.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  27 
 
 		 261 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 		 272 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  32.69 
 
 		 269 aa  54.7  0.000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  29.17 
 
 		 237 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  32.14 
 
 		 256 aa  53.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 		 259 aa  53.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  21.91 
 
 		 244 aa  53.1  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  31.01 
 
 		 227 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  32.2 
 
 		 269 aa  52.4  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  27 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  27.4 
 
 		 251 aa  52.4  0.000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  27 
 
 		 262 aa  52.4  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  25.38 
 
 		 220 aa  52  0.000008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27 
 
 		 261 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 249 aa  52  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3704  methyltransferase type 11  35.24 
 
 		 244 aa  52  0.000009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  27.08 
 
 		 237 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  52  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  34.62 
 
 		 269 aa  51.6  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  31.93 
 
 		 211 aa  51.2  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.67 
 
 		 251 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  26.32 
 
 		 239 aa  50.4  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  29.41 
 
 		 201 aa  50.4  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0014  UbiE/COQ5 family methlytransferase  30.77 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  24.2 
 
 		 245 aa  50.4  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 261 aa  51.2  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  25 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  28.28 
 
 		 199 aa  51.2  0.00002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  28.83 
 
 		 237 aa  50.4  0.00002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>