155 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_B0013 on replicon NC_004632
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  100 
 
 		 260 aa  545  1e-154  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  81.38 
 
 		 247 aa  418  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  79.35 
 
 		 247 aa  395  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  70.45 
 
 		 261 aa  369  1e-101  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  71.66 
 
 		 247 aa  370  1e-101  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  67.62 
 
 		 250 aa  365  1e-100  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  66.94 
 
 		 250 aa  358  3e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  68.42 
 
 		 247 aa  359  3e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  65.99 
 
 		 249 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  65.31 
 
 		 255 aa  354  6.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  63.08 
 
 		 261 aa  351  7e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  62.6 
 
 		 263 aa  351  8e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  62.69 
 
 		 261 aa  349  2e-95  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  64.37 
 
 		 247 aa  348  4e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  62.21 
 
 		 263 aa  345  4e-94  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  63.56 
 
 		 247 aa  345  4e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  58.8 
 
 		 285 aa  343  1e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  58.45 
 
 		 285 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  62.3 
 
 		 281 aa  341  7e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  58.8 
 
 		 285 aa  340  9e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  58.45 
 
 		 285 aa  340  1e-92  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  43.95 
 
 		 248 aa  207  1e-52  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  35.21 
 
 		 244 aa  68.6  0.0000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  25.71 
 
 		 233 aa  66.6  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.75 
 
 		 266 aa  65.5  0.0000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 		 247 aa  65.1  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  34.95 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 		 258 aa  63.9  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  33.83 
 
 		 243 aa  63.5  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.08 
 
 		 276 aa  63.9  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  33.61 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  35.51 
 
 		 248 aa  62.4  0.000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  31.69 
 
 		 269 aa  61.6  0.00000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.68 
 
 		 247 aa  61.2  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  27.41 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  29.73 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  26.62 
 
 		 249 aa  58.2  0.0000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  31.9 
 
 		 152 aa  57.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 220 aa  57.4  0.0000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  27.97 
 
 		 237 aa  57  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  35.42 
 
 		 272 aa  56.2  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 242 aa  56.2  0.0000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  26.02 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 244 aa  55.5  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  20.93 
 
 		 275 aa  55.5  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.38 
 
 		 296 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31 
 
 		 237 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  30.17 
 
 		 246 aa  55.1  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 249 aa  55.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  35.24 
 
 		 234 aa  55.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  53.9  0.000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  29.93 
 
 		 245 aa  54.3  0.000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  28.06 
 
 		 249 aa  53.5  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  28.06 
 
 		 249 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 242 aa  53.9  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  32.12 
 
 		 254 aa  53.1  0.000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  31.78 
 
 		 256 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.59 
 
 		 259 aa  53.1  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  25.87 
 
 		 237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  26.72 
 
 		 280 aa  53.1  0.000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  25.87 
 
 		 237 aa  52.8  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  27.41 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  27.41 
 
 		 238 aa  52.8  0.000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  32.17 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.11 
 
 		 276 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  29.92 
 
 		 251 aa  52.4  0.000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  30.84 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 256 aa  52  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  43.24 
 
 		 291 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 		 248 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 		 286 aa  51.6  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  34.21 
 
 		 246 aa  50.8  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  25.17 
 
 		 239 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  31.07 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3508  trans-aconitate 2-methyltransferase  32.81 
 
 		 257 aa  50.4  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.510981  normal  0.74985 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.41 
 
 		 256 aa  50.1  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 249 aa  50.1  0.00004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  26.62 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  49.7  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  24.29 
 
 		 234 aa  49.7  0.00005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  25.17 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  26.62 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  25.17 
 
 		 237 aa  49.3  0.00006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  26.62 
 
 		 249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  31.07 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  31.07 
 
 		 262 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  31.07 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 260 aa  48.9  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  31.07 
 
 		 261 aa  48.5  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  23.87 
 
 		 250 aa  48.5  0.0001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  27.08 
 
 		 231 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.02 
 
 		 189 aa  47.8  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  38.1 
 
 		 305 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  24.48 
 
 		 237 aa  47  0.0003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  27.08 
 
 		 251 aa  47  0.0003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>