More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2080 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2080  Methyltransferase type 11  100 
 
 
211 aa  431  1e-120  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.587807  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  35.41 
 
 
224 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0032  Methyltransferase type 11  34.74 
 
 
214 aa  95.1  7e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1744  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
208 aa  93.2  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.370117 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  34.31 
 
 
227 aa  87.8  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2543  Methyltransferase type 11  29.02 
 
 
210 aa  87  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1335  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
208 aa  85.5  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  32.8 
 
 
241 aa  82  0.000000000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1419  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
211 aa  79.7  0.00000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
234 aa  76.3  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  29.01 
 
 
390 aa  75.9  0.0000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0824  methyltransferase type 11  23.81 
 
 
201 aa  75.9  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3275  Methyltransferase type 11  42.5 
 
 
271 aa  74.3  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.477394  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1080  Methyltransferase type 11  34.07 
 
 
215 aa  73.6  0.000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  32.3 
 
 
222 aa  69.3  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2535  methyltransferase type 12  32.4 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.444646  normal  0.207866 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2808  methyltransferase type 11  34.27 
 
 
275 aa  65.9  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.1 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1170  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
207 aa  65.9  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0322636  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1762  Methyltransferase type 11  27.15 
 
 
201 aa  65.5  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
218 aa  65.1  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3274  Methyltransferase type 11  32.16 
 
 
261 aa  65.1  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.689568  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0834  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.05 
 
 
237 aa  65.1  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.293263  normal  0.0185746 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1626  methyltransferase  26.96 
 
 
202 aa  64.3  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.542938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0834  Methyltransferase type 12  34.08 
 
 
205 aa  63.2  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5212  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38 
 
 
200 aa  62.4  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0540942  normal  0.787552 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1388  Methyltransferase type 11  34.04 
 
 
194 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2332  methyltransferase type 11  37.82 
 
 
279 aa  62  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.214932 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0464  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  31.25 
 
 
259 aa  61.6  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
240 aa  61.6  0.000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  30.46 
 
 
215 aa  61.2  0.00000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0328  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  30.34 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0321  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
207 aa  60.1  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3205  Methyltransferase type 11  28.72 
 
 
210 aa  60.5  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1737  Methyltransferase type 11  28.14 
 
 
283 aa  60.1  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0817864  normal  0.19788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3873  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
203 aa  59.7  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.137783 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1078  SAM-dependent methyltransferase  26.49 
 
 
201 aa  59.7  0.00000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.215412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3510  methyltransferase type 11  33.08 
 
 
282 aa  59.3  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  27.45 
 
 
250 aa  58.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
246 aa  58.5  0.00000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3824  Methyltransferase type 11  30.85 
 
 
328 aa  57.4  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1575  UbiE/COQ5 methyltransferase  29.52 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0477  Methyltransferase type 11  32.71 
 
 
235 aa  56.6  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2096  type 11 methyltransferase  30.77 
 
 
207 aa  57  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.423415  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0623  methyltransferase type 11  31.67 
 
 
278 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0996998 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  34.88 
 
 
225 aa  56.6  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1589  Methyltransferase type 11  26.22 
 
 
197 aa  56.2  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09391  methyltransferase  25 
 
 
351 aa  56.6  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0891  methyltransferase type 11  36.44 
 
 
267 aa  56.2  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.304203  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1937  methyltransferase  31.58 
 
 
236 aa  55.8  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09381  methyltransferase  25 
 
 
351 aa  55.8  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.398692  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3719  methyltransferase type 12  29.45 
 
 
211 aa  55.8  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000247431  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
262 aa  55.5  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2226  methyltransferase type 11  32 
 
 
285 aa  55.5  0.0000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0827676  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0879  SAM (and some other nucleotide) binding motif:Generic methyl-transferase  25.62 
 
 
351 aa  55.1  0.0000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  35.11 
 
 
268 aa  55.1  0.0000008  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
246 aa  55.1  0.0000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0998  methyltransferase, putative  32.16 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.742454  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4566  putative S-adenosyl-L-methionine (SAM)-dependent methyltransferase  29.87 
 
 
285 aa  54.3  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.343396 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2522  methyltransferase type 11  41.24 
 
 
270 aa  54.3  0.000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0274503  normal  0.199825 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3833  methyltransferase type 11  23.78 
 
 
363 aa  54.3  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0485  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
268 aa  54.3  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
253 aa  54.3  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1979  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
240 aa  54.7  0.000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.950841 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  36.04 
 
 
196 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1913  methyltransferase  30.92 
 
 
236 aa  53.5  0.000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3731  Methyltransferase type 11  28.71 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2577  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
227 aa  53.5  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2200  hypothetical protein  38.57 
 
 
236 aa  53.9  0.000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.029444  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3033  methyltransferase type 11  30.16 
 
 
304 aa  53.9  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0058  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
354 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0257  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
208 aa  53.1  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00403327 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0317  sterol-C-methyltransferase  35.92 
 
 
304 aa  53.1  0.000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.136369  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07641  methyltransferase  34.58 
 
 
209 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.210673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8582  methyltransferase type 11  35.54 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.563755  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17081  SAM-binding motif-containing protein  34.51 
 
 
311 aa  53.1  0.000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  38.14 
 
 
259 aa  52.8  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1951  methyltransferase type 11  37.68 
 
 
226 aa  52.4  0.000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.319095  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1896  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.14 
 
 
285 aa  52.8  0.000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.656482  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3896  methyltransferase type 11  30.13 
 
 
208 aa  52.8  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.744662  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  26.23 
 
 
263 aa  52.8  0.000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2522  methyltransferase type 11  23.91 
 
 
199 aa  52.8  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.837662  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  33.85 
 
 
247 aa  52.8  0.000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1352  hypothetical protein  30.51 
 
 
206 aa  52.8  0.000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  31.74 
 
 
252 aa  52.8  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  29.94 
 
 
226 aa  52.4  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2186  hypothetical protein  38.57 
 
 
199 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.286296  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  27.56 
 
 
258 aa  52.4  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1597  SAM-binding motif-containing protein  33.04 
 
 
311 aa  52.4  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  35.42 
 
 
264 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1616  hypothetical protein  24.84 
 
 
238 aa  52.4  0.000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0604  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
276 aa  52.4  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1548  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
225 aa  52.4  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0478  demethylmenaquinone methyltransferase  25.43 
 
 
252 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2140  hypothetical protein  35.53 
 
 
236 aa  52.4  0.000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2196  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 
192 aa  52  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.114606  decreased coverage  0.00107741 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2926  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.79 
 
 
215 aa  52  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000153656  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
238 aa  52  0.000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>