295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_2119 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  100 
 
 
234 aa  480  1e-135  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  41.1 
 
 
237 aa  193  2e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  37.71 
 
 
264 aa  188  8e-47  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  39.83 
 
 
237 aa  181  8.000000000000001e-45  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
241 aa  103  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.89 
 
 
251 aa  100  3e-20  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.16 
 
 
244 aa  98.6  8e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
244 aa  95.9  5e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1258  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 
245 aa  90.1  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.760119 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  28.4 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  27 
 
 
231 aa  75.9  0.0000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  23.31 
 
 
252 aa  64.3  0.000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7096  Methyltransferase type 11  33.05 
 
 
208 aa  61.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.517227  normal  0.260224 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  29.93 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  29.5 
 
 
250 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  29.93 
 
 
254 aa  58.5  0.00000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1400  methyltransferase type 11  33.03 
 
 
218 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  27.97 
 
 
247 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  28.67 
 
 
247 aa  57  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2782  hypothetical protein  35.2 
 
 
400 aa  57  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  33.66 
 
 
252 aa  56.6  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  28.17 
 
 
247 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  26.94 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  34.69 
 
 
268 aa  55.5  0.0000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  34.29 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  29.06 
 
 
250 aa  55.5  0.0000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  28.66 
 
 
261 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
263 aa  55.5  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0757  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
442 aa  55.5  0.0000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25 
 
 
247 aa  55.1  0.0000009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  26.85 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  29.5 
 
 
286 aa  54.7  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.45 
 
 
272 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8438  SAM-dependent methyltransferase, putative  34.65 
 
 
258 aa  54.3  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2259  methyltransferase type 11  32.73 
 
 
196 aa  54.3  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  36.56 
 
 
233 aa  54.7  0.000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  26.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  26.06 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  34.31 
 
 
259 aa  53.9  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  28.99 
 
 
246 aa  53.5  0.000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  27.27 
 
 
247 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  29.93 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1144  Methyltransferase type 11  33.67 
 
 
337 aa  53.1  0.000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.344527  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  27.74 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
238 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
442 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  26.42 
 
 
255 aa  52.4  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3350  methyltransferase type 11  35 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1780  mannosyltransferase, putative  29.81 
 
 
1635 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.731336  decreased coverage  0.0078788 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3030  type 12 methyltransferase  35.64 
 
 
258 aa  52.4  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.788601  normal  0.081497 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0890  hypothetical protein  25.25 
 
 
227 aa  52.4  0.000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6880  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
254 aa  52  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0173101  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  32.41 
 
 
200 aa  52  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2935  methyltransferase type 11  26.7 
 
 
249 aa  52  0.000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  31.15 
 
 
254 aa  52  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  25.86 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4865  Methyltransferase type 11  30.84 
 
 
218 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.743669  normal  0.127304 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2989  methyltransferase type 11  37.93 
 
 
232 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000030187 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2296  Methyltransferase type 11  30.77 
 
 
209 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000023308  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  40 
 
 
240 aa  51.6  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1074  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
436 aa  51.2  0.00001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.257037  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.39 
 
 
296 aa  51.2  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.91 
 
 
247 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  27.72 
 
 
252 aa  50.8  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4194  methyltransferase type 12  35.14 
 
 
211 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  32.61 
 
 
248 aa  50.4  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  29.7 
 
 
250 aa  51.2  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2456  methyltransferase type 11  31.39 
 
 
217 aa  50.4  0.00002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.161151  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4619  methyltransferase type 11  38.04 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.194423  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  24.57 
 
 
244 aa  49.7  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  25.52 
 
 
237 aa  50.1  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21081  hypothetical protein  26.42 
 
 
373 aa  50.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.781663  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.37 
 
 
251 aa  50.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  24.29 
 
 
260 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1388  methyltransferase type 11  28.12 
 
 
477 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.485949  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  30.71 
 
 
222 aa  49.7  0.00004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  24.69 
 
 
261 aa  49.7  0.00004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2940  methyltransferase type 11  31.16 
 
 
224 aa  49.7  0.00004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  29.67 
 
 
249 aa  49.7  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  21.16 
 
 
276 aa  49.7  0.00004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  29.93 
 
 
234 aa  49.3  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4520  methyltransferase domain protein  26.92 
 
 
783 aa  49.3  0.00006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  29.13 
 
 
220 aa  48.9  0.00006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0896  Methyltransferase type 11  36.19 
 
 
262 aa  48.9  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0267941  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2016  Methyltransferase type 11  34.68 
 
 
276 aa  48.9  0.00006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.544717 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02209  Biotin biosynthesis protein BioC  37.68 
 
 
325 aa  48.9  0.00006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.28779  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2370  methyltransferase type 11  27.27 
 
 
219 aa  49.3  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00258532 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2815  Methyltransferase type 12  27.48 
 
 
232 aa  48.9  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  30.39 
 
 
261 aa  48.5  0.00008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  32.74 
 
 
228 aa  48.5  0.00009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1232  methyltransferase type 11  36.14 
 
 
238 aa  48.5  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.976917  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  28.87 
 
 
241 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  22.55 
 
 
243 aa  47.8  0.0001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  27.36 
 
 
249 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  31.86 
 
 
201 aa  47.8  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1121  methyltransferase type 11  31.13 
 
 
195 aa  48.1  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.510449  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>