190 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_3449 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  100 
 
 
261 aa  548  1e-155  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  98.1 
 
 
263 aa  536  9.999999999999999e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  95.79 
 
 
261 aa  523  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  87.45 
 
 
263 aa  483  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  80 
 
 
285 aa  467  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  79.65 
 
 
285 aa  464  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  79.65 
 
 
285 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  79.65 
 
 
285 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  73.46 
 
 
249 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  64.62 
 
 
250 aa  357  9e-98  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  64.23 
 
 
261 aa  352  2e-96  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  63.08 
 
 
260 aa  351  7e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  62.69 
 
 
247 aa  350  2e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2792  methyltransferase type 11  63.42 
 
 
281 aa  348  4e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  63.46 
 
 
247 aa  347  9e-95  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  63.08 
 
 
247 aa  346  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  63.08 
 
 
247 aa  345  5e-94  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  63.32 
 
 
250 aa  345  5e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  61.92 
 
 
247 aa  342  4e-93  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  60.77 
 
 
247 aa  338  7e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  61.24 
 
 
255 aa  336  1.9999999999999998e-91  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  39.85 
 
 
248 aa  198  6e-50  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  35.29 
 
 
222 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  31.16 
 
 
247 aa  77  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  33.62 
 
 
152 aa  75.1  0.000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  25.87 
 
 
275 aa  73.6  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  24.04 
 
 
233 aa  73.2  0.000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  30.37 
 
 
232 aa  67.8  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26.83 
 
 
239 aa  66.6  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.86 
 
 
276 aa  67  0.0000000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30.22 
 
 
257 aa  65.9  0.0000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
243 aa  65.1  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  23.81 
 
 
248 aa  64.7  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.43 
 
 
266 aa  63.5  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2798  Methyltransferase type 12  31.68 
 
 
237 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0280553  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
258 aa  62.8  0.000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  30.67 
 
 
248 aa  62.8  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  29.53 
 
 
244 aa  62.4  0.000000007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
276 aa  62  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
249 aa  61.2  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  37.11 
 
 
272 aa  60.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2049  methyltransferase type 12  29.79 
 
 
242 aa  61.2  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.956754  hitchhiker  0.000637714 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34 
 
 
296 aa  59.7  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.41 
 
 
256 aa  58.9  0.00000008  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  27.54 
 
 
237 aa  58.9  0.00000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  30.48 
 
 
244 aa  58.9  0.00000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  28.21 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  29.08 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  28.47 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  28.47 
 
 
238 aa  58.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
250 aa  56.6  0.0000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  30.36 
 
 
256 aa  56.6  0.0000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7236  Methyltransferase type 12  28.06 
 
 
234 aa  56.6  0.0000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  26.24 
 
 
252 aa  55.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  25.9 
 
 
260 aa  55.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  28.66 
 
 
234 aa  55.5  0.0000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0630  methyltransferase type 12  35.24 
 
 
330 aa  55.1  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0132659 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.13 
 
 
247 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
248 aa  53.9  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  26.09 
 
 
249 aa  54.3  0.000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.81 
 
 
220 aa  54.3  0.000002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  29.32 
 
 
245 aa  53.9  0.000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  29.32 
 
 
245 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
248 aa  53.9  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.13 
 
 
189 aa  53.9  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3630  Methyltransferase type 11  31.73 
 
 
291 aa  53.5  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  29.17 
 
 
237 aa  53.1  0.000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0174  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  31.4 
 
 
217 aa  52.8  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  24.11 
 
 
259 aa  52.4  0.000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  31.63 
 
 
201 aa  52.4  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  32.71 
 
 
256 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.52 
 
 
249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.52 
 
 
249 aa  52  0.000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  25.19 
 
 
237 aa  51.6  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0823  cyclopropane-fatty-acyl-phospholipid synthase  29.79 
 
 
260 aa  51.2  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.589192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  27.07 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  32.71 
 
 
256 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  27.73 
 
 
241 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  29.03 
 
 
246 aa  51.2  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  27.27 
 
 
251 aa  51.2  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  31.13 
 
 
305 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.08 
 
 
239 aa  50.4  0.00003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  50.4  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1880  Methyltransferase type 11  26.96 
 
 
240 aa  50.4  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.08 
 
 
237 aa  50.4  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0642  Methyltransferase type 12  28.69 
 
 
227 aa  50.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.970055 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  27.37 
 
 
237 aa  49.7  0.00004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  27.5 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
277 aa  50.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.17 
 
 
286 aa  49.7  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  23.53 
 
 
253 aa  49.3  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  24.43 
 
 
241 aa  48.9  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  25.44 
 
 
231 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  28 
 
 
261 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  24.64 
 
 
254 aa  48.9  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0755  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
264 aa  48.9  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000828856  normal  0.444973 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
269 aa  48.9  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  28 
 
 
261 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>