156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_1869 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  100 
 
 
245 aa  492  9.999999999999999e-139  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  97.55 
 
 
245 aa  484  1e-136  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  157  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  38.71 
 
 
249 aa  157  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  38.46 
 
 
249 aa  155  4e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  38.46 
 
 
249 aa  155  6e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  38.31 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  38.31 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  38.31 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  38.31 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  38.31 
 
 
249 aa  154  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  38.06 
 
 
249 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  36.8 
 
 
249 aa  150  1e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  34.43 
 
 
248 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  33.19 
 
 
232 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  34 
 
 
238 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  34 
 
 
238 aa  125  5e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.98 
 
 
247 aa  123  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 
247 aa  121  9e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  31.6 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  34.57 
 
 
242 aa  118  9.999999999999999e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30.16 
 
 
276 aa  107  1e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  30 
 
 
239 aa  106  3e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  30.4 
 
 
244 aa  105  6e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.98 
 
 
276 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
266 aa  103  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  35.23 
 
 
244 aa  102  4e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  30.04 
 
 
246 aa  101  1e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  26.97 
 
 
275 aa  100  3e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  29.15 
 
 
247 aa  99.4  4e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  28 
 
 
246 aa  93.2  4e-18  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  29.86 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  28.29 
 
 
256 aa  81.3  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.94 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  27.59 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  27.04 
 
 
294 aa  77.8  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
260 aa  78.2  0.0000000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  27.91 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  24.39 
 
 
240 aa  73.9  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0248  hypothetical protein  24.77 
 
 
248 aa  73.6  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  25 
 
 
273 aa  71.6  0.000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  31.55 
 
 
220 aa  71.2  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
259 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  27.62 
 
 
246 aa  68.6  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  25.96 
 
 
258 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2637  methyltransferase type 12  25.24 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.325203  normal  0.280719 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  27.8 
 
 
233 aa  65.1  0.000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  25.48 
 
 
237 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  27.67 
 
 
249 aa  62.8  0.000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
243 aa  61.2  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  24.65 
 
 
231 aa  60.8  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.51 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.51 
 
 
237 aa  60.8  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  23.58 
 
 
251 aa  60.1  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  23.27 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  23.18 
 
 
239 aa  59.7  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  26.58 
 
 
250 aa  58.9  0.00000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  25.12 
 
 
255 aa  59.3  0.00000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  25.6 
 
 
249 aa  58.9  0.00000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  23.9 
 
 
237 aa  58.5  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  24.19 
 
 
239 aa  58.5  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  27.45 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  23.72 
 
 
237 aa  58.2  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  25.22 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  24.69 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  25.22 
 
 
262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  24.55 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  24.69 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  30.94 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.45 
 
 
261 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3161  methyltransferase type 12  24.64 
 
 
247 aa  55.8  0.0000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.086147 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3796  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
285 aa  54.7  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0753  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 
243 aa  54.7  0.000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  24.12 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  25.38 
 
 
237 aa  54.7  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  23.77 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0013  hypothetical protein  29.93 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  25 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33370  hypothetical protein  28.03 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  25.47 
 
 
246 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0521  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0543  methyltransferase type 11  29.29 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0547  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
285 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 
315 aa  53.9  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.42 
 
 
250 aa  53.5  0.000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3449  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
261 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0501  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2180  methyltransferase type 12  31.4 
 
 
247 aa  53.5  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.837797  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1565  methyltransferase type 11  23.67 
 
 
247 aa  53.1  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.132389  hitchhiker  0.000000000856384 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.23 
 
 
251 aa  52.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  27.66 
 
 
247 aa  52.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  26.24 
 
 
237 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.58 
 
 
256 aa  52.4  0.000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 
264 aa  52  0.000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  29.91 
 
 
256 aa  52  0.000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  24.89 
 
 
247 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.62 
 
 
244 aa  51.6  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  25 
 
 
280 aa  51.6  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>