More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_2188 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  100 
 
 
294 aa  612  9.999999999999999e-175  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  78.89 
 
 
269 aa  437  9.999999999999999e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  58.02 
 
 
254 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  45.11 
 
 
248 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  34.45 
 
 
266 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  37.41 
 
 
246 aa  127  3e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.76 
 
 
244 aa  127  3e-28  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  29.48 
 
 
247 aa  122  7e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4536  methyltransferase type 11  37.12 
 
 
259 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  31.49 
 
 
276 aa  107  2e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0078  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
273 aa  105  9e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.682251  hitchhiker  0.000120825 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  31.36 
 
 
249 aa  104  1e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  32.16 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  32.16 
 
 
249 aa  104  2e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  33.2 
 
 
260 aa  104  2e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  30.93 
 
 
249 aa  103  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  31.72 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  31.72 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  31.72 
 
 
249 aa  103  4e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  30.08 
 
 
249 aa  99.4  7e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  30.4 
 
 
249 aa  99  8e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  30.51 
 
 
249 aa  98.6  1e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  30.65 
 
 
275 aa  98.6  1e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  30.08 
 
 
249 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  29.28 
 
 
259 aa  95.1  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  29.49 
 
 
247 aa  94  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  30.74 
 
 
251 aa  90.9  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  26.56 
 
 
248 aa  90.9  2e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  27.65 
 
 
276 aa  89  8e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.62 
 
 
244 aa  87.4  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2042  methyltransferase type 11  34.5 
 
 
256 aa  86.7  4e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.646082  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  24.48 
 
 
232 aa  85.5  9e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  26.39 
 
 
269 aa  84.7  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  25.65 
 
 
239 aa  83.6  0.000000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
258 aa  82  0.000000000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  27.2 
 
 
246 aa  79.7  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  27.04 
 
 
245 aa  79.3  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.58 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  26.92 
 
 
245 aa  78.6  0.0000000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
247 aa  78.6  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.58 
 
 
238 aa  78.6  0.0000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
240 aa  77.4  0.0000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  31.82 
 
 
237 aa  77.4  0.0000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  29.3 
 
 
237 aa  75.5  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  28.84 
 
 
237 aa  75.1  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  37.14 
 
 
296 aa  73.6  0.000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  28.28 
 
 
286 aa  72.8  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.55 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  27.08 
 
 
259 aa  72.4  0.000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  28.84 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  28.84 
 
 
237 aa  72  0.00000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  28.84 
 
 
237 aa  71.6  0.00000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  28.37 
 
 
239 aa  71.2  0.00000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  27.51 
 
 
257 aa  70.9  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  25.56 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  28.37 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1240  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 
242 aa  70.1  0.00000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.73 
 
 
272 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  23.14 
 
 
264 aa  68.9  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.5 
 
 
253 aa  68.9  0.0000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  28.28 
 
 
237 aa  68.2  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  23.83 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  25.5 
 
 
233 aa  65.9  0.0000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  34.48 
 
 
261 aa  65.1  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  25.21 
 
 
262 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  23.64 
 
 
250 aa  63.2  0.000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  23.74 
 
 
243 aa  62.8  0.000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  24.73 
 
 
246 aa  62.4  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  25.66 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  24.57 
 
 
252 aa  62  0.00000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  26.16 
 
 
262 aa  60.8  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  25 
 
 
280 aa  60.5  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 
220 aa  59.3  0.00000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1302  hypothetical protein  31.62 
 
 
247 aa  59.3  0.00000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  26.27 
 
 
315 aa  58.9  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  26.34 
 
 
262 aa  57.8  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  29.56 
 
 
249 aa  58.2  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09870  hypothetical protein  33.09 
 
 
247 aa  58.2  0.0000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.261813  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  26.94 
 
 
263 aa  57.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 
248 aa  57.4  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3653  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
249 aa  57  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  28.15 
 
 
251 aa  57  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 
248 aa  56.6  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  32.56 
 
 
253 aa  56.2  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
251 aa  56.2  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  24.26 
 
 
259 aa  56.2  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  29.91 
 
 
251 aa  55.8  0.0000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  28.41 
 
 
251 aa  55.8  0.0000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0917  hypothetical protein  31.69 
 
 
247 aa  55.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
248 aa  55.5  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  29.14 
 
 
246 aa  55.5  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4069  hypothetical protein  27.97 
 
 
261 aa  54.3  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
254 aa  54.7  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.1 
 
 
246 aa  53.9  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  23.01 
 
 
259 aa  53.9  0.000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0602  methyltransferase type 11  30.95 
 
 
263 aa  53.9  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.445772  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1329  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
250 aa  53.5  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.05 
 
 
251 aa  53.5  0.000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  34.68 
 
 
245 aa  53.1  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  26.01 
 
 
253 aa  53.1  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>