196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1814 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  100 
 
 		 263 aa  535  1e-151  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  44.13 
 
 		 257 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  23.39 
 
 		 575 aa  79.7  0.00000000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.79 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  25.3 
 
 		 315 aa  69.3  0.00000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.34 
 
 		 253 aa  65.9  0.0000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 262 aa  62.8  0.000000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  25.87 
 
 		 261 aa  61.6  0.00000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2000  hypothetical protein  24.38 
 
 		 207 aa  60.5  0.00000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0173133  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  23.31 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.31 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  23.42 
 
 		 239 aa  60.1  0.00000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  25.1 
 
 		 251 aa  58.5  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  34.74 
 
 		 195 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  22.58 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  22.58 
 
 		 262 aa  57.4  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  22.66 
 
 		 255 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  20.95 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  25.11 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  26.28 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  22.8 
 
 		 261 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  22.78 
 
 		 246 aa  55.8  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3347  methyltransferase type 12  25.48 
 
 		 201 aa  55.5  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.84561  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  27.21 
 
 		 226 aa  54.7  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  23.85 
 
 		 241 aa  55.5  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  24.67 
 
 		 254 aa  55.1  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31490  methyltransferase family protein  26.06 
 
 		 205 aa  55.1  0.000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.83 
 
 		 250 aa  54.7  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  25.49 
 
 		 262 aa  54.7  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  23.79 
 
 		 280 aa  54.7  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  32.11 
 
 		 246 aa  53.5  0.000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  23.77 
 
 		 256 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  20.65 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  23.94 
 
 		 201 aa  53.1  0.000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  20.65 
 
 		 261 aa  53.1  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  25.1 
 
 		 257 aa  52.8  0.000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  26.09 
 
 		 262 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.35 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.35 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1651  Methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 260 aa  52.4  0.000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.131421  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.35 
 
 		 249 aa  52.8  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  30 
 
 		 266 aa  52.8  0.000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  26.94 
 
 		 294 aa  52.4  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  23.46 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.35 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.35 
 
 		 249 aa  52  0.000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2447  methyltransferase type 11  28.08 
 
 		 284 aa  52  0.000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.204404  normal  0.251404 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  24.89 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  28.57 
 
 		 253 aa  51.6  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  23.25 
 
 		 249 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  20.78 
 
 		 256 aa  51.6  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.59 
 
 		 249 aa  51.2  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  21.09 
 
 		 253 aa  52  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3419  UbiE/COQ5 methyltransferase  30.15 
 
 		 299 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1188  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.351781  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  22.53 
 
 		 256 aa  50.8  0.00002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1205  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.795774  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  32.63 
 
 		 244 aa  50.8  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1215  methyltransferase type 11  25.52 
 
 		 201 aa  50.8  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0778 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  23.25 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  21.69 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  23.77 
 
 		 247 aa  50.1  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3370  Methyltransferase type 11  31.65 
 
 		 253 aa  50.4  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.442858 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  29.55 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  24.82 
 
 		 199 aa  49.3  0.00006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1610  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 274 aa  48.9  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  28.79 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 		 276 aa  48.9  0.00008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  28.79 
 
 		 254 aa  48.9  0.00008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  23.9 
 
 		 304 aa  48.9  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2404  Methyltransferase type 11  28.3 
 
 		 226 aa  48.9  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  38.67 
 
 		 259 aa  48.9  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  28.79 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  26.62 
 
 		 247 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  23.48 
 
 		 239 aa  48.5  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  28.79 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  28.79 
 
 		 254 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  30.34 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2409  hypothetical protein  33.33 
 
 		 217 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.452604  normal  0.345897 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.41 
 
 		 190 aa  47.8  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0355  methyltransferase type 11  33.78 
 
 		 299 aa  47.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.970356 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  21.89 
 
 		 253 aa  47.4  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  25.75 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  25.75 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  31.48 
 
 		 267 aa  47.4  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  31.09 
 
 		 675 aa  47  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  28.8 
 
 		 249 aa  47  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  25.78 
 
 		 262 aa  47  0.0004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0217  UbiE/COQ5 methyltransferase  28.04 
 
 		 255 aa  46.6  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0805678  normal  0.734054 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  30.36 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.06 
 
 		 232 aa  46.6  0.0004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4890  methyltransferase type 12  24.81 
 
 		 201 aa  46.6  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.909319  normal  0.033244 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2432  methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 259 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.80949  normal  0.303283 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0221  Methyltransferase type 11  28.38 
 
 		 208 aa  46.6  0.0005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.664721  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  22.01 
 
 		 250 aa  46.2  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  23.53 
 
 		 265 aa  46.2  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  25.41 
 
 		 201 aa  45.8  0.0006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  38.98 
 
 		 252 aa  46.2  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>