More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5435 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  100 
 
 		 253 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  93.28 
 
 		 253 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  76.1 
 
 		 255 aa  381  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  77.69 
 
 		 250 aa  368  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  77.37 
 
 		 250 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  77.37 
 
 		 250 aa  352  2e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  75.72 
 
 		 250 aa  343  2e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  37.97 
 
 		 246 aa  153  2.9999999999999998e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  40.5 
 
 		 246 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  42.86 
 
 		 246 aa  148  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  42.34 
 
 		 249 aa  146  3e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  38.43 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.82 
 
 		 263 aa  131  1.0000000000000001e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  38.07 
 
 		 249 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.87 
 
 		 232 aa  128  1.0000000000000001e-28  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  35.62 
 
 		 242 aa  127  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  35.06 
 
 		 260 aa  125  6e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.36 
 
 		 257 aa  107  2e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  25.2 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  25.2 
 
 		 261 aa  90.5  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  25.4 
 
 		 256 aa  89.4  5e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  25 
 
 		 256 aa  87  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  24.8 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  24.8 
 
 		 262 aa  86.7  3e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.19 
 
 		 261 aa  83.6  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.84 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.11 
 
 		 244 aa  74.7  0.000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  29.25 
 
 		 315 aa  73.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  28.86 
 
 		 575 aa  73.2  0.000000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.22 
 
 		 251 aa  72.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  29.95 
 
 		 261 aa  66.6  0.0000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  23.96 
 
 		 262 aa  63.5  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  29.44 
 
 		 259 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  25.71 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.46 
 
 		 249 aa  60.5  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  23.77 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.54 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  30.19 
 
 		 247 aa  60.1  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  38.32 
 
 		 225 aa  59.7  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  33.55 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.1 
 
 		 258 aa  59.7  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 		 250 aa  59.3  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  31.36 
 
 		 248 aa  58.9  0.00000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  22.27 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  27.03 
 
 		 220 aa  58.2  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  31.97 
 
 		 237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.07 
 
 		 266 aa  58.2  0.0000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 252 aa  57.4  0.0000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.69 
 
 		 232 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  23 
 
 		 280 aa  57.4  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  25.69 
 
 		 220 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  32.28 
 
 		 258 aa  57  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0170  methyltransferase type 11  30.36 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000954595  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  26.88 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 253 aa  55.8  0.0000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  25.76 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  25.83 
 
 		 267 aa  55.5  0.0000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 276 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  28.06 
 
 		 249 aa  54.7  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.18 
 
 		 260 aa  55.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  29.09 
 
 		 251 aa  54.7  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  22.97 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  32.91 
 
 		 236 aa  55.1  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  31.61 
 
 		 241 aa  54.7  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 244 aa  53.9  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_586  methyltransferase  25.65 
 
 		 293 aa  54.3  0.000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00349861  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  30.08 
 
 		 296 aa  53.9  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4078  methyltransferase type 11  29.08 
 
 		 259 aa  54.3  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  26.8 
 
 		 261 aa  53.5  0.000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  23.46 
 
 		 416 aa  53.5  0.000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0872  methyltransferase type 12  33.05 
 
 		 214 aa  53.5  0.000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.140268  normal  0.160573 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  25.11 
 
 		 251 aa  53.1  0.000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  34.21 
 
 		 241 aa  52.8  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  26.39 
 
 		 276 aa  53.1  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2327  methylase  31.43 
 
 		 241 aa  52.8  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.102662  normal  0.330615 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1164  methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 267 aa  52.8  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.1312  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1957  methyltransferase type 11  33.64 
 
 		 236 aa  52.4  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.476882  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0064  Methyltransferase type 11  35.43 
 
 		 226 aa  52.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  30.91 
 
 		 281 aa  52.4  0.000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5685  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5725  Methyltransferase type 11  26.95 
 
 		 204 aa  52.4  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  24.07 
 
 		 246 aa  52.4  0.000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0858  biotin synthesis protein BioC  30.23 
 
 		 275 aa  52.4  0.000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  27.43 
 
 		 268 aa  52.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  32.03 
 
 		 273 aa  52  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  31.73 
 
 		 280 aa  51.6  0.00001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  30 
 
 		 237 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  29.17 
 
 		 239 aa  52  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  30.48 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  33.63 
 
 		 234 aa  52  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  24.07 
 
 		 262 aa  51.2  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  24.65 
 
 		 246 aa  51.2  0.00001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>