179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_33100 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  100 
 
 
267 aa  540  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  39.83 
 
 
247 aa  157  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  33.6 
 
 
251 aa  126  5e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  34.73 
 
 
246 aa  125  6e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  37.14 
 
 
261 aa  125  1e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1639  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
242 aa  112  8.000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.197359 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  34.29 
 
 
256 aa  111  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  35.35 
 
 
254 aa  110  3e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  36.06 
 
 
261 aa  109  4.0000000000000004e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  33.01 
 
 
254 aa  106  5e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7150  methyltransferase  33.5 
 
 
249 aa  95.1  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.458716  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  27.54 
 
 
246 aa  88.6  9e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6712  methyltransferase type 12  31.06 
 
 
237 aa  78.2  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  28.77 
 
 
307 aa  70.9  0.00000000002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  30.62 
 
 
250 aa  68.9  0.00000000008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  27.52 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  27.4 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  27.4 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  27.4 
 
 
254 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  27.85 
 
 
262 aa  66.2  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  27.4 
 
 
254 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
575 aa  64.7  0.000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  27.4 
 
 
254 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  26.71 
 
 
254 aa  63.9  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  26.57 
 
 
253 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.12 
 
 
253 aa  63.2  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  24.5 
 
 
252 aa  62  0.000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  27.27 
 
 
254 aa  61.6  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
184 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  32.14 
 
 
258 aa  60.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  30.28 
 
 
252 aa  60.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  26.59 
 
 
251 aa  60.1  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  25.66 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  25.34 
 
 
253 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  28.65 
 
 
269 aa  58.2  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  25.9 
 
 
252 aa  58.2  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.03 
 
 
246 aa  57.8  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  30.43 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  30.43 
 
 
238 aa  57  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  29.23 
 
 
271 aa  56.6  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1427  Methyltransferase type 11  25.12 
 
 
237 aa  56.2  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.527187  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  36.04 
 
 
195 aa  56.2  0.0000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  30.43 
 
 
390 aa  55.1  0.000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  29.01 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  25.83 
 
 
253 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1535  methyltransferase type 11  34.91 
 
 
265 aa  55.5  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0615869  hitchhiker  0.00227852 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  28.92 
 
 
252 aa  55.1  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
262 aa  54.3  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  31.65 
 
 
242 aa  54.3  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0877  hypothetical protein  35.71 
 
 
271 aa  53.9  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.578473  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  24.84 
 
 
283 aa  53.5  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7298  hypothetical protein  33.33 
 
 
228 aa  53.9  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0960  methyltransferase  29.57 
 
 
261 aa  52.8  0.000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  29.91 
 
 
272 aa  52.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
276 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  28 
 
 
253 aa  52.8  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  26.28 
 
 
416 aa  51.6  0.00001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0310  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
259 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0163347  normal  0.712325 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.7 
 
 
266 aa  51.6  0.00001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  27.27 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01310  methyltransferase family protein  30.65 
 
 
201 aa  50.4  0.00003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4504  methyltransferase type 12  32.8 
 
 
198 aa  50.4  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.210014  normal  0.784341 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  25.84 
 
 
268 aa  50.4  0.00003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  25 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  22.34 
 
 
261 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
246 aa  50.1  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  26.82 
 
 
269 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  23.11 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  21 
 
 
251 aa  50.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  24.53 
 
 
247 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.64 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.64 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.64 
 
 
249 aa  49.7  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  23.18 
 
 
246 aa  49.7  0.00005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  49.3  0.00006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  36.05 
 
 
244 aa  49.7  0.00006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  35.38 
 
 
233 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  24.36 
 
 
249 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  24.52 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  30.88 
 
 
249 aa  48.9  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25 
 
 
249 aa  48.9  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3591  methyltransferase type 12  31.06 
 
 
201 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000491208 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  25.54 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1090  hypothetical protein  28.35 
 
 
201 aa  48.5  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 
254 aa  48.1  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  25 
 
 
272 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  28.99 
 
 
262 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  24.36 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  38.16 
 
 
275 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  25 
 
 
253 aa  48.5  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  24.22 
 
 
264 aa  48.5  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  29.79 
 
 
237 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21650  methyltransferase family protein  31.2 
 
 
199 aa  48.1  0.0002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.920787 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  25.87 
 
 
252 aa  48.1  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5711  Methyltransferase type 11  38.16 
 
 
265 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1534  methyltransferase type 12  34.43 
 
 
201 aa  47.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.657128  normal  0.275584 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
247 aa  48.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  31.48 
 
 
263 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>