118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tgr7_2606 on replicon NC_011901
Organism: Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  100 
 
 
262 aa  536  1e-151  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  34.67 
 
 
416 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  34.67 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  34.22 
 
 
252 aa  129  6e-29  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  29.52 
 
 
253 aa  122  8e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  30 
 
 
252 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  29.96 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  119  4.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  29.52 
 
 
254 aa  118  9e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  29.52 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  29.96 
 
 
254 aa  117  3e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  29.07 
 
 
254 aa  116  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  28.7 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1246  methyltransferase  30.17 
 
 
253 aa  97.8  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  25 
 
 
251 aa  87  3e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  32.46 
 
 
243 aa  84  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.52 
 
 
262 aa  83.6  0.000000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  35.85 
 
 
259 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  27.95 
 
 
253 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  32.71 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  30.5 
 
 
262 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  67  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.21 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  23.88 
 
 
249 aa  65.5  0.0000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.67 
 
 
250 aa  65.5  0.0000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  23.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  23 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  23.27 
 
 
249 aa  65.1  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  23.47 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  24.19 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  31.21 
 
 
252 aa  62.4  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4547  methyltransferase type 11  33.64 
 
 
254 aa  60.1  0.00000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.577153  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  23.91 
 
 
307 aa  59.3  0.00000007  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  29.39 
 
 
267 aa  58.9  0.00000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  40.79 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  21.59 
 
 
258 aa  58.2  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  24.34 
 
 
276 aa  57.8  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  20.5 
 
 
247 aa  57  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  26.81 
 
 
247 aa  56.2  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.68 
 
 
244 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  22.87 
 
 
247 aa  55.5  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  23.08 
 
 
266 aa  53.5  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3485  Methyltransferase type 11  31.78 
 
 
246 aa  53.1  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.32 
 
 
246 aa  53.1  0.000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.53 
 
 
315 aa  52.8  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  28.68 
 
 
251 aa  51.6  0.00001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  23.15 
 
 
256 aa  51.2  0.00002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.89 
 
 
286 aa  51.2  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
252 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  29.51 
 
 
254 aa  50.4  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  30.19 
 
 
663 aa  50.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  27.61 
 
 
248 aa  48.9  0.00009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  30.1 
 
 
236 aa  48.1  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  28.87 
 
 
220 aa  48.1  0.0001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  21.08 
 
 
246 aa  48.1  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  28.99 
 
 
267 aa  48.1  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  31.33 
 
 
233 aa  48.5  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30.1 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  26.72 
 
 
256 aa  47.4  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  47.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  29.79 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003268  methyltransferase  38.36 
 
 
210 aa  47  0.0003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  19.67 
 
 
541 aa  47  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  30.1 
 
 
236 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2905  Methyltransferase type 11  41.27 
 
 
234 aa  46.6  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  27.93 
 
 
252 aa  46.2  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  29.25 
 
 
247 aa  45.8  0.0007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3478  hypothetical protein  35.37 
 
 
257 aa  45.8  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0815915 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  23.94 
 
 
275 aa  45.8  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  22.37 
 
 
237 aa  45.8  0.0007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3130  Methyltransferase type 11  31.52 
 
 
261 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.239042  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  19.67 
 
 
541 aa  45.8  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  31.82 
 
 
250 aa  44.7  0.001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.16 
 
 
222 aa  45.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  18.64 
 
 
244 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3090  methyltransferase type 11  46.81 
 
 
195 aa  45.1  0.001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.533993  normal  0.421813 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1181  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  36.62 
 
 
445 aa  45.1  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0405802  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0768  methyltransferase type 11  32.43 
 
 
442 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.195883  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  19.35 
 
 
541 aa  45.4  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  19.67 
 
 
541 aa  45.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  27.87 
 
 
238 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0334  Methyltransferase type 11  32.86 
 
 
257 aa  45.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000194414  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  25.49 
 
 
246 aa  45.4  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  19.67 
 
 
541 aa  44.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  29.13 
 
 
236 aa  44.7  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2505  Methyltransferase type 11  40 
 
 
267 aa  44.3  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.618552  normal  0.420988 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3211  Methyltransferase type 12  25 
 
 
259 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.157903  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0228  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  41.67 
 
 
232 aa  43.9  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1888  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
209 aa  43.5  0.003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1201  23S rRNA 5-methyluridine methyltransferase  46.81 
 
 
444 aa  43.9  0.003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0455461  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25 
 
 
637 aa  43.5  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>