78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0127 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  100 
 
 		 251 aa  515  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  47.18 
 
 		 252 aa  249  3e-65  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1246  methyltransferase  48.02 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  40.24 
 
 		 254 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  40.24 
 
 		 253 aa  211  7e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  40.24 
 
 		 254 aa  209  3e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  39.84 
 
 		 254 aa  208  6e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  39.44 
 
 		 254 aa  206  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  39.44 
 
 		 253 aa  207  2e-52  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  39.44 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  39.44 
 
 		 254 aa  205  6e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  39.04 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  39.44 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl078  S-adenosylmethionine:2-demethylmenaquinone methyltransferase  33.33 
 
 		 307 aa  138  8.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0153588  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  31.05 
 
 		 252 aa  128  8.000000000000001e-29  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  29.03 
 
 		 252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  29.08 
 
 		 416 aa  112  6e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  87  2e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  29.17 
 
 		 259 aa  76.3  0.0000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  30.11 
 
 		 243 aa  74.7  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  28.99 
 
 		 262 aa  73.2  0.000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.53 
 
 		 262 aa  70.9  0.00000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  29.96 
 
 		 253 aa  68.6  0.00000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  29.15 
 
 		 253 aa  66.6  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  27.31 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  34.34 
 
 		 256 aa  66.6  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  31.45 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  35.16 
 
 		 315 aa  62.4  0.000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  27.27 
 
 		 258 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  24.22 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 		 249 aa  55.5  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  27.27 
 
 		 267 aa  54.7  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7688  methyltransferase type 11  25.75 
 
 		 184 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.22771  normal  0.423955 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  20.54 
 
 		 266 aa  52  0.000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  24.06 
 
 		 239 aa  50.8  0.00002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  22.64 
 
 		 251 aa  50.4  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  26.13 
 
 		 261 aa  50.4  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2108  hypothetical protein  27.18 
 
 		 247 aa  48.9  0.00008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.162717  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  26.15 
 
 		 575 aa  48.1  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  31.2 
 
 		 238 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  20.65 
 
 		 244 aa  48.1  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  30.82 
 
 		 457 aa  48.1  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  20.69 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  20.59 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  20.59 
 
 		 249 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  19.75 
 
 		 249 aa  46.6  0.0004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  28.1 
 
 		 275 aa  46.6  0.0004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1366  hypothetical protein  27.62 
 
 		 220 aa  46.2  0.0005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.229777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  19.75 
 
 		 249 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  26.15 
 
 		 267 aa  45.4  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  20 
 
 		 237 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  23.55 
 
 		 272 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  24.37 
 
 		 254 aa  44.7  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3137  Methyltransferase type 11  28.16 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  22.58 
 
 		 248 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  25 
 
 		 637 aa  43.9  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  25.51 
 
 		 251 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  25.36 
 
 		 296 aa  44.3  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  22.48 
 
 		 248 aa  43.9  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  19.47 
 
 		 237 aa  43.5  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  19.69 
 
 		 239 aa  43.9  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  23.08 
 
 		 286 aa  43.5  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  19.47 
 
 		 237 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  26.47 
 
 		 246 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2516  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 210 aa  42.7  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  18.65 
 
 		 237 aa  42.7  0.006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2189  phosphatidylethanolamine N-methyltransferase  31.03 
 
 		 229 aa  42.4  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  19.47 
 
 		 231 aa  42.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3211  Methyltransferase type 12  24.18 
 
 		 259 aa  42.4  0.007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.157903  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  23.3 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  25.54 
 
 		 250 aa  42.4  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  26.29 
 
 		 262 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  22.13 
 
 		 249 aa  42  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>