118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3211 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3211  Methyltransferase type 12  100 
 
 		 259 aa  545  1e-154  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.157903  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 		 280 aa  132  6.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  26.62 
 
 		 264 aa  103  3e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  22.53 
 
 		 248 aa  70.1  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0584  hypothetical protein  25.11 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2662  methyltransferase type 11  23.75 
 
 		 252 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  23.01 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2664  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182246  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2616  methyltransferase  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.183675  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2585  methyltransferase  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.571007  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2858  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2906  hypothetical protein  30.43 
 
 		 254 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0559  hypothetical protein  24.66 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  25.5 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2863  hypothetical protein  29.57 
 
 		 254 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276445 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  30.48 
 
 		 253 aa  62  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  25.85 
 
 		 276 aa  62  0.000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  24.5 
 
 		 252 aa  62  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  23.04 
 
 		 251 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  26.46 
 
 		 258 aa  61.2  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0998  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 		 247 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006365  plpp0124  hypothetical protein  23.95 
 
 		 416 aa  58.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3090  hypothetical protein  29.71 
 
 		 243 aa  58.5  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.385267 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  21.91 
 
 		 247 aa  58.2  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2422  methyltransferase  29.52 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.440129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 253 aa  57.8  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  24.14 
 
 		 256 aa  55.8  0.0000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  25.56 
 
 		 232 aa  55.5  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4176  methyltransferase type 11  24.36 
 
 		 256 aa  55.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000140176  hitchhiker  0.0000000044225 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.6 
 
 		 262 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  31.4 
 
 		 315 aa  53.1  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  24.77 
 
 		 269 aa  52.4  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 249 aa  52.4  0.000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  25.97 
 
 		 286 aa  52.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  26.92 
 
 		 244 aa  51.6  0.00001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  27.7 
 
 		 248 aa  50.8  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.33 
 
 		 249 aa  51.2  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3335  Methyltransferase type 12  25 
 
 		 259 aa  50.8  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.15309  unclonable  0.0000000176588 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  23.97 
 
 		 276 aa  51.2  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0044  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 		 152 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0924465  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  23.81 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  22.5 
 
 		 249 aa  50.1  0.00003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  22.22 
 
 		 251 aa  50.1  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4138  Methyltransferase type 11  29.55 
 
 		 254 aa  50.1  0.00004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.604904  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  32.29 
 
 		 252 aa  50.1  0.00004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  26.92 
 
 		 253 aa  49.7  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  22.03 
 
 		 257 aa  49.3  0.00007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  21.67 
 
 		 249 aa  49.3  0.00007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  21.67 
 
 		 249 aa  48.9  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 		 225 aa  48.9  0.00008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  22.5 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  22.5 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  22.5 
 
 		 249 aa  48.5  0.00009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  25.89 
 
 		 269 aa  48.9  0.00009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 		 262 aa  48.9  0.00009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  22.5 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  26.95 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  22.5 
 
 		 249 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2606  hypothetical protein  25 
 
 		 262 aa  48.1  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  24.1 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  25 
 
 		 266 aa  47  0.0003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1648  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1683  hypothetical protein  24.29 
 
 		 238 aa  47.4  0.0003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00861668  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  24.79 
 
 		 259 aa  47  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  28.16 
 
 		 239 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.67 
 
 		 244 aa  46.6  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  28.03 
 
 		 575 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  29.41 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  20.36 
 
 		 247 aa  46.6  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0127  methyltransferase type 12  24.51 
 
 		 251 aa  46.2  0.0005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.601101  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.75 
 
 		 252 aa  46.2  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  28.44 
 
 		 265 aa  46.6  0.0005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3271  Methyltransferase type 12  28.8 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.128592 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2188  methyltransferase type 11  25.62 
 
 		 294 aa  46.2  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.207917  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4362  Methyltransferase type 11  30.95 
 
 		 246 aa  46.2  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00000726075  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  26.12 
 
 		 280 aa  45.8  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1549  methyltransferase type 11  22.44 
 
 		 255 aa  45.8  0.0007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4732  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 		 241 aa  45.1  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  25.55 
 
 		 244 aa  44.7  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.33 
 
 		 202 aa  45.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0378  methyltransferase type 11  26.73 
 
 		 251 aa  45.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0115347 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  29.13 
 
 		 246 aa  44.7  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  25.33 
 
 		 250 aa  45.1  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  27.35 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0205  hypothetical protein  32 
 
 		 267 aa  44.3  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0716517  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  25.9 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2158  hypothetical protein  20.48 
 
 		 245 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09370  dimethyladenosine transferase (rRNA methylation)  31.78 
 
 		 256 aa  44.7  0.002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.258715  normal  0.963324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  28.78 
 
 		 237 aa  44.3  0.002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  24.32 
 
 		 250 aa  43.9  0.003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  22.61 
 
 		 249 aa  43.9  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1175  Methyltransferase type 12  30.17 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  28.18 
 
 		 246 aa  43.5  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  25.74 
 
 		 222 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2368  methyltransferase type 12  25.53 
 
 		 345 aa  43.5  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1869  hypothetical protein  19.52 
 
 		 245 aa  43.1  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.91 
 
 		 215 aa  43.1  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4409  methyltransferase type 11  27.5 
 
 		 205 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 675 aa  43.5  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  31.53 
 
 		 199 aa  43.1  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>