More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_1411 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  100 
 
 
246 aa  508  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  46.72 
 
 
243 aa  241  1e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  47.35 
 
 
245 aa  240  1e-62  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  47.56 
 
 
255 aa  240  1e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  47.26 
 
 
254 aa  238  6.999999999999999e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  36.63 
 
 
246 aa  185  6e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  34.26 
 
 
262 aa  143  2e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  32.54 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  33.47 
 
 
262 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  32.79 
 
 
259 aa  138  6e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  34.01 
 
 
262 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  34.4 
 
 
280 aa  132  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  28.11 
 
 
262 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  25.19 
 
 
251 aa  99.4  4e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  26.98 
 
 
250 aa  89  6e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
675 aa  88.6  8e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  31.91 
 
 
249 aa  84  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.42 
 
 
253 aa  82.4  0.000000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  26.19 
 
 
252 aa  80.9  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  27.11 
 
 
244 aa  78.2  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.46 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
304 aa  77.8  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  29.73 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.3 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  32.48 
 
 
246 aa  74.3  0.000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 
249 aa  73.9  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  31.69 
 
 
248 aa  72.8  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  31.9 
 
 
637 aa  72.4  0.000000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3377  Methyltransferase type 11  25.11 
 
 
249 aa  72  0.000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.861179  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  27.05 
 
 
249 aa  71.2  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.15 
 
 
663 aa  70.1  0.00000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  30 
 
 
257 aa  68.9  0.00000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  25.3 
 
 
262 aa  68.6  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  27.38 
 
 
247 aa  68.6  0.00000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  29.49 
 
 
252 aa  68.6  0.00000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  24.42 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  27.32 
 
 
247 aa  67.8  0.0000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  25 
 
 
257 aa  67  0.0000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  31.68 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  29.05 
 
 
264 aa  65.9  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  28.37 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  66.2  0.0000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4135  methyltransferase type 11  35.11 
 
 
243 aa  65.9  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.399461  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  31.94 
 
 
266 aa  66.2  0.0000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.37 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.37 
 
 
249 aa  65.9  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  25.91 
 
 
253 aa  65.9  0.0000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  25.58 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000008  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  64.7  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
244 aa  65.1  0.000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  23.15 
 
 
271 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  23.35 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  27.91 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  33.9 
 
 
251 aa  63.5  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
221 aa  62.4  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  26.61 
 
 
638 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
277 aa  60.5  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  30.25 
 
 
254 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  30.71 
 
 
267 aa  60.1  0.00000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.48 
 
 
250 aa  60.1  0.00000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  26.62 
 
 
242 aa  59.3  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3113  Methyltransferase type 11  27.78 
 
 
273 aa  59.3  0.00000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.5 
 
 
286 aa  58.9  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  24.64 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  24.64 
 
 
250 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  31.72 
 
 
248 aa  58.5  0.00000009  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1671  s-adenosylmethionine (SAM)-dependent methyltransferase  28.44 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  32.39 
 
 
269 aa  58.5  0.0000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  34.48 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 
220 aa  57.8  0.0000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  32.41 
 
 
559 aa  58.2  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  25.69 
 
 
280 aa  57.4  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  23.61 
 
 
259 aa  57.4  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0260  Methyltransferase type 11  23.83 
 
 
267 aa  57  0.0000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00488037  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.29 
 
 
269 aa  57  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  27.37 
 
 
244 aa  57  0.0000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  24.88 
 
 
255 aa  56.2  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2788  Methyltransferase type 11  24.54 
 
 
237 aa  55.8  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125753  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  27.21 
 
 
265 aa  56.2  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  26.67 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  26.67 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  26.67 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  23.12 
 
 
276 aa  55.8  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1051  Methyltransferase type 12  24.03 
 
 
264 aa  55.8  0.0000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.235012  normal  0.0241344 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  26.67 
 
 
236 aa  55.8  0.0000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  23.5 
 
 
248 aa  55.8  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  29.63 
 
 
236 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  37.84 
 
 
290 aa  55.5  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  27.21 
 
 
236 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0240  methyltransferase type 11  28.1 
 
 
217 aa  55.5  0.0000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.373296  normal  0.164188 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  29.29 
 
 
268 aa  55.5  0.0000009  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  28.8 
 
 
296 aa  55.1  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  28.89 
 
 
236 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1128  methyltransferase type 11  25.46 
 
 
257 aa  54.7  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.518867 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>