More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_3703 on replicon NC_008543
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008061  Bcen_4660  methyltransferase type 12  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3703  methyltransferase type 12  100 
 
 
250 aa  496  1e-139  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.919771  normal  0.170372 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3818  methyltransferase type 12  95.2 
 
 
250 aa  444  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.329874  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2407  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  85.48 
 
 
250 aa  424  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  80.08 
 
 
253 aa  392  1e-108  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5435  methyltransferase type 12  78.01 
 
 
253 aa  377  1e-103  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5031  methyltransferase type 12  76.13 
 
 
255 aa  373  1e-102  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.038872  normal  0.858549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4319  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
246 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2128  methyltransferase type 11  38.46 
 
 
246 aa  148  8e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.26918 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3953  Methyltransferase type 12  42.6 
 
 
249 aa  143  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.988562  normal  0.116443 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0393  methyltransferase protein  36.32 
 
 
246 aa  139  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02460  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  37.55 
 
 
263 aa  137  2e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.712689  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2057  Methyltransferase type 12  36.72 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0866699 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2138  Methyltransferase type 11  36.64 
 
 
260 aa  126  3e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5594  Methyltransferase type 11  37.67 
 
 
249 aa  123  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.709179  normal  0.912769 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31310  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36.41 
 
 
232 aa  122  5e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.060018  normal  0.471088 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4608  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
242 aa  113  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21030  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  36 
 
 
257 aa  106  5e-22  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  34.02 
 
 
239 aa  105  6e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2413  hypothetical protein  27.09 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2168  methyltransferase  27.09 
 
 
261 aa  90.9  2e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0114009  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2232  hypothetical protein  26.98 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.933323  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2396  hypothetical protein  26.98 
 
 
262 aa  89.4  6e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2428  hypothetical protein  27.34 
 
 
256 aa  86.7  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00890056  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2497  hypothetical protein  27.2 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  26.59 
 
 
261 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02844  methyltransferase  26.07 
 
 
239 aa  81.6  0.00000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  24.56 
 
 
244 aa  80.9  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003042  methyltransferase  24.35 
 
 
251 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1569  Methyltransferase type 12  25.63 
 
 
258 aa  71.6  0.00000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000138849  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  26.61 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  29.06 
 
 
261 aa  70.1  0.00000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  26.54 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.36 
 
 
232 aa  66.6  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5124  methyltransferase type 11  40.87 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.306844 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3265  methyltransferase type 11  40.87 
 
 
241 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  23.92 
 
 
256 aa  66.2  0.0000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  25.82 
 
 
246 aa  65.1  0.0000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  29.09 
 
 
315 aa  65.1  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  30.66 
 
 
251 aa  63.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  25.23 
 
 
262 aa  63.9  0.000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  34.95 
 
 
244 aa  64.3  0.000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
286 aa  63.9  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.01 
 
 
266 aa  63.9  0.000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  31.54 
 
 
225 aa  63.9  0.000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0587  Methyltransferase type 11  28.95 
 
 
220 aa  63.2  0.000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  24.9 
 
 
251 aa  62.4  0.000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  28.98 
 
 
575 aa  62.4  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  23.18 
 
 
277 aa  62.4  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1218  Tn554 hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000635132  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1341  Tn554 hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.458469  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2512  hypothetical protein  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.452599  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0038  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1712  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  32.5 
 
 
237 aa  61.2  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1746  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0212667  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4343  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  35.85 
 
 
259 aa  61.6  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.90716 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0038  methyltransferase type 12  27.12 
 
 
220 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  27.73 
 
 
258 aa  61.6  0.00000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  31.13 
 
 
247 aa  60.8  0.00000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  36.43 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2918  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase-like protein  38.26 
 
 
241 aa  60.5  0.00000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.536779  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01809  methyltransferase  31.5 
 
 
268 aa  60.5  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  32.5 
 
 
237 aa  59.7  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  34.62 
 
 
296 aa  59.3  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2460  hypothetical protein  33.98 
 
 
281 aa  58.9  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.171848  normal  0.0255916 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  30.83 
 
 
239 aa  58.5  0.00000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  31.67 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  27.19 
 
 
253 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  31.67 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  24.12 
 
 
250 aa  58.5  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  30.83 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2279  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  57.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2251  hypothetical protein  30.77 
 
 
284 aa  57.4  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2814  biotin biosynthesis protein BioC  31.82 
 
 
285 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  31.25 
 
 
237 aa  57.4  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  29.91 
 
 
276 aa  57.4  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  57  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  29.52 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  31.15 
 
 
237 aa  56.6  0.0000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  29.52 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3418  methyltransferase type 12  27.41 
 
 
275 aa  56.6  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.137162  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  29.52 
 
 
249 aa  56.2  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  29.41 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1158  hypothetical protein  26.73 
 
 
239 aa  56.2  0.0000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  38.32 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12280  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methylase  39.13 
 
 
236 aa  56.2  0.0000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  28.57 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  28.57 
 
 
249 aa  55.8  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  27.62 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  30.36 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06424  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  35.09 
 
 
234 aa  55.5  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0035  putative biotin synthesis protein BioC  28.87 
 
 
249 aa  55.5  0.0000009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.194452  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  28.71 
 
 
248 aa  55.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  23.58 
 
 
261 aa  54.7  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4141  putative methyltransferase  31.82 
 
 
273 aa  54.7  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.34511  normal  0.0273084 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.79 
 
 
247 aa  54.7  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  20.1 
 
 
243 aa  55.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1226  methyltransferase  35.29 
 
 
263 aa  54.7  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.581688 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>