243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2856 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009719  Plav_2856  methyltransferase type 12  100 
 
 
269 aa  558  1e-158  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23211 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1181  methyltransferase type 12  69.4 
 
 
268 aa  411  1e-114  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6748  Methyltransferase type 11  71.32 
 
 
267 aa  404  1e-111  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27050  glycine/sarcosine N-methyltransferase  70.66 
 
 
559 aa  398  9.999999999999999e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.59391  normal  0.396997 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1678  methyltransferase type 12  68.16 
 
 
268 aa  397  1e-109  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0186038  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0179  Methyltransferase type 12  66.54 
 
 
272 aa  391  1e-108  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2966  Methyltransferase type 11  68.85 
 
 
572 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17011  glycine-sarcosine methyltransferase  62.31 
 
 
283 aa  342  2.9999999999999997e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.650309 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0677  Methyltransferase type 11  46.75 
 
 
233 aa  228  9e-59  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1068  methyltransferase type 11  47.28 
 
 
258 aa  224  1e-57  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.15636  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
251 aa  95.9  6e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  28.89 
 
 
244 aa  84.3  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  28.04 
 
 
241 aa  75.9  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3055  methyltransferase type 11  25.23 
 
 
249 aa  68.9  0.00000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0287567  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  35.34 
 
 
266 aa  67  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25.45 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1608  hypothetical protein  28.14 
 
 
239 aa  65.1  0.000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.111329  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2485  hypothetical protein  27.74 
 
 
252 aa  65.1  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  27.39 
 
 
269 aa  65.5  0.000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4462  hypothetical protein  25.12 
 
 
249 aa  64.3  0.000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000536455  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4410  hypothetical protein  25.12 
 
 
249 aa  64.7  0.000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.422473  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  25.46 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  25.23 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  25.46 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4075  methyltransferase  25.46 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000412904  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4351  hypothetical protein  25.46 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000420898 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  25.46 
 
 
249 aa  63.5  0.000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  25.23 
 
 
249 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  26.96 
 
 
244 aa  62.8  0.000000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1648  Methyltransferase type 11  29.73 
 
 
260 aa  62.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.53805  normal  0.884834 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4180  methyltransferase type 11  23.47 
 
 
249 aa  62  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00053003  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  32.05 
 
 
304 aa  62  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3557  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
244 aa  62  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  28.57 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1932  methyltransferase type 12  28.08 
 
 
237 aa  60.1  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0715212  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1232  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
246 aa  59.3  0.00000006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000563403  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2237  Methyltransferase type 12  35.83 
 
 
457 aa  58.2  0.0000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0110265  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3235  hypothetical protein  29.13 
 
 
237 aa  58.5  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.255053 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  32.39 
 
 
246 aa  58.5  0.0000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33100  methyltransferase family protein  28.65 
 
 
267 aa  58.2  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.119457  normal  0.302884 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0543  Methyltransferase type 11  25.78 
 
 
247 aa  57.8  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4859  hypothetical protein  26.47 
 
 
254 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.069885 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2179  hypothetical protein  27.91 
 
 
237 aa  57.8  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1895  methyltransferase  27.73 
 
 
239 aa  57  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.283183  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0557  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
261 aa  57  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.958562  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3751  Methyltransferase type 11  31.51 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0170338  normal  0.179038 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  33.62 
 
 
262 aa  56.2  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0517  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00131919  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1911  Methyltransferase type 11  24.64 
 
 
231 aa  56.2  0.0000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0558  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3472  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
262 aa  56.2  0.0000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0911  SAM-dependent methyltransferase  25.5 
 
 
246 aa  56.2  0.0000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000033737  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3933  methyltransferase type 11  31.51 
 
 
257 aa  56.2  0.0000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2749  Methyltransferase type 11  28.17 
 
 
252 aa  55.8  0.0000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  27.73 
 
 
237 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2164  hypothetical protein  22.89 
 
 
231 aa  55.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.84227  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1933  hypothetical protein  26.89 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.246846  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1643  Methyltransferase type 11  32.28 
 
 
246 aa  54.7  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2080  hypothetical protein  26.89 
 
 
237 aa  55.5  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
244 aa  55.1  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  37.96 
 
 
200 aa  55.1  0.000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  28.89 
 
 
315 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3807  methyltransferase type 11  30.82 
 
 
257 aa  54.7  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000356198  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
675 aa  53.9  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  30.77 
 
 
276 aa  53.9  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1148  methyltransferase type 11  32.89 
 
 
215 aa  53.9  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0558  smtA protein  30.14 
 
 
260 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  30.7 
 
 
262 aa  53.5  0.000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  25.59 
 
 
249 aa  53.1  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0081  hypothetical protein  34.45 
 
 
390 aa  52.8  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  0.113144  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2289  hypothetical protein  28.83 
 
 
229 aa  53.1  0.000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.811706  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2368  Methyltransferase type 12  26.19 
 
 
237 aa  52.8  0.000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2872  hypothetical protein  32.48 
 
 
253 aa  52.4  0.000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0272  Methyltransferase type 11  28.37 
 
 
258 aa  52  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  26.42 
 
 
252 aa  52  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  33.02 
 
 
262 aa  51.6  0.00001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1515  methyltransferase domain-containing protein  25.97 
 
 
200 aa  50.8  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0182  hypothetical protein  31.96 
 
 
241 aa  51.2  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.168407  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  31.73 
 
 
248 aa  51.2  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0075  putative methyltransferase  27.97 
 
 
267 aa  50.8  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3316  methyltransferase type 11  29.45 
 
 
257 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00129805  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  24.88 
 
 
249 aa  51.2  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0352  Methyltransferase type 11  26.56 
 
 
249 aa  50.4  0.00003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  26.7 
 
 
204 aa  50.4  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  31.07 
 
 
296 aa  50.4  0.00003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  25 
 
 
276 aa  50.4  0.00003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  32.46 
 
 
221 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
232 aa  50.8  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  29.29 
 
 
250 aa  50.1  0.00004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1298  methyltransferase type 11  26.47 
 
 
269 aa  50.1  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  34.78 
 
 
197 aa  49.7  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  25.2 
 
 
239 aa  50.1  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  29.92 
 
 
258 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1668  LmbE family protein  31.55 
 
 
423 aa  49.7  0.00005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.25 
 
 
204 aa  49.7  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0962  methyltransferase type 12  34.19 
 
 
253 aa  49.7  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6192  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 
254 aa  49.7  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3149  smtA protein  30.53 
 
 
256 aa  49.7  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.572529  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3417  methyltransferase type 12  30.56 
 
 
254 aa  49.3  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2619  O-methyltransferase family protein  25.87 
 
 
217 aa  49.3  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.182241  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>