More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1036 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1036  Methyltransferase type 12  100 
 
 
259 aa  544  1e-154  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00844242 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1306  Methyltransferase type 11  54.47 
 
 
261 aa  288  4e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.805745 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1354  Methyltransferase type 11  51.75 
 
 
262 aa  272  3e-72  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1011  methyltransferase, putative  53.85 
 
 
262 aa  268  7e-71  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.472395  normal  0.034606 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  51.21 
 
 
262 aa  254  1.0000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1338  methyltransferase type 11  49.19 
 
 
280 aa  248  8e-65  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0896  methyltransferase, putative  43.89 
 
 
262 aa  236  2e-61  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
246 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1849  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
255 aa  144  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.391703  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1411  Methyltransferase type 11  32.79 
 
 
246 aa  138  7e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.110905 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0374  methyltransferase  31.6 
 
 
245 aa  133  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08556  methyltransferase, putative  29.51 
 
 
243 aa  126  4.0000000000000003e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2494  methyltransferase type 11  29.2 
 
 
254 aa  124  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.162443  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1113  Methyltransferase type 11  27.76 
 
 
252 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.022337  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0358  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
637 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290663  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0274  Methyltransferase type 11  31.89 
 
 
250 aa  107  2e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000124528  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0655  D-alanine--D-alanine ligase  31.9 
 
 
663 aa  106  4e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.24382  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3970  methyltransferase type 11  30.71 
 
 
259 aa  104  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.280033  normal  0.529582 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1525  methyltransferase type 11  27.2 
 
 
251 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0012912 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0476  putative methyltransferase  27.31 
 
 
253 aa  95.1  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.626019  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2499  hypothetical protein  24.62 
 
 
253 aa  94  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000760916  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4584  Methyltransferase type 11  43.97 
 
 
675 aa  92.8  5e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.519124  normal  0.522952 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5323  methyltransferase type 11  29.61 
 
 
252 aa  91.3  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.426827  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4950  methyltransferase type 11  25.62 
 
 
246 aa  86.3  5e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1842  methyltransferase type 11  36.79 
 
 
244 aa  83.6  0.000000000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4222  Methyltransferase type 11  27.59 
 
 
286 aa  82  0.000000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.743258  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3563  methyltransferase type 11  28.85 
 
 
249 aa  77.8  0.0000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1912  methyltransferase type 11  27.17 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.720989  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  33.63 
 
 
276 aa  75.9  0.0000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  26.37 
 
 
250 aa  75.5  0.0000000000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1804  methyltransferase type 12  33.33 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2283  Methyltransferase type 11  25.81 
 
 
264 aa  72.8  0.000000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161897  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1194  methyltransferase type 11  25.7 
 
 
256 aa  72.8  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1339  Methyltransferase type 11  28.89 
 
 
247 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.150557  normal  0.123836 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1318  methyltransferase type 11  25.89 
 
 
252 aa  70.9  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1006  Methyltransferase type 11  30.26 
 
 
244 aa  69.3  0.00000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02557  conserved hypothetical protein  25.54 
 
 
638 aa  68.2  0.0000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.360755  normal  0.932708 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0137  methyltransferase type 11  26.05 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1959  methyltransferase type 11  23.92 
 
 
244 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1904  Methyltransferase type 11  26.75 
 
 
253 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0016991  normal  0.341052 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0746  Methyltransferase type 11  28.5 
 
 
271 aa  66.2  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.413355  normal  0.162372 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  23.9 
 
 
265 aa  66.2  0.0000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  25 
 
 
541 aa  65.9  0.0000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0719  methyltransferase type 11  26.79 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.340392  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4899  putative SAM-dependent methyltransferase  25.25 
 
 
541 aa  65.1  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00310573 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1346  methyltransferase type 11  23.55 
 
 
258 aa  63.5  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0961707 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3605  methyltransferase type 11  25.96 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.92675 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1735  SAM-dependent methyltransferase  28.57 
 
 
250 aa  63.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2206  Methyltransferase type 11  25.35 
 
 
269 aa  62.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000097592  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4852  putative SAM-dependent methyltransferase  24.75 
 
 
541 aa  62.8  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0491612 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1748  methyltransferase type 11  26.04 
 
 
257 aa  62.8  0.000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.620852  normal  0.453754 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4902  putative SAM-dependent methyltransferase  27.13 
 
 
541 aa  62.4  0.000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1658  hypothetical protein  22.38 
 
 
244 aa  62  0.000000008  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00141764  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4828  methyltransferase domain family  27.13 
 
 
541 aa  62  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1005  Methyltransferase type 11  24.15 
 
 
249 aa  62  0.000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1580  hypothetical protein  22.89 
 
 
269 aa  62  0.000000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0517207  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2453  MCP methyltransferase, CheR-type  25 
 
 
247 aa  61.6  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000207695  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1379  Methyltransferase type 11  22.67 
 
 
251 aa  62  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  23.85 
 
 
262 aa  61.6  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1069  Methyltransferase type 12  32.04 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2902  Methyltransferase type 12  31.78 
 
 
248 aa  61.2  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000000205015  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0646  hypothetical protein  23.47 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0680  hypothetical protein  23.47 
 
 
280 aa  60.1  0.00000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5088  methyltransferase type 12  28.7 
 
 
348 aa  60.1  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115261  normal  0.362219 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  33.96 
 
 
196 aa  59.7  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0164  Methyltransferase type 12  25.55 
 
 
254 aa  59.3  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293192 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6050  Methyltransferase type 12  26.36 
 
 
315 aa  59.7  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0699  methyltransferase type 11  23.2 
 
 
251 aa  58.5  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2907  Methyltransferase type 11  24.76 
 
 
243 aa  57.8  0.0000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1585  Methyltransferase type 12  24.66 
 
 
255 aa  57.4  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.589292  normal  0.167436 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  24.19 
 
 
261 aa  57.4  0.0000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1855  methyltransferase type 11  29.37 
 
 
232 aa  57.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000126246  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1305  methyltransferase type 12  25.79 
 
 
248 aa  56.6  0.0000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.342491  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3656  Methyltransferase type 11  27.08 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.18029 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4867  Methyltransferase type 11  32.41 
 
 
280 aa  57  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0764348  normal  0.125112 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1149  Methyltransferase type 11  23.3 
 
 
241 aa  56.6  0.0000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000285461  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5754  Methyltransferase type 12  27.81 
 
 
272 aa  56.6  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.60689 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07800  methyltransferase family protein  24.1 
 
 
261 aa  56.6  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0235  hypothetical protein  28.43 
 
 
276 aa  56.6  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00250225  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2569  Methyltransferase type 11  26.57 
 
 
257 aa  56.6  0.0000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1615  methyltransferase type 11  23.83 
 
 
252 aa  56.2  0.0000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1814  methyltransferase type 12  25.11 
 
 
263 aa  56.2  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0379  methyltransferase type 11  21.21 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.292052  normal  0.0841223 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0194  Methyltransferase type 12  22.28 
 
 
233 aa  55.8  0.0000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000381708  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0343  methyltransferase type 12  26.79 
 
 
575 aa  55.8  0.0000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1631  3-demethylubiquinone-9 3-methyltransferase  24.86 
 
 
246 aa  55.8  0.0000007  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0788  hypothetical protein  23.56 
 
 
249 aa  55.8  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000039768  hitchhiker  0.00000215266 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13560  Tellurite resistance protein TehB  39.68 
 
 
117 aa  55.5  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2154  methyltransferase  24.07 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4449  hypothetical protein  23.56 
 
 
249 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0469644  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0066  hypothetical protein  24.15 
 
 
272 aa  55.5  0.0000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0856716  normal  0.769266 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2888  hypothetical protein  28.85 
 
 
254 aa  55.1  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0177004  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4227  hypothetical protein  23.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0061415  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4065  methyltransferase  23.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000132189  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2114  Methyltransferase type 11  23.94 
 
 
237 aa  55.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.02 
 
 
190 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4555  hypothetical protein  23.87 
 
 
249 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000250123  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7304  hypothetical protein  32.23 
 
 
296 aa  54.7  0.000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1267  methyltransferase type 12  28.07 
 
 
350 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.628172 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12451  hypothetical protein  25.4 
 
 
348 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.741785 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>