More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0679 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  100 
 
 
196 aa  399  9.999999999999999e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  73.02 
 
 
190 aa  294  5e-79  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  61.38 
 
 
189 aa  228  5e-59  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  48.4 
 
 
190 aa  182  3e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  47.34 
 
 
190 aa  176  1e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  34.43 
 
 
184 aa  90.5  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  37.27 
 
 
181 aa  86.3  2e-16  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  33.17 
 
 
202 aa  87  2e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  34.38 
 
 
195 aa  85.5  5e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  36.59 
 
 
198 aa  84.3  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  39.1 
 
 
199 aa  82.8  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  37.93 
 
 
194 aa  81.6  0.000000000000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  30.94 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  30.21 
 
 
182 aa  78.6  0.00000000000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  32.69 
 
 
202 aa  78.2  0.00000000000007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  37.86 
 
 
200 aa  78.2  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  36.43 
 
 
191 aa  78.2  0.00000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
190 aa  77.8  0.0000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  35.07 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  36.21 
 
 
183 aa  77  0.0000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  34.38 
 
 
200 aa  77.8  0.0000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  33.74 
 
 
193 aa  76.3  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  34.85 
 
 
194 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  36.57 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  38.3 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  44.55 
 
 
200 aa  75.9  0.0000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  36.36 
 
 
188 aa  75.5  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  35.51 
 
 
204 aa  74.3  0.0000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  38.3 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  38.3 
 
 
200 aa  74.7  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  31.06 
 
 
167 aa  73.9  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.97 
 
 
202 aa  73.6  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  32.53 
 
 
200 aa  73.6  0.000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  31.91 
 
 
229 aa  72.8  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  37.59 
 
 
200 aa  72.8  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  31.34 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  31.34 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  31.34 
 
 
200 aa  72  0.000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  34.78 
 
 
217 aa  72  0.000000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  31.34 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  32.53 
 
 
207 aa  71.6  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  38.46 
 
 
201 aa  72  0.000000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  34.3 
 
 
191 aa  71.2  0.000000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  28.29 
 
 
277 aa  71.2  0.000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  35.66 
 
 
149 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  32.72 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  37.59 
 
 
200 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  34.93 
 
 
192 aa  70.5  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  34.04 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  31.68 
 
 
198 aa  70.5  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.85 
 
 
208 aa  70.5  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  31.06 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  33.58 
 
 
200 aa  69.7  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2168  Methyltransferase type 11  32.38 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000153459 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  31.06 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  31.58 
 
 
197 aa  69.7  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  35.82 
 
 
196 aa  69.7  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  31.06 
 
 
198 aa  69.7  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  34.09 
 
 
207 aa  68.9  0.00000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  33.96 
 
 
179 aa  68.9  0.00000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  34.38 
 
 
216 aa  69.3  0.00000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  31.58 
 
 
204 aa  69.3  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  33.96 
 
 
180 aa  68.9  0.00000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  33.7 
 
 
211 aa  68.9  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  42.86 
 
 
194 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  43.96 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  33.09 
 
 
194 aa  68.2  0.00000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  30.77 
 
 
174 aa  67.8  0.00000000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  30.68 
 
 
175 aa  67.4  0.0000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
243 aa  67.8  0.0000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  29.61 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  29.11 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  31.54 
 
 
174 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  34.51 
 
 
188 aa  67  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  34.06 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  30.43 
 
 
198 aa  66.6  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  39.09 
 
 
204 aa  66.6  0.0000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
227 aa  66.6  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.91 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  32.37 
 
 
208 aa  67  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  34.51 
 
 
188 aa  65.9  0.0000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  32.12 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  31.55 
 
 
173 aa  65.9  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  29.44 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  34.81 
 
 
205 aa  65.1  0.0000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4752  putative methionine biosynthesis protein MetW  27.78 
 
 
541 aa  65.1  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.432574 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  42.7 
 
 
243 aa  65.1  0.0000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  34.56 
 
 
190 aa  64.7  0.0000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  35.82 
 
 
223 aa  64.7  0.0000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  29.1 
 
 
200 aa  63.9  0.000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  33.56 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  27.33 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  30 
 
 
211 aa  63.9  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  34.81 
 
 
205 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  31.94 
 
 
176 aa  64.3  0.000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  41.51 
 
 
197 aa  63.9  0.000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>