More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_4677 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  46.77 
 
 
188 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  37.43 
 
 
195 aa  99.8  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  36.9 
 
 
194 aa  92.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  35.39 
 
 
189 aa  89.4  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  34.55 
 
 
200 aa  85.5  5e-16  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0740  methyltransferase type 12  31.33 
 
 
173 aa  82.4  0.000000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.20994  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  34.9 
 
 
182 aa  81.3  0.000000000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  31.79 
 
 
183 aa  78.6  0.00000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  37.28 
 
 
190 aa  77  0.0000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2820  Methyltransferase type 12  37.95 
 
 
180 aa  76.3  0.0000000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.392247 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3216  hypothetical protein  36.71 
 
 
179 aa  75.5  0.0000000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2098  hypothetical protein  32.73 
 
 
194 aa  75.1  0.0000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.379159  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  37.88 
 
 
202 aa  74.7  0.0000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.3 
 
 
196 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0921  methyltransferase type 12  31.18 
 
 
175 aa  74.3  0.0000000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  38.1 
 
 
190 aa  74.3  0.0000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1338  methyltransferase type 11  34.68 
 
 
195 aa  73.9  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.604473 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2245  Methyltransferase type 11  35.71 
 
 
194 aa  72.4  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.486198  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  36.88 
 
 
202 aa  72  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  29.69 
 
 
193 aa  72  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1179  tellurite resistance protein TehB  29.9 
 
 
184 aa  71.2  0.000000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.28171  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  28.74 
 
 
177 aa  70.5  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1144  hypothetical protein  36 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.110241  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  32.29 
 
 
190 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  31.79 
 
 
201 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
204 aa  70.5  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  35.06 
 
 
177 aa  69.3  0.00000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1082  Methyltransferase type 12  37.36 
 
 
188 aa  68.9  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.438542  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5402  hypothetical protein  35.43 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16963  normal  0.740754 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5981  methyltransferase type 12  36 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.134483  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2096  methyltransferase type 12  36 
 
 
200 aa  68.6  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 
208 aa  68.2  0.00000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1067  methyltransferase type 12  38.36 
 
 
191 aa  67.8  0.00000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.737365 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  33.14 
 
 
201 aa  67.8  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2843  putative tellurite resistance protein  27.91 
 
 
194 aa  67.8  0.0000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.524622  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.52 
 
 
183 aa  67.4  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0785  methyltransferase type 12  33.96 
 
 
176 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.319063  normal  0.0244334 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0986  Methyltransferase type 12  37.36 
 
 
188 aa  67.4  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.12709 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2114  hypothetical protein  36 
 
 
200 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.834632  decreased coverage  0.00137784 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.32 
 
 
195 aa  67.8  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5088  methyltransferase type 11  37.66 
 
 
212 aa  66.6  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00483087 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  32.04 
 
 
209 aa  67  0.0000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  32.61 
 
 
290 aa  66.2  0.0000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2133  methyltransferase type 12  35.58 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  36.56 
 
 
216 aa  66.2  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0592  Methyltransferase type 12  27.13 
 
 
181 aa  65.5  0.0000000005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1428  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.675653 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  27 
 
 
202 aa  65.1  0.0000000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  26.76 
 
 
199 aa  64.7  0.0000000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3316  methyltransferase type 12  30.26 
 
 
174 aa  64.7  0.0000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.712949  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  23.78 
 
 
201 aa  64.7  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1178  methyltransferase type 11  35.8 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000106336 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1103  hypothetical protein  35.8 
 
 
191 aa  64.3  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2006  methyltransferase type 11  34.1 
 
 
200 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.534679  hitchhiker  0.00000495846 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0609  hypothetical protein  30.72 
 
 
174 aa  63.9  0.000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.60962 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1661  methyltransferase type 12  30.29 
 
 
192 aa  63.5  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0460253  normal  0.12651 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3169  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
207 aa  63.2  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.217584  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0925  methyltransferase type 12  31.95 
 
 
190 aa  62.8  0.000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.613637  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3503  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  33.85 
 
 
211 aa  62.8  0.000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0810  methyltransferase type 12  29.32 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0743802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3213  methyltransferase type 12  29.22 
 
 
174 aa  62.8  0.000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.77577 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3431  Methyltransferase type 11  37.29 
 
 
189 aa  62.8  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3626  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
181 aa  62.8  0.000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3431  Methyltransferase type 12  28.1 
 
 
181 aa  62.4  0.000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  38.53 
 
 
212 aa  62.4  0.000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0861  methyltransferase type 12  28.1 
 
 
181 aa  62  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  32.8 
 
 
189 aa  62.4  0.000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  31.85 
 
 
217 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  31.85 
 
 
204 aa  62  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  33.14 
 
 
195 aa  62  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25.4 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25.4 
 
 
200 aa  61.6  0.000000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1905  hypothetical protein  32.37 
 
 
187 aa  61.6  0.000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  32.61 
 
 
208 aa  61.6  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1584  hypothetical protein  33.96 
 
 
199 aa  61.2  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.640785  normal  0.458693 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.22 
 
 
200 aa  61.2  0.000000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  37.68 
 
 
207 aa  60.5  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0991  methyltransferase type 11  30.22 
 
 
182 aa  60.5  0.00000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.573855  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  29.65 
 
 
200 aa  60.1  0.00000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1011  methyltransferase type 12  30.77 
 
 
194 aa  59.3  0.00000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1197  methyltransferase type 11  32.56 
 
 
209 aa  59.7  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.750781 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  32.39 
 
 
200 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2549  hypothetical protein  32.7 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00276386  normal  0.0974233 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  34.83 
 
 
277 aa  58.2  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1454  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.64865  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1679  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.756736  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2620  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2181  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.638847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3136  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.00000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.944578  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2700  methyltransferase  31.21 
 
 
205 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2566  hypothetical protein  31.21 
 
 
205 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  31.21 
 
 
200 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  32.32 
 
 
149 aa  57.4  0.0000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  30.2 
 
 
199 aa  57.4  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  29.61 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  29.8 
 
 
168 aa  56.6  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  32.32 
 
 
207 aa  57  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>