265 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3436 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  100 
 
 
198 aa  415  9.999999999999999e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  51.02 
 
 
194 aa  186  1e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  48.47 
 
 
199 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  47.98 
 
 
201 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  45.92 
 
 
201 aa  179  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  51.02 
 
 
194 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  46.23 
 
 
204 aa  169  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  47.96 
 
 
195 aa  168  5e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  46.19 
 
 
200 aa  165  2.9999999999999998e-40  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  44.39 
 
 
197 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  40.4 
 
 
200 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  40.4 
 
 
200 aa  149  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  39.9 
 
 
201 aa  149  4e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  40.31 
 
 
199 aa  148  4e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  38.89 
 
 
200 aa  147  9e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  36.55 
 
 
221 aa  143  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  39.8 
 
 
200 aa  142  3e-33  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  39.59 
 
 
200 aa  138  3.9999999999999997e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  39.2 
 
 
217 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  39.2 
 
 
204 aa  136  2e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  40.82 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  38.58 
 
 
201 aa  134  9.999999999999999e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  36.27 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  39.8 
 
 
213 aa  131  6e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  36.32 
 
 
235 aa  130  9e-30  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  37.19 
 
 
204 aa  128  6e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  35.15 
 
 
207 aa  124  8.000000000000001e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  37.06 
 
 
198 aa  123  2e-27  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  36.55 
 
 
212 aa  123  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34 
 
 
208 aa  121  8e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  35.64 
 
 
207 aa  119  3e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  37.25 
 
 
167 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  36.18 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  36.68 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  34.17 
 
 
211 aa  114  1.0000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  44.6 
 
 
149 aa  109  3e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  35.18 
 
 
205 aa  104  7e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  40.6 
 
 
189 aa  92  5e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  33.93 
 
 
215 aa  90.5  1e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  35.06 
 
 
207 aa  90.1  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  35.44 
 
 
200 aa  88.2  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  30.96 
 
 
197 aa  87  2e-16  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  32.72 
 
 
218 aa  85.1  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  36.59 
 
 
196 aa  84.3  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.14 
 
 
190 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  36.09 
 
 
190 aa  80.5  0.00000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  31.1 
 
 
211 aa  80.5  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  32.8 
 
 
204 aa  79.7  0.00000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  33.17 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  29.63 
 
 
199 aa  79  0.00000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  40.91 
 
 
243 aa  79  0.00000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.34 
 
 
190 aa  78.2  0.00000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  29.45 
 
 
208 aa  78.2  0.00000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  35.14 
 
 
216 aa  76.6  0.0000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  29.32 
 
 
253 aa  74.7  0.0000000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  27.41 
 
 
277 aa  74.3  0.000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.34 
 
 
211 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  33.14 
 
 
243 aa  72.8  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  33.12 
 
 
218 aa  71.6  0.000000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  32.58 
 
 
227 aa  70.9  0.00000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  30.96 
 
 
200 aa  68.2  0.00000000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  29.29 
 
 
195 aa  67  0.0000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
215 aa  66.2  0.0000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  29.67 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  34.09 
 
 
214 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  35.59 
 
 
220 aa  64.3  0.000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0203  Tellurite resistance methyltransferase, TehB, core  31.36 
 
 
193 aa  63.5  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0623092  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  37.59 
 
 
221 aa  61.6  0.000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.88 
 
 
202 aa  61.6  0.000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
210 aa  60.1  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4886  methyltransferase type 12  38.94 
 
 
259 aa  59.7  0.00000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1394  methyltransferase type 12  30.41 
 
 
177 aa  59.7  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  35.04 
 
 
290 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.16 
 
 
194 aa  58.9  0.00000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  30.69 
 
 
188 aa  58.5  0.00000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
226 aa  58.2  0.00000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2639  methyltransferase type 11  31.52 
 
 
195 aa  58.2  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  29.33 
 
 
198 aa  58.2  0.00000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5285  Methyltransferase type 11  29.14 
 
 
220 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  34.56 
 
 
202 aa  57.8  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.67 
 
 
236 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  29.85 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  34.85 
 
 
208 aa  57  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
206 aa  56.6  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
217 aa  57  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  31.79 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  31.79 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  31.79 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  31.79 
 
 
236 aa  56.2  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  32.84 
 
 
196 aa  56.2  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1264  Methyltransferase type 11  31.03 
 
 
262 aa  56.6  0.0000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  30.71 
 
 
217 aa  55.5  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.67 
 
 
236 aa  55.5  0.0000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  31.79 
 
 
236 aa  55.1  0.0000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  28.15 
 
 
229 aa  55.1  0.0000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  30.56 
 
 
222 aa  55.1  0.0000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  38.55 
 
 
204 aa  54.7  0.0000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  32.61 
 
 
221 aa  54.3  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  27.01 
 
 
544 aa  53.9  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>