240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU0570 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  100 
 
 
201 aa  402  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  81.59 
 
 
201 aa  332  2e-90  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  66.49 
 
 
199 aa  258  4e-68  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  59.49 
 
 
200 aa  233  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  58.25 
 
 
195 aa  219  1.9999999999999999e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  54.36 
 
 
204 aa  216  2e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  51.81 
 
 
197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  58.55 
 
 
194 aa  196  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  57.51 
 
 
194 aa  189  2e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  48.76 
 
 
235 aa  181  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  47.98 
 
 
198 aa  181  9.000000000000001e-45  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  39.71 
 
 
221 aa  167  9e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  37.81 
 
 
201 aa  152  4e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  37.81 
 
 
199 aa  150  1e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  35.18 
 
 
200 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  42.42 
 
 
201 aa  148  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  40.51 
 
 
200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  34.67 
 
 
200 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  40.37 
 
 
167 aa  145  5e-34  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  34.67 
 
 
200 aa  145  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  39.6 
 
 
212 aa  142  5e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  40.1 
 
 
204 aa  138  6e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0765  SAM-dependent methyltransferase  43.37 
 
 
213 aa  138  6e-32  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  52.8 
 
 
149 aa  137  7e-32  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  42.23 
 
 
209 aa  137  1e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  39.6 
 
 
208 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  40.1 
 
 
204 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2424  methyltransferase type 11  42.08 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.106259  normal  0.226259 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  40.39 
 
 
217 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  36.89 
 
 
217 aa  132  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  34.65 
 
 
207 aa  132  3e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  36.18 
 
 
200 aa  130  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  42.16 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  36.23 
 
 
207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  41.92 
 
 
207 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0754  methyltransferase type 11  37.76 
 
 
198 aa  119  3.9999999999999996e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.000237312  normal  0.302554 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  35.86 
 
 
205 aa  117  9.999999999999999e-26  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  36.08 
 
 
207 aa  95.5  4e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  36.87 
 
 
200 aa  94  1e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  33.91 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  34.59 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  38.89 
 
 
204 aa  90.9  1e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  36.43 
 
 
190 aa  81.3  0.000000000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.09 
 
 
253 aa  80.1  0.00000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.36 
 
 
210 aa  79  0.00000000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  31.85 
 
 
218 aa  77.8  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  33.85 
 
 
243 aa  76.3  0.0000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  32.35 
 
 
194 aa  75.9  0.0000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
202 aa  73.2  0.000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  32.24 
 
 
218 aa  73.6  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  29.41 
 
 
277 aa  73.6  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  33.79 
 
 
189 aa  73.2  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  29.76 
 
 
211 aa  72.4  0.000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  30.06 
 
 
211 aa  71.6  0.000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  28.57 
 
 
199 aa  70.5  0.00000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  34.04 
 
 
196 aa  70.1  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 
215 aa  69.3  0.00000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2579  hypothetical protein  30.53 
 
 
236 aa  68.6  0.00000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000213687  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  34.25 
 
 
198 aa  68.6  0.00000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  30 
 
 
236 aa  67.4  0.0000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  30.32 
 
 
215 aa  67.4  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  34.21 
 
 
290 aa  67.4  0.0000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2308  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000011894  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  32.84 
 
 
188 aa  67  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2483  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000363722  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  33.58 
 
 
217 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2504  hypothetical protein  30 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  35.88 
 
 
214 aa  66.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2230  methyltransferase  30 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000502541  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  32.24 
 
 
236 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2514  hypothetical protein  28.42 
 
 
222 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000941617  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  33.16 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  33.16 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  34.31 
 
 
208 aa  63.9  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  30.92 
 
 
236 aa  63.9  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  33.16 
 
 
205 aa  64.7  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  29.63 
 
 
206 aa  64.3  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  28.03 
 
 
227 aa  63.5  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  33.79 
 
 
190 aa  63.5  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  38.2 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
216 aa  62.4  0.000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4677  Methyltransferase type 12  33.14 
 
 
191 aa  62.4  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.153561 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  33.96 
 
 
210 aa  62  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0922  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
168 aa  61.6  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  35.56 
 
 
206 aa  60.8  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.88 
 
 
183 aa  60.1  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  31.43 
 
 
226 aa  60.5  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  33.81 
 
 
190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  33.79 
 
 
221 aa  60.5  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  31.13 
 
 
236 aa  59.7  0.00000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1625  methyltransferase type 12  35.42 
 
 
229 aa  59.7  0.00000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  41.43 
 
 
243 aa  59.7  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0823  methyltransferase type 12  28.49 
 
 
183 aa  59.3  0.00000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.180607 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  30.66 
 
 
208 aa  59.3  0.00000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.75 
 
 
223 aa  58.9  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  33.85 
 
 
410 aa  58.9  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  30.22 
 
 
217 aa  58.5  0.00000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  28.16 
 
 
220 aa  58.2  0.00000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  31.62 
 
 
226 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.33 
 
 
227 aa  55.8  0.0000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>