More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_8700 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  100 
 
 
217 aa  439  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  52.91 
 
 
226 aa  208  4e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  50.24 
 
 
208 aa  207  1e-52  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  50.72 
 
 
208 aa  207  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  50.49 
 
 
216 aa  197  1.0000000000000001e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  46.51 
 
 
214 aa  192  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  47.12 
 
 
208 aa  190  2e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  47.57 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  47.57 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  47.57 
 
 
205 aa  181  5.0000000000000004e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  46.58 
 
 
396 aa  171  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  51.74 
 
 
203 aa  162  3e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  43 
 
 
206 aa  154  9e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  44.71 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  46.45 
 
 
204 aa  144  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  44.17 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  44.08 
 
 
206 aa  143  2e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  42.31 
 
 
206 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  37.93 
 
 
210 aa  138  6e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  45.79 
 
 
189 aa  131  6.999999999999999e-30  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  41.98 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  38.76 
 
 
227 aa  113  2.0000000000000002e-24  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  37.73 
 
 
243 aa  108  6e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  40.34 
 
 
196 aa  103  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  36.36 
 
 
211 aa  101  7e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  36.84 
 
 
210 aa  101  1e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  36.62 
 
 
211 aa  99.8  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  39.11 
 
 
227 aa  99.4  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  39.41 
 
 
198 aa  97.1  2e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  36.7 
 
 
223 aa  91.3  1e-17  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  40.85 
 
 
210 aa  91.3  1e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  40.28 
 
 
208 aa  90.9  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  41.13 
 
 
208 aa  87  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  34.83 
 
 
226 aa  85.1  7e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  43.8 
 
 
217 aa  84  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  38.18 
 
 
215 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  42.14 
 
 
218 aa  82.8  0.000000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  41.96 
 
 
197 aa  82.4  0.000000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  37.7 
 
 
410 aa  82.4  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  41.56 
 
 
221 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  40.71 
 
 
218 aa  79  0.00000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  36.11 
 
 
207 aa  78.2  0.0000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40.68 
 
 
204 aa  75.1  0.0000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  36.3 
 
 
544 aa  72  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  36.26 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  35.25 
 
 
215 aa  70.5  0.00000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  33.99 
 
 
200 aa  66.6  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  30.77 
 
 
201 aa  64.3  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  35.48 
 
 
243 aa  64.7  0.000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.62 
 
 
290 aa  62.4  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  28.57 
 
 
204 aa  61.2  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0966  transcriptional regulator, XRE family  29.2 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 
199 aa  61.6  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  38.46 
 
 
177 aa  60.1  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  31.69 
 
 
199 aa  59.7  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0185  tellurite resistance protein TehB  33.08 
 
 
202 aa  60.1  0.00000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  32.84 
 
 
200 aa  60.1  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  34.3 
 
 
200 aa  58.9  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  30.22 
 
 
201 aa  58.5  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.25 
 
 
216 aa  58.5  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  36.5 
 
 
195 aa  58.5  0.00000007  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13140  hypothetical protein  37.31 
 
 
200 aa  58.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.225832 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  30.77 
 
 
204 aa  57.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  28.36 
 
 
190 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  28.14 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  23.35 
 
 
236 aa  56.6  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0114  Methyltransferase type 11  29.66 
 
 
253 aa  56.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  28.97 
 
 
202 aa  55.8  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.48 
 
 
243 aa  55.5  0.0000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  26.49 
 
 
201 aa  55.5  0.0000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  31.03 
 
 
183 aa  55.5  0.0000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.36 
 
 
207 aa  55.5  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  27.91 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  27.94 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3262  tellurite resistance protein TehB  35.62 
 
 
287 aa  54.3  0.000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0181563  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  27.91 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  25.97 
 
 
197 aa  54.7  0.000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  27.94 
 
 
200 aa  54.7  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  28.86 
 
 
217 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  27.91 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  31.5 
 
 
292 aa  54.7  0.000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  27.91 
 
 
197 aa  54.3  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  26.67 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  29.51 
 
 
250 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  27.13 
 
 
197 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  24.82 
 
 
221 aa  53.9  0.000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2599  tellurite resistance protein TehB  27.32 
 
 
298 aa  53.5  0.000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  32.35 
 
 
201 aa  54.3  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1546  NodS  33.88 
 
 
283 aa  53.9  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.377082  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2902  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
183 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  34.59 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2946  methyltransferase type 12  35.29 
 
 
183 aa  54.3  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  23.35 
 
 
236 aa  54.3  0.000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  35.9 
 
 
202 aa  53.5  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2276  methyltransferase  22.84 
 
 
236 aa  53.1  0.000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  4.19659e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  35.4 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  29.85 
 
 
200 aa  53.1  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2775  Methyltransferase type 11  30 
 
 
277 aa  53.5  0.000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  26.44 
 
 
235 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  27.13 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>