More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0609 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  100 
 
 
202 aa  394  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5280  methyltransferase type 12  40.89 
 
 
207 aa  123  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.680539 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4807  Methyltransferase type 12  38.07 
 
 
205 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31140  methyltransferase family protein  46.2 
 
 
179 aa  110  1.0000000000000001e-23  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0478  hypothetical protein  31.34 
 
 
206 aa  108  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0502  hypothetical protein  31.34 
 
 
203 aa  103  1e-21  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000671  SAM-dependent methyltransferase  31.44 
 
 
195 aa  101  8e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.190195  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06550  dimethyladenosine transferase  29.38 
 
 
195 aa  90.1  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11850  methyltransferase family protein  31.66 
 
 
199 aa  88.2  7e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0785893  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  37.68 
 
 
223 aa  71.6  0.000000000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  37.9 
 
 
410 aa  70.9  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6048  methyltransferase type 11  39.63 
 
 
217 aa  70.1  0.00000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.724013 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  40.7 
 
 
227 aa  69.7  0.00000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  34.94 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4951  Methyltransferase type 12  28.49 
 
 
204 aa  65.9  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1722  tellurite resistance protein TehB  34.26 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1786  tellurite resistance protein TehB  34.26 
 
 
198 aa  63.2  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1725  tellurite resistance protein TehB  34.26 
 
 
198 aa  63.2  0.000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.123442  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1407  methyltransferase type 11  31.82 
 
 
196 aa  62.4  0.000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1734  tellurite resistance protein TehB  34.26 
 
 
198 aa  62.4  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  32.28 
 
 
214 aa  60.1  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1553  tellurite resistance protein TehB  33.33 
 
 
198 aa  60.5  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.21 
 
 
217 aa  60.1  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  37.01 
 
 
226 aa  58.9  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30.25 
 
 
199 aa  58.2  0.00000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
221 aa  57.4  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  33.72 
 
 
198 aa  57  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  37.39 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  39.67 
 
 
226 aa  56.6  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  39.82 
 
 
206 aa  56.2  0.0000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.71 
 
 
206 aa  55.8  0.0000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
253 aa  55.8  0.0000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1384  methyltransferase type 11  30.18 
 
 
252 aa  55.5  0.0000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0223759 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  39.62 
 
 
204 aa  55.1  0.0000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  37.61 
 
 
207 aa  54.7  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  30.19 
 
 
198 aa  54.3  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1888  Methyltransferase type 12  41.82 
 
 
314 aa  53.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.664024  normal  0.814069 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3562  Methyltransferase type 11  31.07 
 
 
200 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.50395 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  33.15 
 
 
210 aa  53.5  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  35.14 
 
 
208 aa  53.5  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0592  methyltransferase type 11  23.26 
 
 
221 aa  53.5  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.499783  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  28.85 
 
 
221 aa  52.8  0.000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01387  predicted S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  29.63 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01398  hypothetical protein  29.63 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2230  tellurite resistance protein TehB  29.63 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.665816 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1511  tellurite resistance protein TehB  29.63 
 
 
197 aa  52.8  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2217  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2035  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000211796  hitchhiker  1.4996099999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1745  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 
197 aa  52.4  0.000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000325665  hitchhiker  3.84687e-20 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  30 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2012  Methyltransferase type 11  39.45 
 
 
240 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  30 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  30 
 
 
267 aa  52.4  0.000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1608  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 
197 aa  52  0.000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2790  methyltransferase type 11  28.8 
 
 
201 aa  51.6  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.030207  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  44.83 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  50 
 
 
210 aa  51.2  0.000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  31.86 
 
 
216 aa  50.8  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  28.72 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0925  Methyltransferase type 11  31.45 
 
 
222 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  32.2 
 
 
208 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  41.98 
 
 
206 aa  51.2  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1707  type III restriction protein res subunit  29.38 
 
 
1287 aa  51.2  0.00001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.730362  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0494  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 
228 aa  50.4  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0277441 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  47.69 
 
 
218 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1610  Methyltransferase type 11  28.42 
 
 
225 aa  50.1  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0535703  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  35.71 
 
 
396 aa  50.4  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 
204 aa  50.4  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  40.19 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  26.28 
 
 
247 aa  50.1  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2081  Methyltransferase type 12  28.12 
 
 
242 aa  49.7  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000517184  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  36.28 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  36.28 
 
 
205 aa  50.1  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  28.43 
 
 
245 aa  49.3  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2277  methyltransferase type 11  30.88 
 
 
250 aa  49.3  0.00004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0448979  normal  0.0702037 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  24.82 
 
 
261 aa  48.9  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4063  Methyltransferase type 11  32.85 
 
 
319 aa  48.9  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2707  Methyltransferase type 12  35.67 
 
 
201 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.821475 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1201  Methyltransferase type 12  29.27 
 
 
223 aa  48.5  0.00006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.227994  normal  0.867672 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  37.4 
 
 
196 aa  48.9  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1657  tellurite resistance protein TehB  29.25 
 
 
197 aa  48.5  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4023  methyltransferase type 11  33.88 
 
 
246 aa  48.5  0.00007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.837136  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  34.44 
 
 
208 aa  48.5  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  29.08 
 
 
247 aa  48.5  0.00007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  29.14 
 
 
183 aa  48.1  0.00008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  27.45 
 
 
245 aa  48.1  0.00008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  27.74 
 
 
200 aa  48.1  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1283  hypothetical protein  31.97 
 
 
236 aa  48.1  0.00009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0336066  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  44.59 
 
 
198 aa  47.8  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3949  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
513 aa  47.4  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  33.33 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  29.52 
 
 
292 aa  47.8  0.0001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4343  methyltransferase type 11  33.61 
 
 
246 aa  47.4  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  26.23 
 
 
247 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>