233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2151 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010159  YpAngola_A2429  hypothetical protein  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0353456 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2151  methyltransferase  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2038  putative methyltransferase  100 
 
 
267 aa  558  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2786  putative methyltransferase  89.39 
 
 
247 aa  464  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.133585 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01841  predicted methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1770  methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  441  1e-123  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0054577  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01829  hypothetical protein  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2119  putative methyltransferase  84.43 
 
 
247 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.827404  hitchhiker  0.000192904 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1218  putative methyltransferase  84.84 
 
 
247 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2606  putative methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.987528  normal  0.110802 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2064  putative methyltransferase  84.43 
 
 
247 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00535454 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2059  putative methyltransferase  84.43 
 
 
247 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2101  putative methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1342  putative methyltransferase  84.84 
 
 
247 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.699592  hitchhiker  0.000757661 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1762  methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1316  putative methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1964  putative methyltransferase  83.61 
 
 
247 aa  442  1e-123  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.934324  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2438  putative methyltransferase  83.54 
 
 
246 aa  441  1e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2163  putative methyltransferase  83.2 
 
 
247 aa  440  9.999999999999999e-123  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.1173  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1811  methyltransferase  80 
 
 
261 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2095  methyltransferase  81.56 
 
 
247 aa  426  1e-118  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2265  methyltransferase  82.5 
 
 
247 aa  423  1e-117  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.550845  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2168  methyltransferase  81.07 
 
 
247 aa  419  1e-116  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.869194  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0733  hypothetical protein  72.8 
 
 
246 aa  377  1e-103  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000796812  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003928  tRNA (uridine-5-oxyacetic acid methyl ester) 34 synthase  72.69 
 
 
245 aa  372  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000490734  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01595  SAM-dependent methyltransferase  72.69 
 
 
245 aa  373  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1885  putative methyltransferase  69.33 
 
 
242 aa  364  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1222  SAM-dependent methyltransferase  66.95 
 
 
241 aa  343  2e-93  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.100139  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2112  putative methyltransferase  61.16 
 
 
244 aa  327  1.0000000000000001e-88  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2028  putative methyltransferase  60.67 
 
 
243 aa  313  1.9999999999999998e-84  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0387258  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2368  putative methyltransferase  59.83 
 
 
243 aa  311  9e-84  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0147132  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2081  putative methyltransferase  59 
 
 
243 aa  308  5e-83  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.505974  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2577  methyltransferase  59.41 
 
 
243 aa  308  8e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000779036  hitchhiker  0.00012451 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1933  putative methyltransferase  59.83 
 
 
243 aa  306  2.0000000000000002e-82  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2425  putative methyltransferase  59.41 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.155722  normal  0.279951 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2036  putative methyltransferase  59.41 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2309  putative methyltransferase  59.41 
 
 
243 aa  304  1.0000000000000001e-81  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0515376  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2038  methyltransferase  59.41 
 
 
243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0465007  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2435  methyltransferase, putative  57.74 
 
 
243 aa  300  2e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1951  putative methyltransferase  57.32 
 
 
252 aa  298  6e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1896  putative methyltransferase  57.32 
 
 
243 aa  298  8e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.165716 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2082  putative methyltransferase  57.32 
 
 
243 aa  296  2e-79  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0175574  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2880  methyltransferase  58.51 
 
 
244 aa  294  1e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000271391 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0698  putative methyltransferase  57.08 
 
 
242 aa  293  2e-78  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2669  methyltransferase  57.26 
 
 
244 aa  293  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0079  methyltransferase  55.83 
 
 
251 aa  292  4e-78  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4366  methyltransferase  56.68 
 
 
268 aa  291  5e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0217751 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13860  methyltransferase  55.95 
 
 
247 aa  290  1e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.63223  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1441  methyltransferase, putative  56.79 
 
 
247 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.739299  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4280  putative methyltransferase  56.79 
 
 
247 aa  290  2e-77  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.22084  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1078  methyltransferase  57.2 
 
 
247 aa  289  3e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1403  methyltransferase  57.68 
 
 
270 aa  288  5.0000000000000004e-77  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.133547  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2186  putative methyltransferase  56.67 
 
 
243 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00822239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4027  putative methyltransferase  51.85 
 
 
243 aa  288  8e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1889  methyltransferase  55 
 
 
244 aa  286  2e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000103809  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1845  methyltransferase, putative  57.08 
 
 
243 aa  285  7e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.699945  normal  0.814005 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1482  putative methyltransferase  56.43 
 
 
247 aa  284  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.142219  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2532  methyltransferase  52.29 
 
 
267 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000698097 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1853  methyltransferase  54.17 
 
 
245 aa  282  3.0000000000000004e-75  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.473649 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02156  putative methyltransferase  53.11 
 
 
243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0725617  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4582  methyltransferase  55.6 
 
 
247 aa  280  2e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54260  hypothetical protein  54.73 
 
 
246 aa  278  5e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4212  methyltransferase, putative  54.36 
 
 
247 aa  275  6e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4744  hypothetical protein  53.5 
 
 
252 aa  274  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.149667  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3946  methyltransferase  53.91 
 
 
247 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2762  putative methyltransferase  50.88 
 
 
250 aa  248  8e-65  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2547  methyltransferase  46.86 
 
 
270 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.25018  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1949  methyltransferase protein  42.47 
 
 
262 aa  218  7e-56  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2242  methyltransferase  42.07 
 
 
262 aa  216  2e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0290  putative methyltransferase  43.6 
 
 
274 aa  216  4e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0081  SAM-dependent methyltransferase  42.92 
 
 
245 aa  209  4e-53  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000550828  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2395  methyltransferase  43.62 
 
 
258 aa  206  3e-52  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2311  methyltransferase, putative  36.67 
 
 
288 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.110668  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1109  methyltransferase, putative  34.71 
 
 
234 aa  164  2.0000000000000002e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.831137  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2545  methyltransferase  36.4 
 
 
249 aa  163  3e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.805709 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0511  methyltransferase  36.55 
 
 
235 aa  159  4e-38  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1368  methyltransferase  33.47 
 
 
234 aa  154  1e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0676  conserved hypothetical protein, possible methylase  33.06 
 
 
234 aa  150  3e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.777601  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2818  methyltransferase  32.14 
 
 
260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0693  methyltransferase, putative  35.15 
 
 
235 aa  146  3e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.963107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1562  putative methyltransferase  33.88 
 
 
234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.17303  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0618  methyltransferase, putative  34.73 
 
 
235 aa  144  1e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.161711  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2026  putative methyltransferase  35.56 
 
 
234 aa  144  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0148252  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1078  putative methyltransferase  35.15 
 
 
235 aa  144  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.208989  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1013  putative methyltransferase  33.47 
 
 
234 aa  140  1.9999999999999998e-32  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.500806  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0327  putative methyltransferase  31.84 
 
 
253 aa  135  5e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.554638  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1524  methyltransferase domain-containing protein  31.86 
 
 
228 aa  129  7.000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00000120527  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1269  Methyltransferase type 12  31.07 
 
 
242 aa  113  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.645597  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6995  Methyltransferase type 11  27.89 
 
 
224 aa  86.3  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1508  methyltransferase type 12  23.96 
 
 
228 aa  75.5  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.543742  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2248  demethylmenaquinone methyltransferase  32.04 
 
 
250 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2185  methyltransferase type 11  30.28 
 
 
291 aa  55.5  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.65586  normal  0.0215821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2676  Methyltransferase type 11  33.04 
 
 
231 aa  55.1  0.000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5330  Methyltransferase type 12  24.06 
 
 
221 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.918078  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0912  Methyltransferase type 12  24.06 
 
 
224 aa  54.3  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.734519 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1219  Methyltransferase type 11  30.37 
 
 
269 aa  52.4  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.180898  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0609  Methyltransferase type 12  31.03 
 
 
202 aa  52.4  0.000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.763515  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  31.11 
 
 
222 aa  51.6  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4553  methyltransferase  25.89 
 
 
261 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.749759  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0954  methyltransferase type 11  29.03 
 
 
219 aa  52  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.579245 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>