More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1424 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  100 
 
 		 206 aa  421  1e-117  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  45.23 
 
 		 214 aa  167  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  47.76 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  47.76 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  47.76 
 
 		 205 aa  159  3e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  44.08 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  41.71 
 
 		 226 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  39.13 
 
 		 210 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  38.35 
 
 		 208 aa  131  6e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  41.58 
 
 		 221 aa  130  9e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  39.8 
 
 		 206 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  39.32 
 
 		 206 aa  130  2.0000000000000002e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  38.38 
 
 		 208 aa  129  3e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  44 
 
 		 221 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  37.69 
 
 		 208 aa  124  8.000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  40.1 
 
 		 216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  40.09 
 
 		 243 aa  118  7e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  37.85 
 
 		 396 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 217 aa  112  4.0000000000000004e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  39.81 
 
 		 211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  39.51 
 
 		 211 aa  109  3e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  42.51 
 
 		 204 aa  104  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  39.66 
 
 		 218 aa  103  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  45.58 
 
 		 189 aa  100  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  40.57 
 
 		 253 aa  100  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  38.61 
 
 		 203 aa  99  5e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  40.71 
 
 		 227 aa  93.6  2e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  36.59 
 
 		 210 aa  92.4  4e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  42.22 
 
 		 197 aa  90.9  1e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  43.7 
 
 		 227 aa  87.8  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  33.5 
 
 		 215 aa  83.6  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  43.06 
 
 		 198 aa  83.2  0.000000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  42.44 
 
 		 210 aa  83.6  0.000000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  38.22 
 
 		 196 aa  84  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  39.72 
 
 		 226 aa  80.9  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  38.1 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  41.43 
 
 		 221 aa  80.9  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  37.76 
 
 		 199 aa  79.7  0.00000000000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  40.88 
 
 		 207 aa  79  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  38.62 
 
 		 223 aa  78.6  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  37.96 
 
 		 208 aa  78.2  0.00000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  40.37 
 
 		 204 aa  75.1  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  37.78 
 
 		 215 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  33.58 
 
 		 544 aa  73.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  32.87 
 
 		 202 aa  66.6  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  34.5 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  34.91 
 
 		 200 aa  65.9  0.0000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  35.04 
 
 		 202 aa  65.5  0.0000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  36.09 
 
 		 218 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0971  Methyltransferase type 12  37.31 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  36.45 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  35.56 
 
 		 201 aa  60.8  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2956  methyltransferase type 12  36.13 
 
 		 189 aa  60.8  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.311517 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  33.8 
 
 		 190 aa  60.1  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  37.9 
 
 		 207 aa  59.7  0.00000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  28.67 
 
 		 201 aa  59.3  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3243  methyltransferase type 12  34.45 
 
 		 206 aa  60.1  0.00000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0787423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  35.59 
 
 		 290 aa  59.3  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  35.51 
 
 		 211 aa  59.3  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  30.99 
 
 		 190 aa  58.9  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  34.58 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  33.13 
 
 		 201 aa  58.2  0.00000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3203  methyltransferase type 12  45.95 
 
 		 198 aa  58.2  0.00000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1564  Methyltransferase type 11  28.47 
 
 		 216 aa  58.2  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2159  Methyltransferase type 12  27.46 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00432182  normal  0.0103913 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  35.56 
 
 		 200 aa  58.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  35.43 
 
 		 190 aa  57.8  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3616  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 188 aa  57.4  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.510129  hitchhiker  0.00737353 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  30.99 
 
 		 196 aa  56.6  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  27.82 
 
 		 199 aa  56.6  0.0000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  33.79 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0780  methyltransferase  40.82 
 
 		 382 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00897963  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0832  methyltransferase small  46.05 
 
 		 386 aa  56.2  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131539  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  37.31 
 
 		 209 aa  55.5  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0828  methyltransferase small  46.05 
 
 		 382 aa  55.5  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2850  hypothetical protein  32.26 
 
 		 195 aa  55.5  0.0000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.319967  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  29.32 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  30.3 
 
 		 199 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  38.39 
 
 		 200 aa  53.9  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_28840  methyltransferase family protein  43.08 
 
 		 256 aa  53.5  0.000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.247928 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11406  transferase  40.24 
 
 		 212 aa  53.5  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000309281  normal  0.307952 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0025  tellurite resistance protein  39.47 
 
 		 194 aa  53.1  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0712  Methyltransferase type 11  31.39 
 
 		 246 aa  53.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1460  methyltransferase type 11  36.27 
 
 		 295 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.60854  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1507  tellurite resistance protein TehB  31.58 
 
 		 292 aa  52.8  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0318008  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0911  tellurite resistance protein TehB  27.61 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.253451  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.86 
 
 		 195 aa  52.8  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2289  methyltransferase type 11  26.42 
 
 		 236 aa  52.4  0.000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000192074  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1566  Methyltransferase type 11  46 
 
 		 199 aa  52.4  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.131267  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2691  putative protoporphyrinogen oxidase  46.48 
 
 		 287 aa  52.4  0.000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0268628  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2437  hypothetical protein  35.37 
 
 		 236 aa  52  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000255199  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  31.3 
 
 		 212 aa  52  0.000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  32.21 
 
 		 219 aa  52  0.000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0258  UbiE/COQ5 family methlytransferase  40 
 
 		 250 aa  52  0.000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25.93 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0435  thiopurine S-methyltransferase  33.33 
 
 		 207 aa  52  0.000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2899  hypothetical protein  34.57 
 
 		 236 aa  52  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000010502  normal  0.0506013 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25.93 
 
 		 200 aa  52  0.000007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>