More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2590 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  100 
 
 
253 aa  507  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  43.35 
 
 
218 aa  145  6e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  48.1 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  40.95 
 
 
211 aa  135  7.000000000000001e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  46.57 
 
 
210 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  41.35 
 
 
211 aa  129  6e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  53.1 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  46.31 
 
 
198 aa  125  7e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  42.57 
 
 
223 aa  124  2e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  41.98 
 
 
243 aa  123  3e-27  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  43.14 
 
 
227 aa  117  9.999999999999999e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23050  methyltransferase family protein  50.72 
 
 
410 aa  117  9.999999999999999e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.294181 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  40.98 
 
 
214 aa  115  5e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1171  methyltransferase type 11  41.04 
 
 
544 aa  114  1.0000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.795011 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4789  Methyltransferase type 11  40.61 
 
 
208 aa  109  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0500358  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  39.39 
 
 
226 aa  105  9e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3021  Methyltransferase type 11  42.36 
 
 
215 aa  104  1e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  39 
 
 
208 aa  105  1e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  36.84 
 
 
196 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40.5 
 
 
208 aa  103  3e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  36.71 
 
 
221 aa  102  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  38.05 
 
 
210 aa  102  7e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1332  Methyltransferase type 11  39.04 
 
 
218 aa  100  2e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0643873  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  40.57 
 
 
206 aa  100  3e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  38.35 
 
 
208 aa  96.7  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  42.11 
 
 
205 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  42.11 
 
 
205 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  42.11 
 
 
205 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5552  methyltransferase type 11  41.67 
 
 
226 aa  95.1  9e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  37.56 
 
 
221 aa  95.1  9e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  43.88 
 
 
206 aa  95.1  9e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  48.41 
 
 
189 aa  92.8  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  42.77 
 
 
221 aa  92.8  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  45.16 
 
 
217 aa  90.5  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0489  methyltransferase type 12  40 
 
 
197 aa  90.1  3e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.178372 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67540  hypothetical protein  38.16 
 
 
194 aa  89.7  4e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0146404  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2760  tellurite resistance protein TehB, putative  39.16 
 
 
200 aa  89.4  5e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2025  tellurite resistance protein TehB  33.56 
 
 
197 aa  89  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2955  tellurite resistance protein TehB  32.86 
 
 
201 aa  87.8  1e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.511767 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1695  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 
199 aa  87.8  1e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.111068 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1948  type 12 methyltransferase  36.56 
 
 
204 aa  87.8  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.253251 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  37.72 
 
 
206 aa  86.7  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5848  hypothetical protein  39.47 
 
 
194 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00432181  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  40 
 
 
204 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 
216 aa  82.4  0.000000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1936  Methyltransferase type 11  36.96 
 
 
199 aa  82  0.000000000000007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0477895  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0983  methyltransferase type 12  36.26 
 
 
200 aa  81.6  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0570  hypothetical protein  33.09 
 
 
201 aa  80.1  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0435  Methyltransferase type 12  39.47 
 
 
243 aa  80.1  0.00000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1406  methyltransferase type 11  30.26 
 
 
195 aa  80.1  0.00000000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.4469  normal  0.313773 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.5 
 
 
227 aa  79.3  0.00000000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0055  hypothetical protein  37.04 
 
 
207 aa  78.6  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1441  methyltransferase type 11  35 
 
 
200 aa  78.6  0.00000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2634  methyltransferase type 11  33.74 
 
 
211 aa  77.8  0.0000000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2381  SAM-dependent methyltransferase  38.62 
 
 
209 aa  78.2  0.0000000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2302  hypothetical protein  33.58 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.123657 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3436  Methyltransferase type 12  29.32 
 
 
198 aa  74.7  0.000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.482308  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1041  Methyltransferase type 11  29.86 
 
 
167 aa  72.8  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.417194 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4631  methyltransferase type 11  28.03 
 
 
207 aa  72.4  0.000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2330  hypothetical protein  32.16 
 
 
201 aa  72.4  0.000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.43213 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3915  methyltransferase type 11  31.94 
 
 
290 aa  72  0.000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.525409  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1252  methyltransferase type 11  34.04 
 
 
212 aa  71.2  0.00000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000791929 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  36.26 
 
 
217 aa  70.9  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  36.95 
 
 
203 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3784  tellurite resistance protein TehB, putative  27.74 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.100307 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_56585  predicted protein  27.15 
 
 
235 aa  69.7  0.00000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3545  Methyltransferase type 11  37.5 
 
 
207 aa  69.3  0.00000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.123486  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  28.63 
 
 
396 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1452  Methyltransferase type 11  31.94 
 
 
202 aa  68.6  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0103  Methyltransferase type 11  31.98 
 
 
200 aa  68.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  31.33 
 
 
208 aa  68.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3405  methyltransferase type 11  34.59 
 
 
204 aa  67.4  0.0000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.131198  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2515  hypothetical protein  27.66 
 
 
201 aa  67.4  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.04642 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1365  methyltransferase type 12  31.37 
 
 
189 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0655112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2830  tellurite resistance protein TehB  35.81 
 
 
190 aa  66.6  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.071513  hitchhiker  0.000000054352 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2778  methyltransferase  26.71 
 
 
199 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0780  methyltransferase type 11  28.47 
 
 
221 aa  66.2  0.0000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000136853  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0471  Methyltransferase type 11  40.16 
 
 
202 aa  65.5  0.0000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0163  methyltransferase type 11  28.68 
 
 
149 aa  64.7  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00536524 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2569  methyltransferase type 11  24.31 
 
 
200 aa  63.9  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.274719  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2568  methyltransferase type 11  35.48 
 
 
199 aa  63.9  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4027  methyltransferase type 12  32.87 
 
 
215 aa  64.3  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.372751  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2580  hypothetical protein  25.52 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0144488  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2767  hypothetical protein  25.52 
 
 
200 aa  63.2  0.000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.628129  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2389  methyltransferase type 11  39.5 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1544  Methyltransferase type 11  34.92 
 
 
200 aa  62  0.000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.580406  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5269  Methyltransferase type 12  39.5 
 
 
219 aa  62  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4165  Methyltransferase type 12  31.88 
 
 
177 aa  61.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.362232  normal  0.0202921 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1191  Methyltransferase type 12  32 
 
 
204 aa  60.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3917  Methyltransferase type 11  32.93 
 
 
243 aa  60.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1939  hypothetical protein  34.67 
 
 
208 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1185  methyltransferase type 11  33.33 
 
 
204 aa  60.1  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1975  tellurite resistance protein TehB  29.46 
 
 
198 aa  60.5  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.940413  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0256  Methyltransferase type 12  36.43 
 
 
182 aa  60.1  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2244  tellurite resistance protein TehB  29.93 
 
 
205 aa  60.1  0.00000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.926743  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0893  Methyltransferase type 12  36.03 
 
 
190 aa  58.9  0.00000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000264031  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0679  tellurite resistance protein-related protein  32.67 
 
 
196 aa  58.9  0.00000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.462873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1053  tellurite resistance protein TehB  32.67 
 
 
217 aa  58.5  0.00000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0656  Methyltransferase type 11  30.65 
 
 
199 aa  58.5  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00098603 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3368  Methyltransferase type 12  35.29 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>