232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1712 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  100 
 
 		 396 aa  780    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2657  Methyltransferase type 11  49.77 
 
 		 216 aa  188  1e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.287641  normal  0.273767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8700  Methyltransferase type 12  46.58 
 
 		 217 aa  171  2e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.257362 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  59.12 
 
 		 169 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  57.34 
 
 		 144 aa  159  6e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4624  methyltransferase type 12  43.38 
 
 		 208 aa  154  2.9999999999999998e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.343736 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02040  methyltransferase family protein  42.99 
 
 		 208 aa  153  5e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5085  methyltransferase type 12  50 
 
 		 226 aa  152  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  59.87 
 
 		 155 aa  150  4e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2612  methyltransferase type 11  40 
 
 		 208 aa  139  1e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.353861  normal  0.593702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5293  Methyltransferase type 12  40.09 
 
 		 214 aa  138  2e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2998  Methyltransferase type 11  46.05 
 
 		 203 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.527605  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3339  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 205 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.102767  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3401  methyltransferase type 12  38.81 
 
 		 205 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.476106 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3350  methyltransferase type 11  38.81 
 
 		 205 aa  121  3e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.318139  normal  0.267702 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  45.77 
 
 		 145 aa  116  7.999999999999999e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2129  Methyltransferase type 12  43.38 
 
 		 221 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.491227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1424  methyltransferase type 11  37.85 
 
 		 206 aa  112  8.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.96391 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  45.18 
 
 		 166 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0531  Methyltransferase type 12  38.16 
 
 		 221 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3264  methyltransferase type 12  39.89 
 
 		 210 aa  107  3e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2895  methyltransferase type 11  41.07 
 
 		 206 aa  107  4e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.1081  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0482  Methyltransferase type 12  47.59 
 
 		 204 aa  106  8e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.276366 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3615  methyltransferase type 11  34.4 
 
 		 206 aa  103  5e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.473931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  45.51 
 
 		 172 aa  100  4e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  41.1 
 
 		 169 aa  98.2  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0214  Methyltransferase type 11  39.74 
 
 		 217 aa  98.6  2e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0641979  hitchhiker  0.00422733 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00940  16S RNA G1207 methylase RsmC  34.93 
 
 		 227 aa  97.8  3e-19  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  43.51 
 
 		 163 aa  93.2  8e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3908  methyltransferase type 12  53.51 
 
 		 189 aa  89  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.29001  normal  0.0967044 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3049  Methyltransferase type 11  40.67 
 
 		 210 aa  89.4  1e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0255211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  40.85 
 
 		 171 aa  89.4  1e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2027  Methyltransferase type 11  37.21 
 
 		 198 aa  88.6  2e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.256005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  36.08 
 
 		 186 aa  87.4  4e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  38.75 
 
 		 198 aa  87  5e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  40.25 
 
 		 155 aa  86.7  7e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  37.42 
 
 		 173 aa  85.1  0.000000000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0430  methyltransferase type 12  35.19 
 
 		 210 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.28527  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0294  methyltransferase type 11  34.06 
 
 		 211 aa  83.6  0.000000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.293547 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3500  Methyltransferase type 11  35.27 
 
 		 243 aa  82.8  0.000000000000009  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0524086 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  37.42 
 
 		 168 aa  82.8  0.00000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0255  methyltransferase type 12  33.04 
 
 		 211 aa  81.3  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0188144 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  35.76 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  39.76 
 
 		 172 aa  78.6  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  35.33 
 
 		 179 aa  78.2  0.0000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  38.06 
 
 		 202 aa  78.6  0.0000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3824  Methyltransferase type 11  41.71 
 
 		 227 aa  77.8  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.38961  normal  0.0618413 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  34.97 
 
 		 171 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  35.9 
 
 		 201 aa  77.8  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  36.77 
 
 		 175 aa  77.4  0.0000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1279  Methyltransferase type 12  37.5 
 
 		 217 aa  77  0.0000000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.921439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  35.22 
 
 		 165 aa  76.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  32 
 
 		 223 aa  76.3  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  36.65 
 
 		 224 aa  75.1  0.000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  38.82 
 
 		 175 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  32.92 
 
 		 195 aa  74.7  0.000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  37.5 
 
 		 192 aa  74.7  0.000000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  39.87 
 
 		 204 aa  73.9  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  36.47 
 
 		 175 aa  74.3  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  35.76 
 
 		 181 aa  73.6  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  35.54 
 
 		 170 aa  73.6  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  37.64 
 
 		 188 aa  72.8  0.00000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  49.33 
 
 		 126 aa  72.8  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  36.63 
 
 		 179 aa  72.4  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  34.16 
 
 		 195 aa  72.4  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  37.72 
 
 		 196 aa  72  0.00000000002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  33.11 
 
 		 187 aa  72  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  34.32 
 
 		 177 aa  71.2  0.00000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5314  methyltransferase type 11  34.36 
 
 		 221 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.520408  normal  0.0718819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  70.5  0.00000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  34.78 
 
 		 165 aa  70.1  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23110  methyltransferase family protein  34.88 
 
 		 223 aa  68.9  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.195882  normal  0.375364 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2590  Methyltransferase type 11  28.63 
 
 		 253 aa  68.9  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2025  Methyltransferase type 12  38.16 
 
 		 208 aa  68.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0356905 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  35.19 
 
 		 187 aa  68.6  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  36.02 
 
 		 170 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  36.47 
 
 		 189 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  37.74 
 
 		 175 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  34.18 
 
 		 173 aa  68.9  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  33.52 
 
 		 180 aa  68.9  0.0000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  35.22 
 
 		 202 aa  67.8  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  35.76 
 
 		 168 aa  67.8  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  34.1 
 
 		 179 aa  67.8  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  32 
 
 		 190 aa  67.4  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4970  Methyltransferase type 12  33.5 
 
 		 196 aa  67.4  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.460343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  28.16 
 
 		 169 aa  67  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  34.46 
 
 		 165 aa  66.6  0.0000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  36.81 
 
 		 171 aa  66.6  0.0000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  31.33 
 
 		 204 aa  66.2  0.0000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  33.92 
 
 		 179 aa  65.9  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0662  methyltransferase type 12  39.55 
 
 		 200 aa  65.1  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0104369  normal  0.229717 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  34.59 
 
 		 176 aa  65.5  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  33.12 
 
 		 165 aa  64.7  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  30.23 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  30.23 
 
 		 200 aa  64.3  0.000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  32.54 
 
 		 170 aa  64.3  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  32.16 
 
 		 191 aa  63.9  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  30.23 
 
 		 200 aa  63.5  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5488  Methyltransferase type 12  33.49 
 
 		 218 aa  63.2  0.000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.254106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  32.34 
 
 		 170 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>