90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2210 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
173 aa  343  5e-94  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  47.51 
 
 
179 aa  128  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  45.03 
 
 
167 aa  127  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  45.71 
 
 
175 aa  124  7e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  43.02 
 
 
168 aa  123  1e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  44.77 
 
 
175 aa  122  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  43.5 
 
 
191 aa  120  9e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  43.48 
 
 
179 aa  110  9e-24  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  40.33 
 
 
190 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  43.82 
 
 
179 aa  108  5e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  41.24 
 
 
177 aa  107  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  41.42 
 
 
170 aa  107  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  42.37 
 
 
170 aa  106  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  42.35 
 
 
175 aa  106  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  41.18 
 
 
173 aa  105  3e-22  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  39.89 
 
 
170 aa  104  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  40.57 
 
 
187 aa  103  1e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  42.62 
 
 
181 aa  102  3e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  39.53 
 
 
169 aa  101  5e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  44.52 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  42.11 
 
 
169 aa  95.9  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  37.04 
 
 
166 aa  96.3  2e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  39.62 
 
 
172 aa  90.1  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  37.43 
 
 
171 aa  89.4  2e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  36.02 
 
 
179 aa  88.6  4e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  37.64 
 
 
180 aa  87  1e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  38.61 
 
 
186 aa  86.3  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  37.99 
 
 
188 aa  85.5  4e-16  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  37.43 
 
 
169 aa  82  0.000000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  35.96 
 
 
189 aa  81.6  0.000000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  35.5 
 
 
172 aa  80.1  0.00000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  37.42 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  39.63 
 
 
175 aa  77.8  0.00000000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  36.72 
 
 
170 aa  77  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  34.32 
 
 
171 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  36.63 
 
 
189 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  34.38 
 
 
168 aa  75.1  0.0000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  34.52 
 
 
186 aa  72.8  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  34.52 
 
 
172 aa  72  0.000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  41.88 
 
 
174 aa  71.2  0.000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  30.41 
 
 
177 aa  68.2  0.00000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  35.56 
 
 
192 aa  67.8  0.00000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  31.55 
 
 
204 aa  67.8  0.00000000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  31.74 
 
 
187 aa  66.2  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  36.08 
 
 
183 aa  65.5  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  30.52 
 
 
145 aa  65.1  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  33.13 
 
 
155 aa  64.7  0.0000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  28.82 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  28.82 
 
 
200 aa  64.3  0.0000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  31.25 
 
 
170 aa  63.9  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  28.24 
 
 
200 aa  63.5  0.000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  37.35 
 
 
155 aa  63.2  0.000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  32.58 
 
 
196 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 
223 aa  62.8  0.000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  31.87 
 
 
176 aa  62.8  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  33.71 
 
 
183 aa  62  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  34.16 
 
 
189 aa  61.6  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  32.68 
 
 
153 aa  61.6  0.000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  29.76 
 
 
195 aa  61.2  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  34.18 
 
 
396 aa  60.8  0.000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  28.48 
 
 
195 aa  60.5  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  27.65 
 
 
199 aa  60.1  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  35.33 
 
 
171 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  30.06 
 
 
189 aa  58.9  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  29.08 
 
 
191 aa  58.9  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  31.69 
 
 
211 aa  58.2  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  28.49 
 
 
197 aa  57.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  30.57 
 
 
165 aa  57  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  30.14 
 
 
198 aa  56.6  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  31.01 
 
 
165 aa  55.5  0.0000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  31.61 
 
 
204 aa  55.5  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  30.72 
 
 
224 aa  55.5  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  75 
 
 
126 aa  55.1  0.0000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  30.13 
 
 
163 aa  54.7  0.0000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  53.5  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0081  protein of unknown function DUF664  29.38 
 
 
193 aa  53.1  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  29.87 
 
 
204 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  30.67 
 
 
175 aa  52.4  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  29.73 
 
 
201 aa  52  0.000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  34.97 
 
 
166 aa  51.6  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  28.14 
 
 
195 aa  51.6  0.000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  30.19 
 
 
162 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  62.86 
 
 
93 aa  47.8  0.00008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  31.64 
 
 
202 aa  47.4  0.0001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  26.32 
 
 
185 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  27.84 
 
 
202 aa  46.6  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  31.74 
 
 
196 aa  45.4  0.0004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  30.77 
 
 
164 aa  44.7  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  29.23 
 
 
192 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>