54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0081 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0081  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
193 aa  390  1e-108  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  46.06 
 
 
189 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  42.11 
 
 
177 aa  117  7e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  43.71 
 
 
172 aa  116  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  42.77 
 
 
175 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  41.25 
 
 
204 aa  105  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  37.3 
 
 
186 aa  101  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  34.1 
 
 
187 aa  97.8  9e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  41.07 
 
 
183 aa  92.8  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  37.02 
 
 
211 aa  91.3  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  33.68 
 
 
191 aa  86.3  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  38.59 
 
 
185 aa  82.4  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  33.87 
 
 
199 aa  78.2  0.00000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  33.87 
 
 
195 aa  75.9  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  35.35 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  35.35 
 
 
200 aa  75.5  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  30.65 
 
 
197 aa  74.3  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  33.84 
 
 
200 aa  73.9  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  32.6 
 
 
202 aa  72.8  0.000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  33.58 
 
 
170 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  32.65 
 
 
172 aa  62  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  31.43 
 
 
168 aa  55.8  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  29.38 
 
 
173 aa  53.1  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  30.82 
 
 
165 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  30.38 
 
 
175 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  28.86 
 
 
165 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  29.52 
 
 
169 aa  50.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  30.41 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  31.29 
 
 
171 aa  49.7  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  28.93 
 
 
169 aa  48.9  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  31.43 
 
 
189 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  33.58 
 
 
162 aa  48.1  0.00008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  28.4 
 
 
179 aa  47.8  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  30.99 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  32.69 
 
 
165 aa  47  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  28.37 
 
 
164 aa  46.6  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  30.06 
 
 
167 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  32.93 
 
 
155 aa  46.2  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  29.17 
 
 
186 aa  46.2  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  29.76 
 
 
172 aa  45.8  0.0004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  31.91 
 
 
176 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  30.86 
 
 
224 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  32.54 
 
 
174 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  32.5 
 
 
169 aa  45.1  0.0007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  29.81 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  28.48 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  30.37 
 
 
144 aa  43.5  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  29.87 
 
 
198 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  27.98 
 
 
189 aa  43.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  28.4 
 
 
165 aa  42.7  0.004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  29.31 
 
 
166 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  26.67 
 
 
170 aa  42  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  29.94 
 
 
175 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  27.81 
 
 
187 aa  41.2  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>