79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0477 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  100 
 
 
186 aa  376  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  50.27 
 
 
190 aa  150  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  48.66 
 
 
187 aa  142  4e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  45 
 
 
191 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  52.38 
 
 
174 aa  124  1e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  42.31 
 
 
167 aa  101  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  44.23 
 
 
175 aa  99.4  3e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  37.14 
 
 
190 aa  97.1  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  39.88 
 
 
170 aa  92.8  2e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  40.13 
 
 
180 aa  92.8  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  37.64 
 
 
175 aa  91.3  7e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2390  hypothetical protein  38.18 
 
 
170 aa  89.4  3e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.265375  hitchhiker  0.00746099 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  36.2 
 
 
168 aa  88.6  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  38.92 
 
 
177 aa  88.2  6e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  39.64 
 
 
173 aa  87  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  38.61 
 
 
173 aa  86.3  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  36.94 
 
 
170 aa  85.1  6e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2662  hypothetical protein  36.71 
 
 
170 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.0065374  normal  0.130482 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  37.36 
 
 
175 aa  80.1  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  35.85 
 
 
163 aa  79.3  0.00000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  38.07 
 
 
179 aa  79.3  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  37.72 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  39.02 
 
 
179 aa  78.2  0.00000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  37.93 
 
 
169 aa  77.4  0.0000000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  34.05 
 
 
181 aa  77.4  0.0000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  36.2 
 
 
172 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  36.87 
 
 
188 aa  72.4  0.000000000004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  36.6 
 
 
169 aa  71.6  0.000000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  34.73 
 
 
175 aa  69.7  0.00000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  34.03 
 
 
166 aa  68.2  0.00000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  36.14 
 
 
189 aa  63.9  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  35.26 
 
 
172 aa  63.5  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  33.12 
 
 
171 aa  62  0.000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  36.6 
 
 
155 aa  61.6  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  35.23 
 
 
196 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  36.18 
 
 
189 aa  60.1  0.00000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5401  protein of unknown function DUF664  32.96 
 
 
189 aa  58.9  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5542  protein of unknown function DUF664  32.54 
 
 
171 aa  58.9  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  32.89 
 
 
192 aa  58.5  0.00000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  32.92 
 
 
187 aa  57.4  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  57.8  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  34.15 
 
 
183 aa  56.6  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  33.54 
 
 
224 aa  56.2  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  32.58 
 
 
172 aa  55.5  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  35.66 
 
 
211 aa  55.1  0.0000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  32.88 
 
 
145 aa  53.9  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3880  hypothetical protein  31.17 
 
 
153 aa  54.3  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00585365 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  31.95 
 
 
183 aa  53.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  52.8  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  32.21 
 
 
175 aa  52.4  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4040  protein of unknown function DUF664  29.65 
 
 
177 aa  52  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0936  hypothetical protein  31.65 
 
 
165 aa  52  0.000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  33.94 
 
 
202 aa  51.6  0.000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  29.22 
 
 
186 aa  50.4  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  30.77 
 
 
171 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  30.63 
 
 
204 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1029  protein of unknown function DUF664  32.84 
 
 
165 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  29.76 
 
 
179 aa  50.1  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  43.33 
 
 
93 aa  50.1  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  30.72 
 
 
170 aa  49.3  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  27.44 
 
 
197 aa  49.3  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  29.24 
 
 
223 aa  48.9  0.00004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  31.29 
 
 
199 aa  48.1  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2794  protein of unknown function DUF664  34.06 
 
 
164 aa  48.1  0.00007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.127816  hitchhiker  0.00105731 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  31.52 
 
 
168 aa  47.4  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  36.84 
 
 
126 aa  47.8  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  32.58 
 
 
162 aa  47  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  30.46 
 
 
396 aa  46.2  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0081  protein of unknown function DUF664  29.17 
 
 
193 aa  46.2  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.651534  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  28.92 
 
 
204 aa  45.8  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  30.72 
 
 
198 aa  44.3  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  29.61 
 
 
191 aa  43.1  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  28.67 
 
 
192 aa  42.7  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19820  Protein of unknown function (DUF664)  30.56 
 
 
185 aa  42.7  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.867653  hitchhiker  0.00266163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  35 
 
 
196 aa  42  0.005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5699  hypothetical protein  29.33 
 
 
165 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  30.08 
 
 
201 aa  41.6  0.007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  66.67 
 
 
155 aa  41.2  0.008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3866  protein of unknown function DUF664  26.76 
 
 
166 aa  41.2  0.008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542757  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>