78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_2348 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_2348  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  186  9e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4677  hypothetical protein  92.39 
 
 		 163 aa  169  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.371903  hitchhiker  0.009196 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0822  hypothetical protein  67.44 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1218  protein of unknown function DUF664  45.56 
 
 		 172 aa  82  0.000000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.299691  normal  0.0138946 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2107  hypothetical protein  45.05 
 
 		 204 aa  68.6  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0659  protein of unknown function DUF664  43.21 
 
 		 192 aa  56.6  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.689351  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3852  hypothetical protein  41.86 
 
 		 224 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07380  Protein of unknown function (DUF664)  40.86 
 
 		 186 aa  56.6  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2101  hypothetical protein  41.98 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2084  protein of unknown function DUF664  37.35 
 
 		 168 aa  55.5  0.0000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.623547  normal  0.184805 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2997  protein of unknown function DUF664  44.16 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.773925  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27250  Protein of unknown function (DUF664)  41.98 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0119129  normal  0.205212 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6807  hypothetical protein  42.25 
 
 		 170 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.378283 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0256  protein of unknown function DUF664  42.35 
 
 		 204 aa  54.7  0.0000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3296  protein of unknown function DUF664  42.86 
 
 		 223 aa  53.9  0.0000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.461354  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21220  Protein of unknown function (DUF664)  36.78 
 
 		 179 aa  52.4  0.000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.087402 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3489  protein of unknown function DUF664  35.96 
 
 		 192 aa  52.4  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.920969 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1132  putative mini-circle protein  75 
 
 		 126 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0432  hypothetical protein  36.25 
 
 		 171 aa  52  0.000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5165  protein of unknown function DUF664  40.86 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0756  hypothetical protein  65.71 
 
 		 172 aa  51.6  0.000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1712  protein of unknown function DUF664  57.89 
 
 		 396 aa  51.6  0.000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.833609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27380  Protein of unknown function (DUF664)  35.56 
 
 		 171 aa  50.8  0.000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.612683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2316  hypothetical protein  67.65 
 
 		 175 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.299427  normal  0.014207 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8367  protein of unknown function DUF664  37.5 
 
 		 198 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4136  protein of unknown function DUF664  36.78 
 
 		 189 aa  50.4  0.000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.319795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1764  hypothetical protein  42.25 
 
 		 145 aa  49.7  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.273474 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0477  protein of unknown function DUF664  43.33 
 
 		 186 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0585  protein of unknown function DUF664  43.59 
 
 		 202 aa  49.3  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.106985 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7026  protein of unknown function DUF664  65.62 
 
 		 155 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.99462  normal  0.259189 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0233  protein of unknown function DUF664  63.89 
 
 		 181 aa  48.1  0.00004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5436  hypothetical protein  40.91 
 
 		 176 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.315547  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3198  protein of unknown function DUF664  61.76 
 
 		 179 aa  47.8  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1689  protein of unknown function DUF664  41.1 
 
 		 183 aa  47.8  0.00006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2210  protein of unknown function DUF664  62.86 
 
 		 173 aa  47.8  0.00006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.498453  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3380  hypothetical protein  39.08 
 
 		 144 aa  47.4  0.00007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.499473 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0741  protein of unknown function DUF664  33.33 
 
 		 196 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5245  hypothetical protein  41.46 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.373834 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5084  hypothetical protein  65.62 
 
 		 169 aa  47  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1061  protein of unknown function DUF664  35.35 
 
 		 169 aa  46.2  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.957525  normal  0.854466 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3868  protein of unknown function DUF664  37.35 
 
 		 172 aa  45.4  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2899  hypothetical protein  34.83 
 
 		 195 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.792533 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5225  hypothetical protein  55.26 
 
 		 204 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.401061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3455  protein of unknown function DUF664  44.26 
 
 		 179 aa  46.2  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00229137  hitchhiker  0.00402498 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1618  hypothetical protein  33.7 
 
 		 195 aa  45.4  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1751  protein of unknown function DUF664  37.5 
 
 		 163 aa  45.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20480  Protein of unknown function (DUF664)  60 
 
 		 188 aa  45.1  0.0003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.247017  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2959  hypothetical protein  55.26 
 
 		 170 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299373 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6378  hypothetical protein  39.71 
 
 		 162 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.914652  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1314  hypothetical protein  38.16 
 
 		 191 aa  44.7  0.0004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0650172 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1048  hypothetical protein  60.53 
 
 		 187 aa  45.1  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.410023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3566  hypothetical protein  38.37 
 
 		 167 aa  44.7  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.527928 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1650  protein of unknown function DUF664  54.05 
 
 		 179 aa  45.1  0.0004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.939726  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0247  protein of unknown function DUF664  37.84 
 
 		 211 aa  44.7  0.0004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_02080  Protein of unknown function (DUF664)  55.56 
 
 		 180 aa  44.7  0.0005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5900  hypothetical protein  47.5 
 
 		 189 aa  44.3  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.575694 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0776  protein of unknown function DUF664  60.61 
 
 		 173 aa  43.9  0.0007  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0339  protein of unknown function DUF664  57.58 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3194  protein of unknown function DUF664  41.1 
 
 		 165 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.101119 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4006  protein of unknown function DUF664  37.65 
 
 		 189 aa  43.1  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7313  hypothetical protein  55.56 
 
 		 168 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0637  protein of unknown function DUF664  53.85 
 
 		 195 aa  42.7  0.001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1490  protein of unknown function DUF664  47.06 
 
 		 175 aa  43.1  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.165433  normal  0.138525 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8812  protein of unknown function DUF664  34.52 
 
 		 190 aa  43.1  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00338165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0958  hypothetical protein  56.41 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2169  protein of unknown function DUF664  59.38 
 
 		 187 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  hitchhiker  0.00138887 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0976  hypothetical protein  56.41 
 
 		 200 aa  42.4  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0645805 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1245  hypothetical protein  39.24 
 
 		 197 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.209232 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1183  hypothetical protein  52.94 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0476476  hitchhiker  0.00231818 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22750  Protein of unknown function (DUF664)  37.21 
 
 		 196 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0332  protein of unknown function DUF664  56.25 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0342  protein of unknown function DUF664  37.21 
 
 		 202 aa  42.7  0.002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0973615  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1196  hypothetical protein  48.65 
 
 		 174 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.974573  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5108  hypothetical protein  40.51 
 
 		 199 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.408791  normal  0.17293 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1293  hypothetical protein  48.57 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.315219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3244  hypothetical protein  38.46 
 
 		 170 aa  40.8  0.007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.062152  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0979  hypothetical protein  53.85 
 
 		 200 aa  40.4  0.008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3935  hypothetical protein  45 
 
 		 183 aa  40.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.53611  hitchhiker  0.00874096 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>